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公开(公告)号：CN113774074A
公开(公告)日：2021-12-10
申请号：CN202010507012.9
申请日：2020-06-05
Abstract: 本发明公开了一种基于肽段的靶向蛋白质组精确定量方法，设计了一系列包含亲和标签且具有相似理化性质的相同氨基酸长度的多肽序列，包括亲和标签序列、标记蛋白的特征氨基酸序列、蛋白酶的酶切位点。将编码这些序列的核苷酸序列添加到不同基因的开放阅读框的5’端或3’端表达后作为质谱检测的优化肽段进行蛋白定量。由于每个序列都包含同样的亲和标签，因此可以用相同的抗体对这些肽段进行富集，避免因抗体富集效率的差异造成的信号差异，并可以实现低浓度肽段的检测，从而在靶向蛋白质组学中实现蛋白的精确定量。
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公开(公告)号：CN112813153B
公开(公告)日：2022-10-18
申请号：CN202110060890.5
申请日：2021-01-18
Applicant: 复旦大学
IPC: C12Q1/6869 , G01N30/02 , G01N30/06
Abstract: 本发明公开了一种确定与目的蛋白互作的下游转录因子的方法及其应用，属于生物技术领域。本发明提供的方法通过BioID富集来源于目的蛋白表达体系的蛋白样本中生物素化的蛋白及与其交联的DNA片段，进而对富集的生物素化蛋白进行鉴定和定量，并结合ChIP‑Seq方法对富集的DNA片段进行测序、文库比对和丰度检测，最终筛选并确定出与目的蛋白互作的下游转录因子及其DNA结合序列，具有检测范围宽和准确可靠的优点，提供的方法可以用于科学研究和药物筛选等中。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN113640092A
公开(公告)日：2021-11-12
申请号：CN202010325021.6
申请日：2020-04-23
Applicant: 复旦大学
Abstract: 本发明公开了一种石蜡包埋组织样本的处理方法以及其质谱检测方法。本发明提供了一种处理方法，其包括以下步骤：步骤1：在十二烷基硫酸钠存在下，将石蜡包埋组织样本在裂解液中进行裂解，得到蛋白裂解液；步骤2：将步骤1中蛋白裂解液通过丙酮沉淀，得到蛋白固体；步骤3：在尿素存在下，将步骤2中的蛋白固体在缓冲液中进行溶解，得到蛋白溶液；步骤4：将步骤3得到的蛋白溶液进行FASP酶解和脱盐，得到肽段。本发明的方法可以高得率得获取肽段，且步骤少，通过进一步的质谱检测，即可获取石蜡包埋组织样本中的蛋白和肽段信息。
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公开(公告)号：CN113545780A
公开(公告)日：2021-10-26
申请号：CN202010329588.0
申请日：2020-04-23
Applicant: 复旦大学
IPC: A61B5/151
Abstract: 本发明公开了一种血液收集器及血液收集方法，血液收集器包括采集装置和储存装置，采集装置包括至少一个毛细管，毛细管的一端设有采血口，另一端设有穿刺口；储存装置包括有内部为负压状态的收集瓶，采集装置与储存装置可拆卸连接，且连接时使得穿刺口穿入收集瓶，毛细管内的血液被引入至收集瓶内。本发明提供的血液收集器及血液收集方法通过毛细管来采集微量血液并连通于收集瓶保存，解决了采取微量血液时无法进行保存和运输的问题，采集装置和储存装置相互套合移动使使用者可随时操作，另外，采集装置和储存装置卡合固定方便对其内部空间进行密封，还能通过卡合状态感知毛细管和收集瓶是否连通，同时能够防止两者分离，易于运输。
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公开(公告)号：CN116168839A
公开(公告)日：2023-05-26
申请号：CN202310317354.8
申请日：2023-03-27
Applicant: 复旦大学 , 光华临港工程应用技术研发(上海)有限公司
IPC: G16H50/30 , G16B20/10 , G16B20/20 , G16B20/50 , C12Q1/6886 , C12Q1/6869
Abstract: 本发明公开了一种中高分化食管鳞癌(ESCC)预后预测模型及其构建方法和应用，所述构建方法包括建立输入模块、建立分析模块以及建立输出模块，具体如本发明正文所述。本发明通过对食管鳞癌是否发生12q13.13扩增进行检测，用以对中高分化ESCC预后做预测。相较非12q13.13扩增的中高分化ESCC患者，12q13.13扩增的中高分化ESCC患者预后较差。本发明可以对中高分化食管鳞癌患者的诊断和预后评估提供一定的帮助。
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公开(公告)号：CN113551954A
公开(公告)日：2021-10-26
申请号：CN202010325114.9
申请日：2020-04-23
Applicant: 复旦大学
Abstract: 本发明公开了一种温和还原剂酶解组织样本的酶解方法及其质谱检测方法。本发明提供了一种裂解液，其包括：终浓度为质量分数1‑4％的去污剂；所述的去污剂为脱氧胆酸钠和/或碳酸氢铵；终浓度为5‑20μM的3‑(2‑羧基)膦盐酸盐；终浓度为20‑60mM的5‑氯‑邻氨基苯甲酸；终浓度为50‑200mM的三(羟甲基)氨基甲烷‑盐酸；终浓度为0.1‑2mM的苯甲基磺酰氟；和水。组织样本经本发明的裂解液裂解后，能高得率得到组织蛋白和肽段。
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公开(公告)号：CN112813153A
公开(公告)日：2021-05-18
申请号：CN202110060890.5
申请日：2021-01-18
Applicant: 复旦大学
IPC: C12Q1/6869 , G01N30/02 , G01N30/06
Abstract: 本发明公开了一种确定与目的蛋白互作的下游转录因子的方法及其应用，属于生物技术领域。本发明提供的方法通过BioID富集来源于目的蛋白表达体系的蛋白样本中生物素化的蛋白及与其交联的DNA片段，进而对富集的生物素化蛋白进行鉴定和定量，并结合ChIP‑Seq方法对富集的DNA片段进行测序、文库比对和丰度检测，最终筛选并确定出与目的蛋白互作的下游转录因子及其DNA结合序列，具有检测范围宽和准确可靠的优点，提供的方法可以用于科学研究和药物筛选等中。
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