一种基于16S rDNA全长高通量测序检测根际细菌群落的方法

    公开(公告)号:CN112251503A

    公开(公告)日:2021-01-22

    申请号:CN202010185817.6

    申请日:2020-03-17

    Applicant: 南京大学

    Abstract: 本发明是一种基于16S rDNA全长高通量测序检测根际细菌群落的方法,由以下步骤构成:1.采集不同基因型植物在各发育时期的根区外土壤(作为系统对照)及根际土壤;2.从各样品土壤中提取微生物总DNA;3.用双标签引物法做PCR扩增上述总DNA中16S rDNA全长片段以构建文库;4.对合格文库用PacBio Sequel II平台进行CCS模式测序;5.得到纯净的成对READS后拼接,每样品产出至少1万条有效TAG用于聚类成可操作分类单元;6.据系统对照,准确测定各样品根际土壤细菌群落组成、结构、多样性、相对丰度显著性分析,并比较不同植物之间的异同。

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