公开(公告)号：CN116434832A

公开(公告)日：2023-07-14

申请号：CN202310260957.9

申请日：2023-03-17

Applicant: 南方医科大学南方医院

Inventor： 白雪 ,  杜坤恒 ,  张艳培 ,  郭泽钦 ,  董忠谊 ,  吴德华

IPC: G16B25/00 ,  G16B20/00

Abstract: 本发明公开了一种量化肿瘤高内皮微静脉的基因集的构建方法及系统，包括以下步骤：收集肿瘤患者数据；基于所述肿瘤患者数据，注释出肿瘤组织中的内皮细胞；对所述内皮细胞进行分群,生成内皮细胞亚群；计算各内皮细胞亚群的差异表达基因，并注释出内皮细胞中的毛细血管后微静脉内皮细胞亚群；筛选出在毛细血管后微静脉内皮细胞相对高表达、且在肿瘤中其他类型的细胞中相对低表达的基因；进一步筛选出上一步保留基因中表达量与淋巴细胞丰度显著正相关的基因,构成基因集。本发明不仅可以用于表征肿瘤组织中高内皮微静脉的特点，还有助于筛选出免疫治疗的获益人群，使丰富的转录组数据得到更好的利用，具有重要的意义和临床应用价值。

公开(公告)号：CN116434832B

公开(公告)日：2024-03-08

申请号：CN202310260957.9

申请日：2023-03-17

Applicant: 南方医科大学南方医院

Inventor： 白雪 ,  杜坤恒 ,  张艳培 ,  郭泽钦 ,  董忠谊 ,  吴德华

IPC: G16B25/00 ,  G16B20/00