公开(公告)号：CN112877408A

公开(公告)日：2021-06-01

申请号：CN202011600280.1

申请日：2020-12-30

Applicant: 南开大学

Inventor： 郗日沫 ,  王倍 ,  甘奇 ,  孟萌 ,  佟悦 ,  乔岩旗

IPC: C12Q1/6844 ,  C12Q1/689 ,  C12N15/11 ,  C12R1/01

Abstract: 本发明创造提供了一种用环介导等温扩增检测幽门螺杆菌毒力基因类型的方法和试剂盒。通过查阅文献筛选了7种毒力基因类型进行检测，其中针对cagA、vacA s2、vacA m1、vacA m2、iceA1、iceA2、babA2、oipA、dupA、luxS设计了5条引物，针对vacA s1设计了6条引物进行检测。这种检测方法具有特异性强，操作简便，成本低，反应时间短的优点，不需要昂贵的反应仪器，可以在水浴锅或金属浴中完成反应，并且反应完成后无需电泳等后续检测手段，直接通过肉眼便能观察反应结果。本发明首次将幽门螺杆菌的毒力基因进行一系列完整的检测，针对不同的毒力基因设计出相应的LAMP引物并进行筛选。

公开(公告)号：CN112760391A

公开(公告)日：2021-05-07

申请号：CN202010994688.5

申请日：2020-09-21

Applicant: 南开大学

Inventor： 郗日沫 ,  佟悦 ,  王倍 ,  王朔 ,  甘奇 ,  张瑞肖

IPC: C12Q1/689 ,  C12Q1/6858 ,  C12Q1/04 ,  C12N15/11

Abstract: 由于胃活检样本内窥镜取样困难、成本高，幽门螺杆菌(Hp)生长条件苛刻难以培养，Hp耐药性的侵入性诊断方法并不理想。本发明提供一种非侵入性幽门螺杆菌耐药性检测的分子诊断方法，采用巢氏PCR技术结合测序技术对粪便样本进行快速检测与解析，利用核苷酸序列如表2及表3所示的引物联合检测23SrRNA，gyrA,PBP1,16SrRNA,porD,oorD，rpoB等7种耐药基因的52个位点的突变及rdxA耐药基因的随机突变，进而对目前临床常用7种抗生素耐药情况进行判定。本发明属于生物技术领域，快速灵敏，适合临床应用，在指导幽门螺杆菌患者的个性化诊疗根除方面有较大应用前景。

公开(公告)号：CN111518932A

公开(公告)日：2020-08-11

申请号：CN202010403416.3

申请日：2020-05-13

Applicant: 南开大学

Inventor： 郗日沫 ,  佟悦 ,  刘杨 ,  王倍 ,  张瑞肖

IPC: C12Q1/689 ,  C12Q1/6848 ,  C12Q1/04 ,  C12N15/11 ,  C12R1/01

Abstract: 本发明创造涉及一种以粪便为样本检测和判定幽门螺旋杆菌耐药性的诊断方法及试剂盒，本方法仅需简单的直接对患者粪便样本进行全基因组提取，即可进行下游PCR反应；利用巢氏PCR技术将这些待测片段实现扩增，结合一代测序即可获得幽门螺杆菌耐药情况。该方法设计合理、操作流程简单、检测结果快速、准确，可以满足不同临床和科研的检测需求，有利于指导临床幽门螺杆菌的根除，为幽门螺杆菌的感染治疗提供分子基础。

公开(公告)号：CN113564270A

公开(公告)日：2021-10-29

申请号：CN202110888685.8

申请日：2021-08-02

Applicant: 南开大学

Inventor： 郗日沫 ,  王倍 ,  孟萌 ,  佟悦 ,  甘奇

IPC: C12Q1/689 ,  C12Q1/6844 ,  C12Q1/04 ,  C12N15/11 ,  C12R1/01

Abstract: 本发明创造提供了一种使用环介导等温扩增技术检测幽门螺杆菌感染的方法和试剂盒。所用引物进行了特异性和灵敏性实验，结果表明该引物特异性良好，灵敏性高，本研究用探针法Q‑PCR和LAMP两种方法进行鉴定，通过SPSS统计学软件分析，P

公开(公告)号：CN111705148A

公开(公告)日：2020-09-25

申请号：CN202010588092.5

申请日：2020-06-24

Applicant: 南开大学

Inventor： 郗日沫 ,  佟悦 ,  王倍 ,  王朔 ,  张瑞肖 ,  杨坤

IPC: C12Q1/689 ,  C12Q1/6848

Abstract: 本发明创造涉及一种检测和判定胃活检样本中幽门螺杆菌耐药性的诊断方法和试剂盒，本方法仅需简单的直接对患者活检样本进行全基因组提取，即可进行下游PCR反应。采用核苷酸序列如图2、3所示的23对引物联合检测23SrRNA、gyrA、PBP1、16SrRNA、porD、oorD、rpoB及rdxA 8种耐药基因的常见突变位点的101个突变型和宿主药物代谢酶CYP2C19基因的两个突变型，对目前临床常用7种抗生素耐药基因和药物代谢酶基因的突变情况通过巢式PCR技术结合测序技术进行快速检测与准确解析，特异性与准确性较高，此诊断方法相较传统药敏培养实验，检测更为快速灵敏，更适合于临床应用，在指导幽门螺杆菌阳性患者的个性化诊疗方面有较大临床应用前景。