一种从动态和静态蛋白质相互作用网络中挖掘蛋白质复合物的方法

    公开(公告)号:CN110517729A

    公开(公告)日:2019-11-29

    申请号:CN201910821860.4

    申请日:2019-09-02

    Applicant: 吉林大学

    Abstract: 本发明公开了一种从动态和静态蛋白质相互作用网络中挖掘蛋白质复合物的方法,包括:步骤一、构建具有权重的动态蛋白质相互作用网络和具有权重的静态蛋白质相互作用网络;步骤二、在具有权重的动态蛋白质相互作用网络和具有权重的静态蛋变质相互作用网络中,识别蛋白质复合物的核;步骤三、根据蛋白质复合物的核,在在具有权重的动态蛋白质相互作用网络和具有权重的静态蛋变质相互作用网络中,基于启发式搜索算法构建蛋白质复合物;步骤四、根据社区模型分数给蛋白质复合物进行打分,舍弃低于平均分的蛋白质复合物,进而得到高于平均分的蛋白质复合物;步骤五、在高于平均分的蛋白质复合物中,分别两两计算相似性,得到最终挖掘出的蛋白质复合物。

    一种从动态和静态蛋白质相互作用网络中挖掘蛋白质复合物的方法

    公开(公告)号:CN110517729B

    公开(公告)日:2021-05-04

    申请号:CN201910821860.4

    申请日:2019-09-02

    Applicant: 吉林大学

    Abstract: 本发明公开了一种从动态和静态蛋白质相互作用网络中挖掘蛋白质复合物的方法,包括:步骤一、构建具有权重的动态蛋白质相互作用网络和具有权重的静态蛋白质相互作用网络;步骤二、在具有权重的动态蛋白质相互作用网络和具有权重的静态蛋变质相互作用网络中,识别蛋白质复合物的核;步骤三、根据蛋白质复合物的核,在在具有权重的动态蛋白质相互作用网络和具有权重的静态蛋变质相互作用网络中,基于启发式搜索算法构建蛋白质复合物;步骤四、根据社区模型分数给蛋白质复合物进行打分,舍弃低于平均分的蛋白质复合物,进而得到高于平均分的蛋白质复合物;步骤五、在高于平均分的蛋白质复合物中,分别两两计算相似性,得到最终挖掘出的蛋白质复合物。

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