CmEF1α基因和CmRAN基因在甜瓜果实基因表达分析中作为内参基因的应用

    公开(公告)号:CN104357564B

    公开(公告)日:2016-08-24

    申请号:CN201410608798.8

    申请日:2014-10-31

    Abstract: 本发明属于基因表达分析技术领域,公开了CmEF1α基因和CmRAN基因在分析甜瓜果实的基因表达时作为内参基因的应用,所述CmEF1α基因的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示,所述CmRAN基因的核苷酸序列如SEQ ID NO:2所示。本发明还公开了一种采用实时荧光定量PCR分析甜瓜果实基因表达的方法,它是将CmEF1α基因和CmRAN基因组合的几何平均数作为甜瓜果实基因表达分析中的内参基因。CmEF1α基因和CmRAN基因在不同坐果方式的甜瓜果实的不同发育阶段均能稳定表达,是甜瓜果实发育过程中利用实时荧光定量PCR技术检测基因表达分析的可靠内参基因组合。

    一种西瓜基因表达的实时荧光定量PCR分析方法

    公开(公告)号:CN104694631A

    公开(公告)日:2015-06-10

    申请号:CN201510060706.1

    申请日:2015-02-05

    CPC classification number: C12Q1/6895 C12Q1/6848 C12Q2600/158 C12Q2531/113

    Abstract: 本发明公开了一种西瓜基因表达实时荧光定量PCR分析方法,属于基因表达分析技术领域。本发明根据目标基因的结构信息,将目标基因的正向或反向引物的结合位点特异地设计在相邻外显子的接头处,使之在cDNA模板上能扩增出目标片段,而在基因组DNA模板上无扩增产物,然后用该引物进行目标基因表达的实时荧光定量PCR分析。该引物设计方法可以排除cDNA样本中存在基因组DNA的污染时对基因表达结果的影响,使利用实时荧光定量PCR技术获得西瓜基因表达的数据更准确。本发明不仅使用范围广,而且能节约实验成本,具有很大的实用性。

    ClCAC基因和ClSAND基因在西瓜果实基因表达分析中作为内参基因的应用

    公开(公告)号:CN104342438A

    公开(公告)日:2015-02-11

    申请号:CN201410510145.6

    申请日:2014-09-28

    Abstract: 本发明属于基因表达分析技术领域,具体涉及ClCAC基因和ClSAND基因在西瓜果实发育过程中用作为基因表达分析的内参基因的应用。本发明为ClCAC和ClSAND基因设计了特异引物,该引物跨基因上相邻的2个外显子的接头位点,以基因组DNA为模板时无扩增产物,以cDNA为模板是可以扩增出目标片段,所述引物的核苷酸序列如SEQ ID No.1-4所示。通过实时荧光定量PCR技术检测表明,ClCAC基因和ClSAND基因在不同基因型、不同坐果方式的西瓜果实的不同发育阶段均能稳定表达,是西瓜果实发育过程中利用实时荧光定量PCR技术检测基因表达分析的可靠内参基因组合。该内参基因组合具有表达稳定性好、不受cDNA样品中是否存在基因组DNA污染影响等优点。

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