一种基于宏基因组测序绝对定量病原体的方法和装置

    公开(公告)号:CN116555407A

    公开(公告)日:2023-08-08

    申请号:CN202310428808.9

    申请日:2023-04-20

    Abstract: 本发明提供了一种基于宏基因组测序绝对定量病原体的方法和装置。该方法包括:向待测样本中添加设定终浓度的内参:栖热菌属菌种或噬菌体,然后进行宏基因组测序获得内参检出序列数和病原检出序列数;通过以下公式计算待测样本中病原核酸浓度:CM=k×(CIC×LIC×NM)/(NIC×LM);其中,CM:病原浓度;CIC:内参浓度;LM:病原平均基因组长度;LIC:内参基因组长度;NM:病原检出序列数;NIC:内参检出序列数;k为常数,取值范围为0.1~20。本发明方法通过添加适量内参嗜热栖热菌或T1噬菌体改进宏基因组测序技术,测序所得的病原体序列数可根据定量公式进行计算,从而得知标本病原体浓度,可实现病原体绝对定量。

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