一种用于鉴别近缘微生物的核苷酸片段的筛选方法

    公开(公告)号:CN109266768A

    公开(公告)日:2019-01-25

    申请号:CN201811373222.2

    申请日:2018-11-19

    Abstract: 本发明公开了一种用于鉴别近缘微生物的核苷酸片段的筛选方法,该方法是将目标微生物的全基因序列利用电子剪切技术剪切成含重叠区的核酸小片段;核酸小片段的fasta文件在NCBI NT数据库中比对;得到命中表Ⅰ,删除重复序列,进而获得命中核酸序列;命中核酸序列Ⅰ与含重叠区的核酸小片段进行比对,获得非命中核酸序列;重复上述步骤一次,设计PCR引物,提取目标微生物菌株所在属或近缘属的菌株10种以上的基因组总DNA,构建核酸池,PCR扩增验证。本发明提供的用于近缘菌株鉴别的特异性核酸筛选方法能够高效率地大量获得目的微生物菌株的特异性核酸序列,实验结果的可重现性极高,简化了整个实验过程,具有良好的适用性。

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