公开(公告)号：CN116377045A

公开(公告)日：2023-07-04

申请号：CN202310448198.9

申请日：2023-04-24

Applicant: 吉林大学

Inventor： 颜晓羽 ,  曲仙智 ,  苏静 ,  沈璐妍 ,  刘卜菡

IPC: C12Q1/6869 ,  C12Q1/6851 ,  C12Q1/02 ,  G01N33/68

Abstract: 本发明公开了一种肝细胞癌诊断治疗的应用方法，属于分子诊断治疗技术领域，分别利用常氧及1％氧气处理肝细胞癌细胞SNU‑387，每组设置3个样本进行tRFs测序；提取各组样本总RNA，进行纯化后获得1～2μgRNA并采用凝胶电泳进行质量分析；接着进行tRF预处理，去除m1A和m3C去甲基化等RNA修饰防止干扰RNA‑seq文库构建。本发明中聚焦缺氧(1％氧气)微环境，基于tRFs测序等技术发现缺氧诱导肝细胞癌细胞产生tRF‑3Thr‑CGT，核酸序列为：ACCCCGTCCGTGCCTCCA，体内外研究证明该tRF显著促进肝细胞癌侵袭转移；进一步机制研究发现tRF‑3Thr‑CGT能够通过靶向肽脱甲酰酶(PDF)抑制线粒体编码蛋白翻译，促进线粒体能量代谢重组。tRF‑3Thr‑CGT能够成为肝细胞癌新型诊断生物标志物和治疗靶点。