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公开(公告)号:CN109097486A
公开(公告)日:2018-12-28
申请号:CN201810838974.5
申请日:2018-07-27
Applicant: 华中科技大学 , 陕西省杂交油菜研究中心
IPC: C12Q1/6895 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了油菜种子组织部位特异性的含油量基因位点及其应用,属于分子生物学及遗传育种技术领域。本发明中油菜种子外子叶含油量基因位点紧密连锁的探针标记序列为SEQ ID No:1或SEQ ID No:2,内子叶含油量基因位点紧密连锁的探针标记序列为SEQ ID No:3或SEQ ID No:4,种皮含油量基因位点紧密连锁的引物序列为SEQ ID No:5和SEQ ID No:6所示,胚轴含油量基因位点紧密连锁的引物序列为SEQ ID No:7所示。以上这些组织特异性基因位点为通过分子辅助育种提高油菜含油量提供了新位点。
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公开(公告)号:CN117821637A
公开(公告)日:2024-04-05
申请号:CN202311761617.0
申请日:2023-12-20
Applicant: 华中科技大学
IPC: C12Q1/6895 , C12N15/11
Abstract: 本发明属于基因组学及遗传育种技术领域,公开了一种油菜种子耐贮藏的QTL位点及其紧密连锁的分子标记,其中能够控制油菜种子耐贮藏性的QTL位点为cqGI‑C3‑2、cqGP‑C8‑1、cqGP‑C8‑2、cqGR‑C6‑2、cqGT‑A3‑1、cqGT‑A3‑2中的任意一者:cqGI‑C3‑2位于甘蓝型油菜C03染色体上的183.9cM‑184.4cM区间;cqGP‑C8‑1位于甘蓝型油菜C08染色体上的94.3cM‑97.1cM区间;cqGP‑C8‑2位于甘蓝型油菜C08染色体上的102.2cM‑105.2cM区间;cqGR‑C6‑2位于甘蓝型油菜C06染色体上的62.5cM‑63.4cM区间;cqGT‑A3‑1位于甘蓝型油菜A03染色体上的105cM‑106.3cM区间;cqGT‑A3‑2位于甘蓝型油菜A03染色体上的113cM‑114.1cM区间。本发明首次报道了油菜种子耐贮藏的数量性状位点及其连锁的分子标记。
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公开(公告)号:CN118072826A
公开(公告)日:2024-05-24
申请号:CN202311783780.7
申请日:2023-12-21
Applicant: 华中科技大学
Abstract: 本发明属于基因工程技术领域,具体涉及一种用于PCR扩增基因组序列的引物设计方法,包括:确定目标序列位于其所在靶基因的链;将该链与上述目标序列所属基因组进行序列比对,从基因组中确定与该链相似性达到预设阈值的所有链;根据每条链的序列信息,在该链所属染色体上截取一段包含该链的染色体DNA序列;若只有一条链,则在该链对应的染色体DNA序列上寻找一个包含目标序列的序列,在此序列的目标序列上下游区域设计引物;否则,对所有链对应的染色体DNA序列进行同源序列比对,在每个染色体DNA序列上确定在目标序列的位置上下游的一个错配区域并在该区域设计引物;基于在每个错配区域设计的引物,进行PCR实验以扩增目标序列。本发明方法步骤简单、高效。
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公开(公告)号:CN109326322B
公开(公告)日:2020-12-08
申请号:CN201810941465.5
申请日:2018-08-17
Applicant: 华中科技大学
Abstract: 本发明提供了一种作物不同分离群体间QTL比较的方法及系统,属于生物信息学领域。该方法包括:构建遗传标记数据库、构建查询目标、匹配分子标记序列、将匹配的分子标记序列进行基因组定位以及剔除假阳性结果后确定目标性状QTL对应的基因组区域,最后实现不同群体间目标性状QTL的比较。该系统包括:遗传标记数据库模块、查询目标模块、匹配分子标记序列模块、基因组定位模块和确定目标性状QTL对应的基因组区域模块。本发明构建了遗传标记数据库,可以快速完成基因组位置信息获取,实现标记在基因组中位置的自动筛查。
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公开(公告)号:CN109326322A
公开(公告)日:2019-02-12
申请号:CN201810941465.5
申请日:2018-08-17
Applicant: 华中科技大学
