稳定结构搜索系统、稳定结构搜索方法及存储介质

    公开(公告)号:CN115458041A

    公开(公告)日:2022-12-09

    申请号:CN202210257723.4

    申请日:2022-03-16

    Abstract: 一种稳定结构搜索系统,包括:计算单元,其基于多种分子的每个相互作用势来获取多种分子中的每种分子与目标分子中包括的第一分子之间的多个结构相似度,获取多种分子中的每种分子与第一分子之间的多个电荷相似度,以及基于多个结构相似度中的每个结构相似度与多个电荷相似度中的每个电荷相似度的总和来获取多个总相似度;以及识别单元,其确定多种分子中总相似度最大的第二分子,基于第二分子的相互作用势来获取目标分子的分子结构的能量。

    结构搜索方法、结构搜索设备和计算机可读存储介质

    公开(公告)号:CN113764053A

    公开(公告)日:2021-12-07

    申请号:CN202110281398.0

    申请日:2021-03-16

    Abstract: 提供了结构搜索方法、结构搜索设备和计算机可读存储介质。搜索其中多个化合物残基键合在一起的化合物的稳定结构的结构搜索设备包括:存储器;以及耦接至存储器的处理器电路,该处理器电路被配置成执行处理,该处理包括:执行相互作用势识别处理,该相互作用势识别处理被配置成识别多个化合物残基之中的化合物残基x与化合物残基y之间的相互作用势;执行空间结构识别处理,该空间结构识别处理被配置成通过考虑由相互作用势识别处理识别的相互作用势在作为晶格点的集合的三维晶格空间中的晶格点处布置多个化合物残基,来识别在三维晶格空间中的化合物的空间结构;以及响应于所获得的识别结果,输出指示所识别的化合物的空间结构的识别结果。

    存储搜索程序的计算机可读记录介质及搜索设备与方法

    公开(公告)号:CN116798543A

    公开(公告)日:2023-09-22

    申请号:CN202310047146.0

    申请日:2023-01-16

    Abstract: 本公开涉及存储搜索程序的计算机可读记录介质及搜索设备与方法。一种存储搜索程序的非暂态计算机可读记录介质,该搜索程序用于使计算机执行包括以下的处理:获得与粗粒化粒子之间的相互作用对应的第一势的第一成本值、与粒子之间的角度和二面角对应的第二势的第二成本值以及与粒子之间的斥力和引力对应的第三势的第三成本值;以及指示伊辛设备搜索粗粒化模型的结构,利用该结构针对包括多个粒子的粗粒化模型的整体计算的第一成本值、第二成本值和第三成本值的总和满足预定条件。

    计算机可读记录介质、特征量计算方法和特征量计算装置

    公开(公告)号:CN116504332A

    公开(公告)日:2023-07-28

    申请号:CN202211260719.X

    申请日:2022-10-14

    Inventor: 寺岛千绘子

    Abstract: 涉及计算机可读记录介质、特征量计算方法和特征量计算装置。一种存储特征量计算程序的计算机可读记录介质,特征量计算程序使计算机执行处理,包括:接收结构指定信息,结构指定信息指示关于环状分子的原子团中的每个原子团的类型和原子团的序列,在环状分子中被分类成多个类型的原子团被循环按序排列;在多个类型中指定可选的第一类型和可选的第二类型;基于结构指定信息,从原子团中指定被分类为第一类型的第一原子团中的一个或更多个第一原子团和被分类为第二类型的第二原子团中的一个或更多个第二原子团;以及基于结构指定信息,计算第一原子团和第二原子团的对的数目,在所述对中第一原子团与第二原子团之间在序列中的相互距离是某距离。

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