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公开(公告)号:CN112725453B
公开(公告)日:2022-07-12
申请号:CN202110147153.9
申请日:2021-02-03
Applicant: 复旦大学附属肿瘤医院
IPC: C12Q1/6886 , C12N15/11
Abstract: 本发明涉及医学生物检测技术领域,提供了m5c修饰调节基因组在制备肿瘤预后评估试剂或试剂盒中的应用,其中,肿瘤为肺腺癌,该基因组包括NSUN2、NSUN5、DNMT1、DNMT3A、DNMT3B、TET2和ALYREF;进一步提供了预后评估试剂盒,由逆转录系统、引物系统和扩增系统组成;还提供了一种预后评估系统,包括预后评估试剂盒以及安装在终端载体上的m5c‑score模型,m5c‑score模型包括PCA分析模块、打分提取模块以及m5c‑score计算模块,PCA分析模块基于上述基因的表达量对每个基因进行分析;打分提取模块提取每个基因的PC1和PC2打分;m5c‑score计算模块计算样本的m5c‑score。
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公开(公告)号:CN112725453A
公开(公告)日:2021-04-30
申请号:CN202110147153.9
申请日:2021-02-03
Applicant: 复旦大学附属肿瘤医院
IPC: C12Q1/6886 , C12N15/11
Abstract: 本发明涉及医学生物检测技术领域,提供了m5c修饰调节基因组在制备肿瘤预后评估试剂或试剂盒中的应用,其中,肿瘤为肺腺癌,该基因组包括NSUN2、NSUN5、DNMT1、DNMT3A、DNMT3B、TET2和ALYREF;进一步提供了预后评估试剂盒,由逆转录系统、引物系统和扩增系统组成;还提供了一种预后评估系统,包括预后评估试剂盒以及安装在终端载体上的m5c‑score模型,m5c‑score模型包括PCA分析模块、打分提取模块以及m5c‑score计算模块,PCA分析模块基于上述基因的表达量对每个基因进行分析;打分提取模块提取每个基因的PC1和PC2打分;m5c‑score计算模块计算样本的m5c‑score。
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