Abstract: 本发明提供了一种作物不同分离群体间QTL比较的方法及系统,属于生物信息学领域。该方法包括:构建遗传标记数据库、构建查询目标、匹配分子标记序列、将匹配的分子标记序列进行基因组定位以及剔除假阳性结果后确定目标性状QTL对应的基因组区域,最后实现不同群体间目标性状QTL的比较。该系统包括:遗传标记数据库模块、查询目标模块、匹配分子标记序列模块、基因组定位模块和确定目标性状QTL对应的基因组区域模块。本发明构建了遗传标记数据库,可以快速完成基因组位置信息获取,实现标记在基因组中位置的自动筛查。
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公开(公告)号:CN119307642A
公开(公告)日:2025-01-14
申请号:CN202411575290.2
申请日:2024-11-06
Applicant: 中国农业科学院油料作物研究所 , 华中科技大学
IPC: C12Q1/6895 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种利用测序技术检测油菜花粉突变的方法,属于油菜分子生物学技术领域。该方法包括以下步骤:(1)以突变体油菜为花粉供体,在田间以突变体油菜为中心,四周种植野生型油菜,让其自由授粉;(2)油菜成熟期分别在不同方向、不同距离收取野生型油菜种子,每个样点的样品进行发芽,并混合后提取DNA;(3)利用突变体油菜突变基因定点测序引物开展定点测序;(4)利用分析软件分析突变基因占比,计算花粉漂移频率。本发明利用定点测序技术和油菜突变体技术对油菜花粉漂移距离和频率进行检测,可直接在不同距离取混合样后提取DNA进行定点测序,根据测序检测突变体频率来确定外源花粉漂移造成杂交的频率。
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公开(公告)号:CN117512083A
公开(公告)日:2024-02-06
申请号:CN202311620897.3
申请日:2023-11-30
Applicant: 华中科技大学
IPC: C12Q1/6869 , C12Q1/686
Abstract: 本发明公开了一种生物样本的批量化DNA测序方法及应用,属于基因测序技术领域,包括:为每一个生物样本均分配一个对应的标引序列对,记为第一标引序列和第二标引序列;各生物样本所对应的标引序列对均不相同;在每一个生物样本溶液中加入携带有第一标引序列的正向引物和携带有第二标引序列的反向引物,并进行PCR扩增操作;将扩增后的各生物样本的扩增子混合后,进行高通量测序,得到高通量测序数据;提取高通量测序数据中各DNA序列中的标引序列对;当某一DNA序列中的标引序列对为某一生物样本所对应的标引序列对时,则判定该DNA序列属于该生物样本,从而得到各生物样本的DNA序列;本发明能够对不同生物样本进行高效快速准确地DNA测序。
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公开(公告)号:CN115786370A
公开(公告)日:2023-03-14
申请号:CN202211199749.4
申请日:2022-09-29
Applicant: 华中科技大学
Abstract: 本发明属于植物基因工程领域,公开了一种促进植物种子超长链脂肪酸积累的基因的应用,其中,基因片段具有如SEQ ID No.1~SEQ ID No.5任意一条所示的核苷酸序列或其互补序列,或者是与这些核苷酸序列同源性不小于95%、且功能相同的衍生核苷酸序列;超长链脂肪酸的碳链碳数大于18,基因片段能够提升植物种子磷脂酰胆碱(PC)和/或磷脂酰乙醇胺(PE)中超长链脂肪酸的占比。本发明通过使用十字花科植物来源的LPAT2基因(核苷酸序列例如如同SEQ ID No.1~SEQ ID No.5所示),能够提高植物种子超长链脂肪酸在磷脂酰胆碱和磷脂酰乙醇胺中的百分含量,克服了当前领域内遇到的技术瓶颈。
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公开(公告)号:CN109060862A
公开(公告)日:2018-12-21
申请号:CN201810838991.9
申请日:2018-07-27
Applicant: 华中科技大学 , 陕西省杂交油菜研究中心
Abstract: 本发明公开了一种种子特异性部位油脂含量检测方法及其QTL位点鉴定方法,属于作物遗传育种技术领域。本发明所述方法为利用核磁共振油脂三维无损定量成像技术对种子不同组织部位进行表型分型并获取表型数据。结合高密度的遗传连锁图谱和油料作物定位群体种子不同组织部位油脂含量表型数据进行QTL位点的扫描分析,并对种子特异性组织部位油脂含量进行QTL位点鉴定。本发明可以高效且大批量的检测油料作物种子的不同组织部位油脂含量并进行表型分型和油料作物种子不同组织部位的QTL位点,为后续利用种子内部组织部位较高油脂含量油料作物品系进行精准化基因聚合育种提供理论支持。
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