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公开(公告)号：CN116129990A
公开(公告)日：2023-05-16
申请号：CN202310158923.9
申请日：2023-02-23
Applicant: 南方医科大学南方医院
Abstract: 本申请公开了基于促肌样周细胞标志物的肿瘤免疫治疗预测方法及系统，其中方法包括以下步骤：基于单细胞测序技术识别周细胞亚型，得到若干周细胞亚群；基于hallmark基因集和Metascape为若干周细胞亚群进行功能注释分析，得到功能信息；基于cibersortx探究若干周细胞亚群与肿瘤微环境的关系，得到微环境信息；基于功能信息和微环境信息对周细胞亚群的分子特征进行差异化分析，得到促肌样周细胞标志物，促肌样周细胞标志物的表达用于预测免疫治疗疗效。本申请通过单细胞测序技术识别周细胞，根据其表达模式的差异对周细胞进行详细分类，实现了对肿瘤内周细胞特征的全景式刻画，为靶向周细胞的肿瘤治疗奠定了理论基础。
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公开(公告)号：CN114606192A
公开(公告)日：2022-06-10
申请号：CN202210329096.0
申请日：2022-03-30
Applicant: 南方医科大学南方医院
Abstract: 本发明涉及肺组织的培养，具体涉及一种Kras/Lkb1突变型非小细胞肺癌类器官培养液及培养方法。所述专用培养液，包括DMEM/F‑12培养基、谷氨酰胺、HEPES缓冲液、青霉素/链霉素双抗、N2添加剂、N‑乙酰‑L‑胱氨酸、烟碱、转化生长因子βI型受体、MAPK信号通路抑制剂、Rho激酶抑制剂、重组人Noggin蛋白、重组人WNT信号通路激活剂、重组人成纤维细胞生长因子‑7、重组人成纤维细胞生长因子‑10、地塞米松、β‑巯基乙醇及liproxstatin‑1。培养液贴合了Lkb1突变型肿瘤的生物学特点，能够促进小鼠Kras/Lkb1突变型非小细胞肺癌类器官的体外生长并维持其基因特征。因此，通过本发明培养方法进行类器官的培养时成功率更高。
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公开(公告)号：CN117467766A
公开(公告)日：2024-01-30
申请号：CN202311445507.3
申请日：2023-11-02
Applicant: 南方医科大学南方医院
IPC: C12Q1/6886 , G01N21/64 , G01N21/84 , G01N1/30 , C07K14/515 , G01N33/68 , G01N33/574
Abstract: 本发明公开了一种预测肿瘤免疫治疗疗效的生物标志物及其应用，涉及生物医药技术领域。该生物标志物为肿瘤相关成纤维细胞的分泌型卷曲相关蛋白2。本发明从细胞亚群本身、与微环境的互作、空间分布特点等多维度系统性揭示肿瘤相关成纤维细胞分泌型卷曲相关蛋白2在肿瘤微环境中的功能，并证实肿瘤相关成纤维细胞的分泌型卷曲相关蛋白2，可以作为生物学标志物，有效预测肿瘤免疫治疗疗效，这对于临床肿瘤患者免疫治疗疗效的早期评估以及制定个体化的治疗方案，最终提高肿瘤患者的生存率具有重要的临床价值和意义。
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公开(公告)号：CN116206682B
公开(公告)日：2023-10-24
申请号：CN202310217562.0
申请日：2023-03-08
Applicant: 南方医科大学南方医院
Abstract: 本发明公开基于抗血管治疗显著改变共表达基因模块的肿瘤分型方法，包括：获取抗血管治疗队列数据并筛选抗血管治疗显著改变的基因、在TCGA数据库泛癌种基因表达谱进行加权共表达网络分析、分析基因模块的生物功能及其在抗血管治疗中发挥的作用以及根据筛选的基因模块对肿瘤进行与治疗疗效和预后有关的分型；本发明通过抗血管治疗队列数据整合分析抗血管治疗基因表达谱，提供肿瘤抗血管治疗中表达显著改变的基因，并通过加权共表达网络分析构建共表达基因模块，再对基因模块进行筛选，对患者肿瘤的分型，使该分型方法与肿瘤抗血管治疗反应性和预后有极强的相关性，有助于肿瘤抗血管治疗决策并提高对抗血管治疗肿瘤微环境改变和治疗耐药的理解。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN116206682A
公开(公告)日：2023-06-02
申请号：CN202310217562.0
申请日：2023-03-08
Applicant: 南方医科大学南方医院
