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公开(公告)号:CN115386624B
公开(公告)日:2023-03-21
申请号:CN202211315126.9
申请日:2022-10-26
Applicant: 北京寻因生物科技有限公司
IPC: C12Q1/6869 , C12Q1/6806
Abstract: 本发明属于基因测序领域,具体涉及一种单细胞全序列标记的方法及其应用,所述单细胞全序列标记的方法包括以下步骤:提供待检测RNA,所述待检测RNA来自多个细胞;获取双链产物;将所述双链产物用转座酶进行转座反应,得到多个细胞的多个片段化产物;将多个所述片段化产物与多个细胞标签一一对应连接;其中,同一细胞的多个片段化产物与相同的所述细胞标签连接,不同细胞的多个片段化产物与不同的所述细胞标签连接,得到标记的单细胞全序列。本发明中,通过转座酶将双链产物片段化并引入转座子序列,片段化产物连接上特异性的细胞标签,以此实现单个细胞基因序列的细胞标签标记,便于后续实现单细胞全序列的检测,也提高了单细胞基因获取总量。
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公开(公告)号:CN115386624A
公开(公告)日:2022-11-25
申请号:CN202211315126.9
申请日:2022-10-26
Applicant: 北京寻因生物科技有限公司
IPC: C12Q1/6869 , C12Q1/6806
Abstract: 本发明属于基因测序领域,具体涉及一种单细胞全序列标记的方法及其应用,所述单细胞全序列标记的方法包括以下步骤:提供待检测RNA,所述待检测RNA来自多个细胞;获取双链产物;将所述双链产物用转座酶进行转座反应,得到多个细胞的多个片段化产物;将多个所述片段化产物与多个细胞标签一一对应连接;其中,同一细胞的多个片段化产物与相同的所述细胞标签连接,不同细胞的多个片段化产物与不同的所述细胞标签连接,得到标记的单细胞全序列。本发明中,通过转座酶将双链产物片段化并引入转座子序列,片段化产物连接上特异性的细胞标签,以此实现单个细胞基因序列的细胞标签标记,便于后续实现单细胞全序列的检测,也提高了单细胞基因获取总量。
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公开(公告)号:CN115386622B
公开(公告)日:2023-10-27
申请号:CN202211315109.5
申请日:2022-10-26
Applicant: 北京寻因生物科技有限公司
IPC: C12Q1/6806 , C12N15/10 , C40B50/06
Abstract: 本发明属于测序领域,具体涉及一种转录组文库的建库方法及其应用,包括以下步骤:提供待检测RNA反应体系,所述待检测RNA反应体系含有待检测RNA;获取双链产物;采用含有相同两个接头的转座酶对所述双链产物进行切割,得到片段化的双链产物;采用扩增引物对片段化的双链产物进行扩增,得到转录组文库。本发明中,通过使用含有通用引物序列和逆转录序列的引物进行逆转录,采用含相同双接头的转座酶进行切割并引入接头序列,对切割后的双链产物进行扩增,获得转录组文库。本发明建库简便、快速,不仅减少RNA建库时间,同时还能够分析固定样本与新鲜样本的RNA全长序列。
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公开(公告)号:CN115386966A
公开(公告)日:2022-11-25
申请号:CN202211315116.5
申请日:2022-10-26
Applicant: 北京寻因生物科技有限公司
IPC: C40B50/06 , C12Q1/6869
Abstract: 本发明属于基因测序领域,具体涉及DNA表观修饰的建库方法、测序方法及其建库试剂盒,包括以下步骤:提供待测DNA;将待测DNA与多肽接触,得到被定位DNA;采用转座酶与被定位DNA进行转座反应,得到片段化的表观修饰DNA体系;将片段化的表观修饰DNA体系与多个标签体进行连接反应,得到标记表观修饰DNA体系;将标记表观修饰DNA体系采用扩增引物进行扩增反应。本发明通过采用多肽特异性结合对表观修饰碱基的DNA进行定位,再转座酶进行靶向定位点后,对定位点附近的DNA进行切割,因此被切割的部分只限定于表观修饰碱基的区域,进而有效地筛选表观修饰DNA信息加以应用,减少了非表观修饰碱基区域干扰。
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公开(公告)号:CN115386622A
公开(公告)日:2022-11-25
申请号:CN202211315109.5
申请日:2022-10-26
Applicant: 北京寻因生物科技有限公司
IPC: C12Q1/6806 , C12N15/10 , C40B50/06
Abstract: 本发明属于测序领域,具体涉及一种转录组文库的建库方法及其应用,包括以下步骤:提供待检测RNA反应体系,所述待检测RNA反应体系含有待检测RNA;获取双链产物;采用含有相同两个接头的转座酶对所述双链产物进行切割,得到片段化的双链产物;采用扩增引物对片段化的双链产物进行扩增,得到转录组文库。本发明中,通过使用含有通用引物序列和逆转录序列的引物进行逆转录,采用含相同双接头的转座酶进行切割并引入接头序列,对切割后的双链产物进行扩增,获得转录组文库。本发明建库简便、快速,不仅减少RNA建库时间,同时还能够分析固定样本与新鲜样本的RNA全长序列。
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公开(公告)号:CN115386966B
公开(公告)日:2023-03-21
申请号:CN202211315116.5
申请日:2022-10-26
Applicant: 北京寻因生物科技有限公司
IPC: C40B50/06 , C12Q1/6869
Abstract: 本发明属于基因测序领域,具体涉及DNA表观修饰的建库方法、测序方法及其建库试剂盒,包括以下步骤:提供待测DNA;将待测DNA与多肽接触,得到被定位DNA;采用转座酶与被定位DNA进行转座反应,得到片段化的表观修饰DNA体系;将片段化的表观修饰DNA体系与多个标签体进行连接反应,得到标记表观修饰DNA体系;将标记表观修饰DNA体系采用扩增引物进行扩增反应。本发明通过采用多肽特异性结合对表观修饰碱基的DNA进行定位,再转座酶进行靶向定位点后,对定位点附近的DNA进行切割,因此被切割的部分只限定于表观修饰碱基的区域,进而有效地筛选表观修饰DNA信息加以应用,减少了非表观修饰碱基区域干扰。
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公开(公告)号:CN115261389A
公开(公告)日:2022-11-01
申请号:CN202210874581.6
申请日:2022-07-21
Applicant: 北京寻因生物科技有限公司
IPC: C12N15/113 , C40B40/06 , C40B50/06 , C12Q1/6806 , C12N15/11
Abstract: 本发明属于单细胞建库领域,具体涉及一种功能序列、包含其的标签群以及应用,所述功能序列包括:标签体以及与所述标签体连接的接头1;其中,所述标签体包括细胞标签。本发明中,通过在细胞标签上连接上接头1,可以使其进行组合成标签群后,配合游离的逆转录引物,即可对于不同细胞的cDNA进行细胞标签标记,以此可以进行单细胞检测。通用性强,不仅可实现3’、5’及全序列单细胞转录组的检测,也可以适用于各种目标RNA的设计,同时配合使用封闭体系,进一步的避免细胞间的污染,使得可以进行高通量单细胞检测。
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