公开(公告)号：CN107862173A

公开(公告)日：2018-03-30

申请号：CN201711129689.8

申请日：2017-11-15

Applicant: 南京邮电大学

Inventor： 吴建盛 ,  朱文勇 ,  张邱鸣 ,  姜烨 ,  孙顾威

IPC: G06F19/00

CPC classification number: G06F19/707 ,  G06F19/704 ,  G06F19/705

Abstract: 本发明公开了一种先导化合物虚拟筛选方法和装置。包括先导化合物在药物靶标上的分子指纹的生成和先导化合物与药物靶标相互作用的生物活性的预测。分子指纹生成包括基于模块单元的分子指纹、加权分子指纹和生物活性三个部分。生物活性预测是利用配体分子指纹和生物活性值作为随机森林回归模型的输入，构建了预测模型。另外，本发明的装置包括基于配体的虚拟筛选的通用工具、先导化合物与药物靶标作用的生物活性的预测工具和先导化合物在药物靶标上的分子指纹的生成工具。目前用于生物活性预测、性能优越的分子指纹往往长度较大，而本发明设计的深度学习算法可以生成短的、性能好的分子指纹，得到最好的药物靶标配体的生物活性预测模型。

公开(公告)号：CN107862173B

公开(公告)日：2021-04-27

申请号：CN201711129689.8

申请日：2017-11-15

Applicant: 南京邮电大学

Inventor： 吴建盛 ,  朱文勇 ,  张邱鸣 ,  姜烨 ,  孙顾威

IPC: G16C20/70 ,  G16C20/30

Abstract: 本发明公开了一种先导化合物虚拟筛选方法和装置。包括先导化合物在药物靶标上的分子指纹的生成和先导化合物与药物靶标相互作用的生物活性的预测。分子指纹生成包括基于模块单元的分子指纹、加权分子指纹和生物活性三个部分。生物活性预测是利用配体分子指纹和生物活性值作为随机森林回归模型的输入，构建了预测模型。另外，本发明的装置包括基于配体的虚拟筛选的通用工具、先导化合物与药物靶标作用的生物活性的预测工具和先导化合物在药物靶标上的分子指纹的生成工具。目前用于生物活性预测、性能优越的分子指纹往往长度较大，而本发明设计的深度学习算法可以生成短的、性能好的分子指纹，得到最好的药物靶标配体的生物活性预测模型。