公开(公告)号：CN101812525A

公开(公告)日：2010-08-25

申请号：CN201010150139.6

申请日：2010-04-09

Applicant: 南通大学

Inventor： 陆璐 ,  王晓冬 ,  陈颖 ,  徐邦生 ,  陈雪 ,  王勇军 ,  谢晓玲

IPC: C12Q1/68

Abstract: 本发明公开了一种与AD发病相关的基因网络通路分析模型的建立方法，通过生物信息学方法，收集已知AD相关基因；借助B×D基因重组近交系小鼠的基因表达资料和基因型资料，进行遗传基因组学的分析，筛选出具有统计学意义的上游调控位点；进行cis-eQTL真实性验证、候选基因筛选验证；确定AD发病相关基因间的协同或调控关系，构建AD相关基因的基因表达调控网络通路。本发明方法简便，易操作，可以有效建立与AD发病相关的基因网络通路分析模型。

公开(公告)号：CN101818201A

公开(公告)日：2010-09-01

申请号：CN201010150142.8

申请日：2010-04-09

Applicant: 南通大学

Inventor： 陆璐 ,  陈颖

IPC: C12Q1/68

Abstract: 本发明公开了一种高效而准确地验证顺式作用基因表达数量性状基因座真实性的方法。综合生物信息学分析和分子生物学技术，逐步剔除假阳性cis-eQTL：剔除两亲本间表达差异无显著统计学基因的基因；剔除探针靶序列在B6和D2间存在多态性的基因；运用RT-PCR技术或ABA原位杂交分析的方法验证基因芯片资料的准确性；进行等位基因特异性表达分析，若两等位基因表达具有显著差异则认为是真性cis-eQTL。本发明可以高效而又准确的验证cis-eQTL真实性。

公开(公告)号：CN101812526A

公开(公告)日：2010-08-25

申请号：CN201010150140.9

申请日：2010-04-09

Applicant: 南通大学

Inventor： 陆璐 ,  沈勤 ,  王晓冬 ,  陈颖 ,  林巍巍 ,  李奕

IPC: C12Q1/68

Abstract: 本发明公开了一种与PD发病相关的基因网络通路分析模型的建立方法，包括下列步骤：收集PD发病相关基因，确定PD发病相关基因的上游调控位点，筛选上游调控位点候选基因，确定PD发病相关基因间的协同或调控关系，构建基因表达调控网络通路。本发明方法简便，易操作，可以有效建立与PD发病相关的基因网络通路分析模型。