玉米的SNP芯片及应用
    1.
    发明公开

    公开(公告)号:CN118043485A

    公开(公告)日:2024-05-14

    申请号:CN202480000092.5

    申请日:2024-01-15

    Abstract: 实施例公开了玉米的SNP芯片及应用。该SNP芯片包括固定有分别针对SNP1~SNP5061标记的探针组合,所述探针组合包括如SEQ ID NO.1~5061条探针。该SNP芯片包含了玉米所特有的SNP位点,具有更高的基因组覆盖率和更低的位点缺失率。此外,一些与玉米重要农艺性状和划分玉米杂种优势群相关位点的加入,使得这款芯片非常适合应用于种质资源指纹图谱分析、杂种优势群划分以及分子育种中的分子标记辅助选择。

    一种大田作物基因数据预测方法、装置、电子设备及介质

    公开(公告)号:CN118800321A

    公开(公告)日:2024-10-18

    申请号:CN202410929565.1

    申请日:2024-07-11

    Abstract: 本发明涉及一种大田作物基因数据预测方法、装置、电子设备及介质,其先根据VCF文件中的SNP位点,在参考基因组对应位置上各取前后2bp的碱基信息,再按位置顺序拼成序列。再将原始基因序列划分为多个基因单词,得到基因单词序列,然后建立二维编码矩阵,再对环境气候因素进行编码并建立嵌入层及预测神经网络模型,最后输入二维编码矩阵至神经网络模型,得到预测结果。相比于现有技术,本发明使编码保留了基因单词之间的相互关系信息,同时能够有效减少编码后数据的输入维度,此外,本发明还基于环境气候因素建立嵌入层,进而结合嵌入层建立预测神经网络模型,解决了现有技术背景下从基因型预测大田作物表型数据的方法精度和效率较低的问题。

    一株多杀性巴氏杆菌及其应用

    公开(公告)号:CN113801812A

    公开(公告)日:2021-12-17

    申请号:CN202111027185.1

    申请日:2021-09-02

    Abstract: 本发明公开了一株多杀性巴氏杆菌(Pasteurella multocida)Pm A‑HG,保藏在中国典型培养物保藏中心,保藏编号CCTCC NO:M 2021805。本发明还公开了该菌株在制备牛多杀性巴氏杆菌疫苗中的应用,属于疫苗微生物领域。本发明从多杀性巴氏杆菌A型临床分离株中筛选出一株毒力很强的制苗菌株,接着将其分别与多种佐剂配合,筛选出一种能大幅提高血清抗体水平和免疫保护力的佐剂,最后制成灭活疫苗,通过免疫小鼠探明了该疫苗在A型和F型之间存在交叉保护,从而为多杀性巴氏杆菌所致疾病的临床防控提供了更好的依据。

    杂交种亲本基因型的检测方法、装置、电子设备及介质

    公开(公告)号:CN118098348A

    公开(公告)日:2024-05-28

    申请号:CN202410093508.4

    申请日:2024-01-23

    Abstract: 本申请公开了杂交种亲本基因型的检测方法、装置、电子设备及介质。该检测方法包括获得杂交种的第一基因组数据;将第一基因组数据比对至参考基因组并对比对结果进行处理得到第二基因组数据;提取第二基因组数据中所述变异位点数据;根据变异位点数据判断杂交种亲本基因型。利用杂交种子胚乳的测序数据,通过生物信息学分析,直接推测出测序位点的亲本基因型,它克服了传统方法的一系列局限性,实现了对亲本基因型的直接推测,弥补了现有技术不能直接由杂交种溯源亲本的缺陷。

    杂交种亲本基因型的检测方法、装置、电子设备及介质

    公开(公告)号:CN118098348B

    公开(公告)日:2024-08-06

    申请号:CN202410093508.4

    申请日:2024-01-23

    Abstract: 本申请公开了杂交种亲本基因型的检测方法、装置、电子设备及介质。该检测方法包括获得杂交种的第一基因组数据;将第一基因组数据比对至参考基因组并对比对结果进行处理得到第二基因组数据;提取第二基因组数据中所述变异位点数据;根据变异位点数据判断杂交种亲本基因型。利用杂交种子胚乳的测序数据,通过生物信息学分析,直接推测出测序位点的亲本基因型,它克服了传统方法的一系列局限性,实现了对亲本基因型的直接推测,弥补了现有技术不能直接由杂交种溯源亲本的缺陷。

