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公开(公告)号：CN115261389A
公开(公告)日：2022-11-01
申请号：CN202210874581.6
申请日：2022-07-21
Applicant: 北京寻因生物科技有限公司
IPC: C12N15/113 , C40B40/06 , C40B50/06 , C12Q1/6806 , C12N15/11
Abstract: 本发明属于单细胞建库领域，具体涉及一种功能序列、包含其的标签群以及应用，所述功能序列包括：标签体以及与所述标签体连接的接头1；其中，所述标签体包括细胞标签。本发明中，通过在细胞标签上连接上接头1，可以使其进行组合成标签群后，配合游离的逆转录引物，即可对于不同细胞的cDNA进行细胞标签标记，以此可以进行单细胞检测。通用性强，不仅可实现3’、5’及全序列单细胞转录组的检测，也可以适用于各种目标RNA的设计，同时配合使用封闭体系，进一步的避免细胞间的污染，使得可以进行高通量单细胞检测。
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公开(公告)号：CN115198001A
公开(公告)日：2022-10-18
申请号：CN202210874582.0
申请日：2022-07-21
Applicant: 北京寻因生物科技有限公司
IPC: C12Q1/6806 , C40B50/06
Abstract: 本发明属于基因测序领域，具体提供一种单细胞全序列转录组文库构建方法及应用，包括：提供多个细胞的目标mRNA；采用逆转录引物对对多个所述细胞的所述目标mRNA进行逆转录，得到多个细胞的多个cDNA片段；将多个细胞的多个所述cDNA片段与多个标签体一一对应连接，得到各细胞的多个标记cDNA片段；将各所述标记cDNA片段经过富集，并引入文库标签后，得到所述单细胞全序列转录组文库。本发明采用带有随机序列的正向引物与带有固定序列的反向引物对目标mRNA进行逆转录，形成多个带有粘性末端的cDNA片段产物，通过粘性末端在cDNA全长序列的任一位置引入分子标签，同时不同细胞来源的cDNA片段上连接不同的细胞标签，以此将不同的细胞进行分辨，实现了高通量单细胞全序列测序。
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公开(公告)号：CN118186591B
公开(公告)日：2024-09-17
申请号：CN202410613462.4
申请日：2024-05-17
Applicant: 北京寻因生物科技有限公司
IPC: C40B50/06 , C12Q1/6869
Abstract: 本发明公开了一种高效的单细胞空间位置和遗传信息共分析的建库方法及其应用，包括步骤：S10、提供具有位置标签序列的空间芯片；S20、将待测的组织切片与具有位置标签序列的空间芯片结合，以使得位置标签序列结合到待分析的组织切片的细胞核中，回收含有位置标签序列的细胞核；S30、提供多重逆转录标签引物，将多重逆转录标签引物与所述细胞核混合进行逆转录、细胞标记，得包含细胞标签的液滴；S40、将包含细胞标签的液滴破乳并解交联，进行测序，得待测组织切片中单细胞的位置信息及对应的单细胞转录组信息。本方法以超高通量在单细胞水平上分析遗传信息，还能够有效去除来源于组织碎片的干扰，得到精准的单细胞空间位置信息。
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公开(公告)号：CN115386624B
公开(公告)日：2023-03-21
申请号：CN202211315126.9
申请日：2022-10-26
Applicant: 北京寻因生物科技有限公司
IPC: C12Q1/6869 , C12Q1/6806
Abstract: 本发明属于基因测序领域，具体涉及一种单细胞全序列标记的方法及其应用，所述单细胞全序列标记的方法包括以下步骤：提供待检测RNA，所述待检测RNA来自多个细胞；获取双链产物；将所述双链产物用转座酶进行转座反应，得到多个细胞的多个片段化产物；将多个所述片段化产物与多个细胞标签一一对应连接；其中，同一细胞的多个片段化产物与相同的所述细胞标签连接，不同细胞的多个片段化产物与不同的所述细胞标签连接，得到标记的单细胞全序列。本发明中，通过转座酶将双链产物片段化并引入转座子序列，片段化产物连接上特异性的细胞标签，以此实现单个细胞基因序列的细胞标签标记，便于后续实现单细胞全序列的检测，也提高了单细胞基因获取总量。
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公开(公告)号：CN115198000A
公开(公告)日：2022-10-18
申请号：CN202210861086.1
申请日：2022-07-21
Applicant: 北京寻因生物科技有限公司
IPC: C12Q1/6806 , C12Q1/6869 , C40B50/06
Abstract: 本发明属于基因测序领域，具体涉及一种单细胞全序列转录组文库构建的方法，包括：提供多个细胞的目标mRNA；采用逆转录引物对各细胞的目标mRNA进行逆转录，得到各细胞的cDNA第一链；采用cDNA第二链引物对对以各细胞的cDNA第一链为模板合成各细胞的多个cDNA第二链片段；将多个细胞的多个cDNA第二链片段与多个标签体一一对应连接，得到多个标记cDNA片段；将多个所述标记cDNA片段进行富集后，并引入文库标签，得到所述单细胞全序列转录组文库。本发明采用带有随机序列的正向引物合成多个cDNA第二链片段，通过粘性末端在每个cDNA第二链片段连接分子标签，同时在不同细胞来源的cDNA片段上连接不同的细胞标签，以此将不同的细胞进行分辨，实现了高通量单细胞全序列测序。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN115198001B
