公开(公告)号：CN114974435A

公开(公告)日：2022-08-30

申请号：CN202210509532.2

申请日：2022-05-10

Applicant: 华东交通大学

Inventor： 李雄 ,  林扬凯 ,  孟旭 ,  周娟

IPC: G16B50/30 ,  G16B20/00 ,  G06K9/62

Abstract: 本申请涉及一种统一细胞类型和状态特征的细胞相似性度量方法，它包括如下步骤：S1：选择特征基因；S2：计算细胞类型差异；S3：计算细胞状态差异；S4：计算细胞间的距离；S5：根据步骤S4中得到的细胞间的距离构建距离矩阵Wα和邻接矩阵Wfinal；S6：在邻接矩阵Wfinal上实施谱聚类。本发明能够有效处理表达矩阵中存在大量零表达的情形，有效减少单细胞数据固有噪声的影响，可应用于单细胞数据集的细胞鉴定和衡量肿瘤内异质性分析。

公开(公告)号：CN114974435B

公开(公告)日：2024-04-09

申请号：CN202210509532.2

申请日：2022-05-10

Applicant: 华东交通大学

Inventor： 李雄 ,  林扬凯 ,  孟旭 ,  周娟

IPC: G16B50/30 ,  G16B20/00 ,  G06F18/22 ,  G06F18/23

Abstract: 本申请涉及一种统一细胞类型和状态特征的细胞相似性度量方法，它包括如下步骤：S1：选择特征基因；S2：计算细胞类型差异；S3：计算细胞状态差异；S4：计算细胞间的距离；S5：根据步骤S4中得到的细胞间的距离构建距离矩阵Wα和邻接矩阵Wfinal；S6：在邻接矩阵Wfinal上实施谱聚类。本发明能够有效处理表达矩阵中存在大量零表达的情形，有效减少单细胞数据固有噪声的影响，可应用于单细胞数据集的细胞鉴定和衡量肿瘤内异质性分析。