    一种溶血性曼氏杆菌A6血清型白细胞毒素抗原蛋白、其抗体及应用

    公开(公告)号:CN115960184B

    公开(公告)日:2023-12-12

    申请号:CN202211187275.1

    申请日:2022-09-28

    Abstract: 本发明公开了一种溶血性曼氏杆菌(Mannheimia haemolytica)A6血清型白细胞毒素抗原蛋白,其氨基酸序列如SEQ ID NO:2所示。本发明还公开了一种溶血性曼氏杆菌A6血清型白细胞毒素单克隆抗体,它是由保藏编号为CCTCC NO:C2022206的杂交瘤细胞株5D12产生的。该单克隆抗体能与牛溶血性曼氏杆菌A1和A6血清型LKT蛋白发生特异性反应,而且具有中和作用。因此不仅可用于制备LKT毒素蛋白的检测试剂盒,还可用于制备抗溶血性曼氏杆菌的药(56)对比文件F A Lainson.“Characterization ofepitopes involved in the neutralizationof Pasteurella haemolytica serotype A1leukotoxin”《.Microbiology (Reading)》.1996,第142卷(第Pt9期),第2499-2507页.Carolina Guzmán-Brambila 等.“LKTA andPlpE small fragments fusion proteinprotect against Mannheimia haemolyticachallenge”《.Research in VeterinaryScience》.2012,第93卷(第3期),第1293-1300页.陆奕彤 等.“溶血性曼氏杆菌重要抗原的免疫原性分析”《.江苏农业学报》.2022,第38卷(第2期),第446-452 页.李奕欣 等.“牛溶血性曼氏杆菌白细胞毒素、脂蛋白E和外膜蛋白A的免疫原性研究”《.中国预防兽医学报》.2021,第43卷(第7期),第753-758页.

    玉米基因组目标区段的DNA甲基化检测

    公开(公告)号:CN115161408A

    公开(公告)日:2022-10-11

    申请号:CN202210575458.4

    申请日:2022-05-25

    Abstract: 本申请公开了玉米基因组目标区段的DNA甲基化检测,具体涉及包含目标区段的玉米基因组DNA甲基化检测文库的构建方法、检测方法、试剂盒和系统。该方法、试剂盒和系统通过两次PCR扩增构建DNA甲基化检测文库,再通过对DNA甲基化检测文库测序和DNA甲基化信息比对实现检测。该方法、试剂盒和系统可一次性检测多份玉米材料中多个目标区段的DNA甲基化信息,也可应用于杂交材料两个亲本等位基因的DNA甲基化的检测,每一所述目标区段应包含至少一个或多个能够区分不同玉米材料或不同等位基因的SNP位点,本申请在准确检测DNA甲基化水平的同时,既简化了繁琐的实验操作,也极大降低了检测成本。

    一株多杀性巴氏杆菌及其应用

    公开(公告)号:CN113801812B

    公开(公告)日:2023-07-25

    申请号:CN202111027185.1

    申请日:2021-09-02

    Abstract: 本发明公开了一株多杀性巴氏杆菌(Pasteurella multocida)Pm A‑HG,保藏在中国典型培养物保藏中心,保藏编号CCTCC NO:M 2021805。本发明还公开了该菌株在制备牛多杀性巴氏杆菌疫苗中的应用,属于疫苗微生物领域。本发明从多杀性巴氏杆菌A型临床分离株中筛选出一株毒力很强的制苗菌株,接着将其分别与多种佐剂配合,筛选出一种能大幅提高血清抗体水平和免疫保护力的佐剂,最后制成灭活疫苗,通过免疫小鼠探明了该疫苗在A型和F型之间存在交叉保护,从而为多杀性巴氏杆菌所致疾病的临床防控提供了更好的依据。

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