一种拟南芥叶片个数及叶片尖点到质心的距离的检测方法

    公开(公告)号:CN103489192B

    公开(公告)日:2017-01-11

    申请号:CN201310456191.8

    申请日:2013-09-30

    Abstract: 一种拟南芥叶片个数及叶片尖点到质心的距离的检测方法,该方法具体包括:在拟南芥的种植盆中,放置标定板,利用相机采集拟南芥的RGB图像;对采集后的图像进行预处理,实现图像的自动校正和标定,其中图像校正是为了校正图像的畸变,图像标定是为了获得单位像素的真实尺寸;对预处理后的图像进行分割,将拟南芥与背景分割,从图像中提取出来;分割出拟南芥图像之后,提取拟南芥的叶片个数,并计算每个叶片尖点到质心的距离。表性参数每个叶片尖点到质心的距离用于反映每个叶片的大小,植物的叶片个数及每个叶片的大小既可以定量地描述拟南芥的生长情况。通过这些表型参数描述不同基因的拟南芥在叶片生长情况上面的差异,从而可以推断出不同基因的功能及对拟南芥植物的影响。

    一种拟南芥区域表型的检测方法

    公开(公告)号:CN103591887A

    公开(公告)日:2014-02-19

    申请号:CN201310456213.0

    申请日:2013-09-30

    Abstract: 一种拟南芥区域表型的检测方法,该方法具体包括:在拟南芥的种植盆中,放置标定板,利用相机采集拟南芥的RGB图像;对采集后的图像进行预处理,实现图像的自动校正和标定,其中图像校正是为了校正图像的畸变,图像标定是为了获得单位像素的真实尺寸;对预处理后的图像进行分割,将拟南芥与背景分割,从图像中提取出来;提取拟南芥的区域表型参数,包括总面积、矩形度、圆度率、紧实性、周长凹凸比、偏心性以及对称性。表型参数总面积用来反映拟南芥的大小,表型参数矩形度、圆度率、紧实性、周长凹凸比、偏心性以及对称性用来反映拟南芥的区域形态。通过这些表型参数描述不同基因的拟南芥在大小和区域形态上面的差异,从而可以推断出不同基因的功能及对拟南芥植物的影响。

    一种拟南芥表型检测方法

    公开(公告)号:CN103593840B

    公开(公告)日:2017-01-11

    申请号:CN201310456194.1

    申请日:2013-09-30

    Abstract: 一种拟南芥表型的检测方法,该方法具体包括:在拟南芥的种植盆中,放置标定板,利用相机采集拟南芥的RGB图像;对采集后的图像进行预处理,实现图像的自动校正和标定,其中图像校正是为了校正图像的畸变,图像标定是为了获得单位像素的真实尺寸;对预处理后的图像进行分割,将拟南芥与背景分割,从图像中提取出来;分割出拟南芥图像之后,提取拟南芥表型参数是拟南芥植物总面积、拟南芥叶片个数以及拟南芥对称性的表型参数。通过本发明提供的方法提取的拟南芥表型参数既可以定量地描述拟南芥的生长情况,也可以用于拟南芥基因功能的研究,即通过这些表型参数描述不同基因的拟南芥在大小和区域形态上面的差异,从而可以推断出不同基因的功能及对拟南芥植物的影响。

    一种拟南芥轮廓表型的检测方法

    公开(公告)号:CN103471523B

    公开(公告)日:2016-07-06

    申请号:CN201310456227.2

    申请日:2013-09-30

    Abstract: 一种拟南芥轮廓表型的检测方法,该方法具体包括:在拟南芥的种植盆中,放置标定板,利用相机采集拟南芥的RGB图像;对采集后的图像进行预处理,实现图像的自动校正和标定,其中图像校正是为了校正图像的畸变,图像标定是为了获得单位像素的真实尺寸;对预处理后的图像进行分割,将拟南芥与背景分割,从图像中提取出来;分割出拟南芥图像之后,提取拟南芥的轮廓表型参数,用椭圆傅里叶描述子定量地描述其整体轮廓。通过对整体轮廓表型参数的分析,可以描述不同基因的拟南芥在整体轮廓形态和生长取向上面的差异,从而可以推断出不同基因的功能及对拟南芥植物的影响。