Abstract: 本发明公开基于抗血管治疗显著改变共表达基因模块的肿瘤分型方法，包括：获取抗血管治疗队列数据并筛选抗血管治疗显著改变的基因、在TCGA数据库泛癌种基因表达谱进行加权共表达网络分析、分析基因模块的生物功能及其在抗血管治疗中发挥的作用以及根据筛选的基因模块对肿瘤进行与治疗疗效和预后有关的分型；本发明通过抗血管治疗队列数据整合分析抗血管治疗基因表达谱，提供肿瘤抗血管治疗中表达显著改变的基因，并通过加权共表达网络分析构建共表达基因模块，再对基因模块进行筛选，对患者肿瘤的分型，使该分型方法与肿瘤抗血管治疗反应性和预后有极强的相关性，有助于肿瘤抗血管治疗决策并提高对抗血管治疗肿瘤微环境改变和治疗耐药的理解。
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公开(公告)号：CN117467766B
公开(公告)日：2025-02-28
申请号：CN202311445507.3
申请日：2023-11-02
Applicant: 南方医科大学南方医院
IPC: C12Q1/6886 , G01N21/64 , G01N21/84 , G01N1/30 , C07K14/515 , G01N33/68 , G01N33/574
Abstract: 本发明公开了一种预测肿瘤免疫治疗疗效的生物标志物及其应用，涉及生物医药技术领域。该生物标志物为肿瘤相关成纤维细胞的分泌型卷曲相关蛋白2。本发明从细胞亚群本身、与微环境的互作、空间分布特点等多维度系统性揭示肿瘤相关成纤维细胞分泌型卷曲相关蛋白2在肿瘤微环境中的功能，并证实肿瘤相关成纤维细胞的分泌型卷曲相关蛋白2，可以作为生物学标志物，有效预测肿瘤免疫治疗疗效，这对于临床肿瘤患者免疫治疗疗效的早期评估以及制定个体化的治疗方案，最终提高肿瘤患者的生存率具有重要的临床价值和意义。
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公开(公告)号：CN116129990B
公开(公告)日：2024-04-09
申请号：CN202310158923.9
申请日：2023-02-23
Applicant: 南方医科大学南方医院
Abstract: 本申请公开了基于促肌样周细胞标志物的肿瘤免疫治疗预测方法及系统，其中方法包括以下步骤：基于单细胞测序技术识别周细胞亚型，得到若干周细胞亚群；基于hallmark基因集和Metascape为若干周细胞亚群进行功能注释分析，得到功能信息；基于cibersortx探究若干周细胞亚群与肿瘤微环境的关系，得到微环境信息；基于功能信息和微环境信息对周细胞亚群的分子特征进行差异化分析，得到促肌样周细胞标志物，促肌样周细胞标志物的表达用于预测免疫治疗疗效。本申请通过单细胞测序技术识别周细胞，根据其表达模式的差异对周细胞进行详细分类，实现了对肿瘤内周细胞特征的全景式刻画，为靶向周细胞的肿瘤治疗奠定了理论基础。
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公开(公告)号：CN114606192B
公开(公告)日：2023-08-08
申请号：CN202210329096.0
申请日：2022-03-30
Applicant: 南方医科大学南方医院
Abstract: 本发明涉及肺组织的培养，具体涉及一种Kras/Lkb1突变型非小细胞肺癌类器官培养液及培养方法。所述专用培养液，包括DMEM/F‑12培养基、谷氨酰胺、HEPES缓冲液、青霉素/链霉素双抗、N2添加剂、N‑乙酰‑L‑胱氨酸、烟碱、转化生长因子βI型受体、MAPK信号通路抑制剂、Rho激酶抑制剂、重组人Noggin蛋白、重组人WNT信号通路激活剂、重组人成纤维细胞生长因子‑7、重组人成纤维细胞生长因子‑10、地塞米松、β‑巯基乙醇及liproxstatin‑1。培养液贴合了Lkb1突变型肿瘤的生物学特点，能够促进小鼠Kras/Lkb1突变型非小细胞肺癌类器官的体外生长并维持其基因特征。因此，通过本发明培养方法进行类器官的培养时成功率更高。
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公开(公告)号：CN116434832A
公开(公告)日：2023-07-14
申请号：CN202310260957.9
申请日：2023-03-17
Applicant: 南方医科大学南方医院
Abstract: 本发明公开了一种量化肿瘤高内皮微静脉的基因集的构建方法及系统，包括以下步骤：收集肿瘤患者数据；基于所述肿瘤患者数据，注释出肿瘤组织中的内皮细胞；对所述内皮细胞进行分群,生成内皮细胞亚群；计算各内皮细胞亚群的差异表达基因，并注释出内皮细胞中的毛细血管后微静脉内皮细胞亚群；筛选出在毛细血管后微静脉内皮细胞相对高表达、且在肿瘤中其他类型的细胞中相对低表达的基因；进一步筛选出上一步保留基因中表达量与淋巴细胞丰度显著正相关的基因,构成基因集。本发明不仅可以用于表征肿瘤组织中高内皮微静脉的特点，还有助于筛选出免疫治疗的获益人群，使丰富的转录组数据得到更好的利用，具有重要的意义和临床应用价值。
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