公开(公告)号：CN112813153B

公开(公告)日：2022-10-18

申请号：CN202110060890.5

申请日：2021-01-18

Applicant: 复旦大学

Inventor： 丁琛 ,  田莎 ,  刘洋 ,  秦兆宇 ,  杨冰 ,  吴晓晖 ,  姚珍梅

IPC: C12Q1/6869 ,  G01N30/02 ,  G01N30/06

Abstract: 本发明公开了一种确定与目的蛋白互作的下游转录因子的方法及其应用，属于生物技术领域。本发明提供的方法通过BioID富集来源于目的蛋白表达体系的蛋白样本中生物素化的蛋白及与其交联的DNA片段，进而对富集的生物素化蛋白进行鉴定和定量，并结合ChIP‑Seq方法对富集的DNA片段进行测序、文库比对和丰度检测，最终筛选并确定出与目的蛋白互作的下游转录因子及其DNA结合序列，具有检测范围宽和准确可靠的优点，提供的方法可以用于科学研究和药物筛选等中。

公开(公告)号：CN112813153A

公开(公告)日：2021-05-18

申请号：CN202110060890.5

申请日：2021-01-18

Applicant: 复旦大学

Inventor： 丁琛 ,  田莎 ,  刘洋 ,  秦兆宇 ,  杨冰 ,  吴晓晖 ,  姚珍梅

IPC: C12Q1/6869 ,  G01N30/02 ,  G01N30/06

Abstract: 本发明公开了一种确定与目的蛋白互作的下游转录因子的方法及其应用，属于生物技术领域。本发明提供的方法通过BioID富集来源于目的蛋白表达体系的蛋白样本中生物素化的蛋白及与其交联的DNA片段，进而对富集的生物素化蛋白进行鉴定和定量，并结合ChIP‑Seq方法对富集的DNA片段进行测序、文库比对和丰度检测，最终筛选并确定出与目的蛋白互作的下游转录因子及其DNA结合序列，具有检测范围宽和准确可靠的优点，提供的方法可以用于科学研究和药物筛选等中。