一种玉米基因型与环境跨模态特征融合的基因组预测方法和模型

    公开(公告)号:CN119560010A

    公开(公告)日:2025-03-04

    申请号:CN202411592162.9

    申请日:2024-11-08

    Abstract: 本发明提供了一种玉米基因型与环境跨模态特征融合的基因组预测方法和模型,采用深度学习方法对包括基因组与环境组的不同组学数据间复杂的非线性变换关系进行建模,通过构建GECF_GP模型融合玉米跨基因型与环境互作的特征,较好的挖掘了时序性特征以及与表型相关的重要生育期,实现了预测玉米复杂农艺性状的表型的功能。本发明在不同实验设置中展现了较强的鲁棒性,在G×E互作的基因组预测方面具有优越性,探索了表型相关的重要生育期以及预测跨不同年份表型的性能,对于基因组预测分析方法提供了新思路,进而为玉米在不同环境的适应性分析和关键生育期的探索提供了理论和应用价值参考,加快了智慧育种领域的发展。

    一种融合多环境因子预测新环境材料表型的方法

    公开(公告)号:CN118629491A

    公开(公告)日:2024-09-10

    申请号:CN202410794374.9

    申请日:2024-06-19

    Abstract: 本发明提供了一种融合多环境因子预测新环境材料表型的方法,首先根据材料的种植环境和种植时期,获得整个生育期以天为单位的25类环境数据;然后针对每种环境数据、经过不同大小窗口的滑窗,求得每个窗口内环境数据的均值,将环境均值和表型关联,挑选具有最大相关性的窗口代表该环境数据;在单环境下使用GBLUP预测已知环境新材料表型;最后利用三个地点的环境数据和表型数据构建模型,一个地点的环境数据和表型数据挑选环境因子,实现了预测新环境表型的功能。本发明帮助育种家无需种植就得到目标材料在新环境的表型,进而辅助遗传改良和材料选育,以及为特定生态环境培育具有优秀表现的品种提供了建议。

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