公开(公告)号：CN110827916B

公开(公告)日：2021-12-14

申请号：CN201911021952.0

申请日：2019-10-24

Applicant: 南方医科大学南方医院

Inventor： 杨新平 ,  高玥 ,  梁小珍 ,  任重鲁 ,  李彦君 ,  迟雅丽

IPC: G16B20/00 ,  G16H20/70 ,  G16B50/00

Abstract: 本发明公开了一种精神分裂症基因‑基因互作网络的构建方法，所述构建方法包括以下步骤：①收集已知精神分裂症候选基因；②将上述收集的已知精神分裂症候选基因映射在人类蛋白质‑蛋白质互作网络，转换成以基因命名的相互作用网络；③对网络中的所有基因进行R‑score赋值，对网络中的所有基因进行G‑score赋值，对每条边赋予权重；④构造节点间最短路径矩阵；以“游走扩展”法提取初步网络；⑤提取最终网络，输出结果。本发明构建精神分裂症基因‑基因互作网络移除了部分假阳性基因，囊括进来了更多的与精神分裂症相关的潜在候选基因，富集分析结果表明，保留的基因与精神分裂症更相关，表明本发明构建的基因互作网络质量更优。

公开(公告)号：CN110827916A

公开(公告)日：2020-02-21

申请号：CN201911021952.0

申请日：2019-10-24

Applicant: 南方医科大学南方医院

Inventor： 杨新平 ,  高玥 ,  梁小珍 ,  任重鲁 ,  李彦君 ,  迟雅丽

IPC: G16B20/00 ,  G16H20/70 ,  G16B50/00

Abstract: 本发明公开了一种精神分裂症基因-基因互作网络的构建方法，所述构建方法包括以下步骤：①收集已知精神分裂症候选基因；②将上述收集的已知精神分裂症候选基因映射在人类蛋白质-蛋白质互作网络，转换成以基因命名的相互作用网络；③对网络中的所有基因进行R-score赋值，对网络中的所有基因进行G-score赋值，对每条边赋予权重；④构造节点间最短路径矩阵；以“游走扩展”法提取初步网络；⑤提取最终网络，输出结果。本发明构建精神分裂症基因-基因互作网络移除了部分假阳性基因，囊括进来了更多的与精神分裂症相关的潜在候选基因，富集分析结果表明，保留的基因与精神分裂症更相关，表明本发明构建的基因互作网络质量更优。