    一种拟南芥区域表型的检测方法

    公开(公告)号:CN103591887B

    公开(公告)日:2016-06-15

    申请号:CN201310456213.0

    申请日:2013-09-30

    Abstract: 一种拟南芥区域表型的检测方法,该方法具体包括:在拟南芥的种植盆中,放置标定板,利用相机采集拟南芥的RGB图像;对采集后的图像进行预处理,实现图像的自动校正和标定,其中图像校正是为了校正图像的畸变,图像标定是为了获得单位像素的真实尺寸;对预处理后的图像进行分割,将拟南芥与背景分割,从图像中提取出来;提取拟南芥的区域表型参数,包括总面积、矩形度、圆度率、紧实性、周长凹凸比、偏心性以及对称性。表型参数总面积用来反映拟南芥的大小,表型参数矩形度、圆度率、紧实性、周长凹凸比、偏心性以及对称性用来反映拟南芥的区域形态。通过这些表型参数描述不同基因的拟南芥在大小和区域形态上面的差异,从而可以推断出不同基因的功能及对拟南芥植物的影响。

    一种拟南芥表型检测方法

    公开(公告)号:CN103593840A

    公开(公告)日:2014-02-19

    申请号:CN201310456194.1

    申请日:2013-09-30

    Abstract: 一种拟南芥表型的检测方法,该方法具体包括:在拟南芥的种植盆中,放置标定板,利用相机采集拟南芥的RGB图像;对采集后的图像进行预处理,实现图像的自动校正和标定,其中图像校正是为了校正图像的畸变,图像标定是为了获得单位像素的真实尺寸;对预处理后的图像进行分割,将拟南芥与背景分割,从图像中提取出来;分割出拟南芥图像之后,提取拟南芥表型参数是拟南芥植物总面积、拟南芥叶片个数以及拟南芥对称性的表型参数。通过本发明提供的方法提取的拟南芥表型参数既可以定量地描述拟南芥的生长情况,也可以用于拟南芥基因功能的研究,即通过这些表型参数描述不同基因的拟南芥在大小和区域形态上面的差异,从而可以推断出不同基因的功能及对拟南芥植物的影响。

    一种拟南芥叶片个数及叶片尖点到质心的距离的检测方法

    公开(公告)号:CN103489192A

    公开(公告)日:2014-01-01

    申请号:CN201310456191.8

    申请日:2013-09-30

    Abstract: 一种拟南芥叶片个数及叶片尖点到质心的距离的检测方法,该方法具体包括:在拟南芥的种植盆中,放置标定板,利用相机采集拟南芥的RGB图像;对采集后的图像进行预处理,实现图像的自动校正和标定,其中图像校正是为了校正图像的畸变,图像标定是为了获得单位像素的真实尺寸;对预处理后的图像进行分割,将拟南芥与背景分割,从图像中提取出来;分割出拟南芥图像之后,提取拟南芥的叶片个数,并计算每个叶片尖点到质心的距离。表性参数每个叶片尖点到质心的距离用于反映每个叶片的大小,植物的叶片个数及每个叶片的大小既可以定量地描述拟南芥的生长情况。通过这些表型参数描述不同基因的拟南芥在叶片生长情况上面的差异,从而可以推断出不同基因的功能及对拟南芥植物的影响。

    一种拟南芥轮廓表型的检测方法

    公开(公告)号:CN103471523A

    公开(公告)日:2013-12-25

    申请号:CN201310456227.2

    申请日:2013-09-30

    Abstract: 一种拟南芥轮廓表型的检测方法,该方法具体包括:在拟南芥的种植盆中,放置标定板,利用相机采集拟南芥的RGB图像;对采集后的图像进行预处理,实现图像的自动校正和标定,其中图像校正是为了校正图像的畸变,图像标定是为了获得单位像素的真实尺寸;对预处理后的图像进行分割,将拟南芥与背景分割,从图像中提取出来;分割出拟南芥图像之后,提取拟南芥的轮廓表型参数,用椭圆傅里叶描述子定量地描述其整体轮廓。通过对整体轮廓表型参数的分析,可以描述不同基因的拟南芥在整体轮廓形态和生长取向上面的差异,从而可以推断出不同基因的功能及对拟南芥植物的影响。

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