公开(公告)号：CN118096488A

公开(公告)日：2024-05-28

申请号：CN202311504438.9

申请日：2023-11-13

Applicant: 华中科技大学

Inventor： 全廷伟 ,  瞿旭中 ,  李诗玮 ,  李聪 ,  曾绍群

IPC: G06T1/20 ,  G06T1/60 ,  G06F9/50

Abstract: 本发明公开了适用于生物医学图像的批量读写方法及大数据制作方法，属于生物医学图像处理领域，包括：图像数据读取步骤：创建相关线程；确定硬盘中待读取的一个或多个小区域作为目标区域，同时，使解码任务分配线程在内存中创建图像空间并划分解码子任务；利用多个数据读取线程依次连续读取目标区域，同时使多个解码线程并行地获取并执行解码子任务；依次连续读取包括：当前数据读取线程完成当前目标区域的读取后，另一个数据读取线程即开始下一个目标区域的读取；执行解码子任务包括：在对应图像块被读取到内存后将其解码到图像空间中，在解码子任务处理完成后，获取下一个解码子任务。本发明能够有效提升生物医学图像大数据的读写效率。

公开(公告)号：CN115982099A

公开(公告)日：2023-04-18

申请号：CN202211699990.3

申请日：2022-12-28

Applicant: 华中科技大学

Inventor： 全廷伟 ,  瞿旭中 ,  李诗玮 ,  李聪 ,  曾绍群

IPC: G06F16/11 ,  G06F16/174 ,  G06T7/10

Abstract: 本发明属于生物医学领域，具体涉及一种TB级生物医学三维图像数据的大数据格式归档方法，包括：计算TB级图像序列切片信息，将图像序列划分为若干个三维局部块；采用串行读并行解码的方式快速读取三维局部块；对每个三维局部块切块，得到若干个三维小块；利用三维小块z轴连续变化的信息，对每个三维小块进行压缩；将压缩数据连续写入对应容器中，得到0级大数据格式数据；再对局部块下采样，压缩，连续写入到对应1级大数据格式容器中；相同的方式得到2级大数据格式的数据。本发明直接快速读取局部块，利用z轴连续信息压缩制作TB级生物医学三维图像大数据格式，具有低成本、实用性强、操作简便等优点，且可并行计算，进一步加速归档。