公开(公告)号：CN115295084A

公开(公告)日：2022-11-04

申请号：CN202210939709.2

申请日：2022-08-05

Applicant: 南开大学

Inventor： 刘健 ,  向文婷 ,  周炜均

IPC: G16B45/00 ,  G16B30/00

Abstract: 本发明涉及免疫组库数据分析技术领域，具体公开了一种肿瘤新抗原免疫组库数据可视化分析方法和系统，所述方法包括：获取肿瘤新抗原免疫组库测序数据；根据所述测序数据提取免疫组库信息，所述免疫组库信息包括CDR3序列；基于所述CDR3序列对现有数据库进行查询，确定肿瘤新抗原免疫组库中经验证的新抗原信息；针对所述免疫组库信息进行可视化分析。本发明针对肿瘤新抗原免疫组库数据，解决了复杂度高、具有特异性的问题，实现了新抗原信息的筛选和可视化分析。

公开(公告)号：CN116403639A

公开(公告)日：2023-07-07

申请号：CN202310331805.3

申请日：2023-03-30

Applicant: 南开大学

Inventor： 刘健 ,  张金宏 ,  周炜均

IPC: G16B15/30 ,  G16B40/00 ,  G16B20/30 ,  G16B30/10

Abstract: 本发明公开了一种基于深度学习的新抗原序列生成方法及系统，该方法包括：获取原始新抗原数据；对原始新抗原数据进行预处理，获取原始新抗原序列及其对应的HLA序列；根据原始新抗原序列及其对应的HLA序列，对原始新抗原序列进行突变，并对原始新抗原序列在序列空间中进行蒙特卡洛搜索，确定符合设计目标的突变后的新抗原序列；通过分子对接、递呈能力预测和免疫能力预测进行突变后的新抗原序列的筛选，获取最终的新抗原序列。本发明基于深度学习的方法生成全新的新抗原，并对生成的新抗原序列进行筛选，使得最终获取的新抗原具有更优的亲和力和免疫能力。