公开(公告)日：2023-07-04
申请号：CN202210874582.0
申请日：2022-07-21
Applicant: 北京寻因生物科技有限公司
IPC: C12Q1/6806 , C40B50/06
Abstract: 本发明属于基因测序领域，具体提供一种单细胞全序列转录组文库构建方法及应用，包括：提供多个细胞的目标mRNA；采用逆转录引物对对多个所述细胞的所述目标mRNA进行逆转录，得到多个细胞的多个cDNA片段；将多个细胞的多个所述cDNA片段与多个标签体一一对应连接，得到各细胞的多个标记cDNA片段；将各所述标记cDNA片段经过富集，并引入文库标签后，得到所述单细胞全序列转录组文库。本发明采用带有随机序列的正向引物与带有固定序列的反向引物对目标mRNA进行逆转录，形成多个带有粘性末端的cDNA片段产物，通过粘性末端在cDNA全长序列的任一位置引入分子标签，同时不同细胞来源的cDNA片段上连接不同的细胞标签，以此将不同的细胞进行分辨，实现了高通量单细胞全序列测序。
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公开(公告)号：CN115386624A
公开(公告)日：2022-11-25
申请号：CN202211315126.9
申请日：2022-10-26
Applicant: 北京寻因生物科技有限公司
IPC: C12Q1/6869 , C12Q1/6806
Abstract: 本发明属于基因测序领域，具体涉及一种单细胞全序列标记的方法及其应用，所述单细胞全序列标记的方法包括以下步骤：提供待检测RNA，所述待检测RNA来自多个细胞；获取双链产物；将所述双链产物用转座酶进行转座反应，得到多个细胞的多个片段化产物；将多个所述片段化产物与多个细胞标签一一对应连接；其中，同一细胞的多个片段化产物与相同的所述细胞标签连接，不同细胞的多个片段化产物与不同的所述细胞标签连接，得到标记的单细胞全序列。本发明中，通过转座酶将双链产物片段化并引入转座子序列，片段化产物连接上特异性的细胞标签，以此实现单个细胞基因序列的细胞标签标记，便于后续实现单细胞全序列的检测，也提高了单细胞基因获取总量。
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公开(公告)号：CN114096678A
公开(公告)日：2022-02-25
申请号：CN202080005408.1
申请日：2020-07-31
Applicant: 北京寻因生物科技有限公司
IPC: C12Q1/6806 , C40B40/06 , C40B50/06
Abstract: 本发明提供了多种核酸共标记支持物及其制作方法与应用。支持物包括支持物本体以及位于支持物本体表面和/或内部的多种核酸标记，单个支持物上标记的核酸至少包括：一或多个第一核酸标记，其作用至少包括捕获反应体系中的特定化合物到支持物表面；一或多个第二核酸标记，其作用至少包括可以参与到捕获到支持物表面的特定化合物的指定生物化学反应过程。本发明的多种核酸共标记的支持物可以用于5’单细胞RNA表达谱分析、构建微孔阵列平台的5’单细胞VDJ文库、构建3’单细胞RNA文库、构建单细胞转录组文库、单细胞多组学研究、多重PCR和/或构建多重PCR测序文库等。
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公开(公告)号：CN118186591A
公开(公告)日：2024-06-14
申请号：CN202410613462.4
申请日：2024-05-17
Applicant: 北京寻因生物科技有限公司
IPC: C40B50/06 , C12Q1/6869
Abstract: 本发明公开了一种高效的单细胞空间位置和遗传信息共分析的建库方法及其应用，包括步骤：S10、提供具有位置标签序列的空间芯片；S20、将待测的组织切片与具有位置标签序列的空间芯片结合，以使得位置标签序列结合到待分析的组织切片的细胞核中，回收含有位置标签序列的细胞核；S30、提供多重逆转录标签引物，将多重逆转录标签引物与所述细胞核混合进行逆转录、细胞标记，得包含细胞标签的液滴；S40、将包含细胞标签的液滴破乳并解交联，进行测序，得待测组织切片中单细胞的位置信息及对应的单细胞转录组信息。本方法以超高通量在单细胞水平上分析遗传信息，还能够有效去除来源于组织碎片的干扰，得到精准的单细胞空间位置信息。
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公开(公告)号：CN115386622B
公开(公告)日：2023-10-27
申请号：CN202211315109.5
申请日：2022-10-26
Applicant: 北京寻因生物科技有限公司
IPC: C12Q1/6806 , C12N15/10 , C40B50/06
Abstract: 本发明属于测序领域，具体涉及一种转录组文库的建库方法及其应用，包括以下步骤：提供待检测RNA反应体系，所述待检测RNA反应体系含有待检测RNA；获取双链产物；采用含有相同两个接头的转座酶对所述双链产物进行切割，得到片段化的双链产物；采用扩增引物对片段化的双链产物进行扩增，得到转录组文库。本发明中，通过使用含有通用引物序列和逆转录序列的引物进行逆转录，采用含相同双接头的转座酶进行切割并引入接头序列，对切割后的双链产物进行扩增，获得转录组文库。本发明建库简便、快速，不仅减少RNA建库时间，同时还能够分析固定样本与新鲜样本的RNA全长序列。
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