公开(公告)号：CN116555275A

公开(公告)日：2023-08-08

申请号：CN202310115281.4

申请日：2023-02-15

Applicant: 华中农业大学

Inventor： 白旭峰 ,  彭波 ,  孙俊霄 ,  谭云飞 ,  邢永忠

IPC: C12N15/12 ,  C12Q1/6888 ,  C12Q1/6879 ,  C12Q1/6869 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明属于水产养殖动物分子标记筛选领域。具体涉及克氏原螯虾性别决定基因PcWNT2b的克隆及分子标记与应用。通过对克氏原螯虾雌雄个体比较重测序及图位克隆，确定性别决定基因所在的区间，并获得区间内1个性别相关的基因，将该基因命名为PcWNT2b，该基因CDS序列如SEQ NO：1，蛋白质序列如SEQ NO：2，以该基因DNA序列设计分子标记PcSDGM，其核苷酸序列如SEQ ID NO：3。以基因组DNA为模板进行扩增，对PCR产物进行纯化测序，测序结果与SEQ NO:3比对，若序列相同且峰图为单峰判定为雌性，若前180bp相同，峰图为双峰，判定为雄性。该基因定位为克氏原螯虾单性育种奠定了基础。

公开(公告)号：CN114959056A

公开(公告)日：2022-08-30

申请号：CN202210523775.1

申请日：2022-05-13

Applicant: 华中农业大学

Inventor： 白旭峰 ,  谭云飞 ,  蓬国辉 ,  邢永忠 ,  彭波 ,  孙俊霄

IPC: C12Q1/6888 ,  C12Q1/6879 ,  C12Q1/6858 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明属于动物分子标记筛选领域。具体涉及一种鉴定雌性克氏原螯虾的SSR标记及其应用。本发明主要步骤为(1)分别提取雌、雄性克氏原螯虾基因组DNA。(2)对雌雄群体克氏原螯虾的DNA样本进行PCR检测，设计相关引物扩增目片段，通过琼脂糖电泳检测目的片段是否被扩增出。(3)利用PAGE胶电泳检测并进行统计分析。通过PAGE胶电泳后显影、读带，对雌雄克氏原螯虾群体间的带型进行统计分析。结果表明：检测到的雌性和雄性克氏原螯虾群体样本显示所有雌性或雄性样本在PCM1237位点含有A、B、C三种等位基因，雌性克氏原螯虾基因型为纯合型或杂合型，而雄性克氏原螯虾基因型仅为纯合型。即杂合型一定是雌性克氏原螯虾。

公开(公告)号：CN113502337A

公开(公告)日：2021-10-15

申请号：CN202110792139.4

申请日：2021-07-13

Applicant: 华中农业大学

Inventor： 白旭峰 ,  任鑫 ,  彭国辉 ,  谭云飞 ,  彭波

IPC: C12Q1/6888 ,  C12Q1/6858 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明属于水产养殖分子标记筛选技术领域。具体涉及一种提高克氏原螯虾抗病能力的SNP分子标记及应用。发明的特征为：分别提取随机收集的克氏原螯虾RNA，通过反转录获得其cDNA。根据克氏原螯虾抗病基因Crustin基因和ALF基因序列设计引物组合，利用引物组合对克氏原螯虾cDNA样本进行PCR扩增并得到目的片段，利用琼脂糖胶电泳检测并确认目的片段被扩增出。进一步通过一代测序手段获得其cDNA序列并进行序列比对，鉴定克氏原螯虾群体中Crustin和AFL基因编码区中的SNP位点，对两基因及其组合进行分型；比较各基因型之间抗病能力的差异，筛选得到抗病能力最强的基因型及其组合标记引物。可用于辅助选择。

公开(公告)号：CN118326052A

公开(公告)日：2024-07-12

申请号：CN202410459748.1

申请日：2024-04-17

Applicant: 华中农业大学

Inventor： 白旭峰 ,  刘雪伟 ,  刘甜甜 ,  任鑫 ,  朱鑫涛 ,  谭云飞

IPC: C12Q1/6888 ,  C12Q1/6858 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明属于水产动物分子标记领域。具体涉及一种鉴定克氏原螯虾Toll3、Toll4基因SNP位点优势抗病单倍型的KASP标记及其应用。Toll3‑Hap1和Toll4‑Hap1为抗病优势单倍型，对应SNP位点分别位于NC_059655.1染色体上第5956622、5957405、5958851、5863494、5862294位碱基，对细菌、双基因单倍型组合Toll3‑Hap1+Toll4‑Hap1为一定的抗病优势。本发明KASP标记可满足克氏原螯虾抗病分子辅助选择。

公开(公告)号：CN114959056B

公开(公告)日：2024-05-17

申请号：CN202210523775.1

申请日：2022-05-13

Applicant: 华中农业大学

Inventor： 白旭峰 ,  谭云飞 ,  蓬国辉 ,  邢永忠 ,  彭波 ,  孙俊霄

IPC: C12Q1/6888 ,  C12Q1/6879 ,  C12Q1/6858 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明属于动物分子标记筛选领域。具体涉及一种鉴定雌性克氏原螯虾的SSR标记及其应用。本发明主要步骤为(1)分别提取雌、雄性克氏原螯虾基因组DNA。(2)对雌雄群体克氏原螯虾的DNA样本进行PCR检测，设计相关引物扩增目片段，通过琼脂糖电泳检测目的片段是否被扩增出。(3)利用PAGE胶电泳检测并进行统计分析。通过PAGE胶电泳后显影、读带，对雌雄克氏原螯虾群体间的带型进行统计分析。结果表明：检测到的雌性和雄性克氏原螯虾群体样本显示所有雌性或雄性样本在PCM1237位点含有A、B、C三种等位基因，雌性克氏原螯虾基因型为纯合型或杂合型，而雄性克氏原螯虾基因型仅为纯合型。即杂合型一定是雌性克氏原螯虾。

公开(公告)号：CN113502337B

公开(公告)日：2022-03-22

申请号：CN202110792139.4

申请日：2021-07-13

Applicant: 华中农业大学

Inventor： 白旭峰 ,  任鑫 ,  彭国辉 ,  谭云飞 ,  彭波

IPC: C12Q1/6888 ,  C12Q1/6858 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明属于水产养殖分子标记筛选技术领域。具体涉及一种提高克氏原螯虾抗病能力的SNP分子标记及应用。发明的特征为：分别提取随机收集的克氏原螯虾RNA，通过反转录获得其cDNA。根据克氏原螯虾抗病基因Crustin基因和ALF基因序列设计引物组合，利用引物组合对克氏原螯虾cDNA样本进行PCR扩增并得到目的片段，利用琼脂糖胶电泳检测并确认目的片段被扩增出。进一步通过一代测序手段获得其cDNA序列并进行序列比对，鉴定克氏原螯虾群体中Crustin和AFL基因编码区中的SNP位点，对两基因及其组合进行分型；比较各基因型之间抗病能力的差异，筛选得到抗病能力最强的基因型及其组合标记引物。可用于辅助选择。