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公开(公告)号：CN114496070A
公开(公告)日：2022-05-13
申请号：CN202210074550.2
申请日：2022-01-21
Applicant: 北京大学
IPC: G16B20/00
Abstract: 本发明实施例提供了一种转录组序列分类方法、装置、电子设备及计算机可读存储介质，本发明实施例中，转录组序列分类预测模型预先学习了多个已知类别的微生物的转录组序列的碱基序列、密码子序列和氨基酸序列，从而，本发明实施例采用的转录组序列分类预测模型，可以结合待分类转录组序列的碱基序列、密码子序列和氨基酸序列，准确地预测该待分类转录组序列所属的微生物类别。本发明实施例中，通过对转录组序列进行比对和预测，可以确定转录组序列所属的微生物类别。从而可以从虫媒介宏转录组中发现更多的未知的RNA病毒(主要的人类病毒)，以作为疾病的检测、防控，以及新病毒或其他病原体的研究的基础。
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公开(公告)号：CN117831608A
公开(公告)日：2024-04-05
申请号：CN202410033433.0
申请日：2024-01-09
Applicant: 北京大学
Abstract: 本发明提供了一种人工微生物群落从头设计方法、装置、设备及存储介质，涉及微生物群落设计技术领域。该方法包括：构建得到大规模微生物对应的基因组规模代谢网络模型(GEM)候选池，基于设计目标确定底物和产物，以广度优先搜索的方式从该GEM候选池中识别具有生物意义的生物合成或降解途径，鉴定微生物是否具有从底物到若干个衔接物最终到产物的部分或完整通路；再定量推断单一微生物及微生物群落的最大化代谢目标效率时的稳态代谢通量分布，筛选出高生长、高代谢目标效率的候选微生物群落；最后利用深度学习算法预测候选微生物群落的共现概率，最终实现从大规模候选微生物池中从头设计满足预设功能(目标物质的高效生产或降解)的人工微生物群落。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN113658641B
公开(公告)日：2024-07-26
申请号：CN202110819164.7
申请日：2021-07-20
Applicant: 北京大学
IPC: G16B30/00 , G16B40/00 , G06N3/0464 , G06N3/048 , G06N3/08
Abstract: 本申请提供了一种噬菌体分类方法、装置、设备及存储介质，涉及生物测序技术领域。本申请将从噬菌体全基因组数据提取出的短序列样本进行独热编码，直接使用碱基信息训练预先构建的深度神经网络，得到能够基于短序列信息，鉴定噬菌体属于温和噬菌体还是烈性噬菌体的分类器。鉴于宏基因组测序得到的噬菌体序列长度跨度较大，本申请设置对应四组不同长度区间的深度神经网络，各组长度区间下的深度神经网络学习不同长度的序列特征，提高预测性能。另外针对长度超过四组长度区间的序列，设置了基于权重的预测方法，使得本申请可以对任意长度的噬菌体序列进行分类。本申请还对短序列样本进行补序，扩充训练数据，提高了深度神经网络的分类性能。
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公开(公告)号：CN113658641A
公开(公告)日：2021-11-16
申请号：CN202110819164.7
申请日：2021-07-20
Applicant: 北京大学
Abstract: 本申请提供了一种噬菌体分类方法、装置、设备及存储介质，涉及生物测序技术领域。本申请将从噬菌体全基因组数据提取出的短序列样本进行独热编码，直接使用碱基信息训练预先构建的深度神经网络，得到能够基于短序列信息，鉴定噬菌体属于温和噬菌体还是烈性噬菌体的分类器。鉴于宏基因组测序得到的噬菌体序列长度跨度较大，本申请设置对应四组不同长度区间的深度神经网络，各组长度区间下的深度神经网络学习不同长度的序列特征，提高预测性能。另外针对长度超过四组长度区间的序列，设置了基于权重的预测方法，使得本申请可以对任意长度的噬菌体序列进行分类。本申请还对短序列样本进行补序，扩充训练数据，提高了深度神经网络的分类性能。
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公开(公告)号：CN114496070B
公开(公告)日：2024-11-01
申请号：CN202210074550.2
申请日：2022-01-21
Applicant: 北京大学
IPC: G16B20/00
Abstract: 本发明实施例提供了一种转录组序列分类方法、装置、电子设备及计算机可读存储介质，本发明实施例中，转录组序列分类预测模型预先学习了多个已知类别的微生物的转录组序列的碱基序列、密码子序列和氨基酸序列，从而，本发明实施例采用的转录组序列分类预测模型，可以结合待分类转录组序列的碱基序列、密码子序列和氨基酸序列，准确地预测该待分类转录组序列所属的微生物类别。本发明实施例中，通过对转录组序列进行比对和预测，可以确定转录组序列所属的微生物类别。从而可以从虫媒介宏转录组中发现更多的未知的RNA病毒(主要的人类病毒)，以作为疾病的检测、防控，以及新病毒或其他病原体的研究的基础。
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公开(公告)号：CN221713202U
公开(公告)日：2024-09-17
申请号：CN202323074919.9
申请日：2023-11-14
Applicant: 北京大学第一医院
IPC: A61M16/04
Abstract: 本实用新型涉及一种气管插管咬护套，包括咬嘴以及护板。其中，咬嘴中空设置，供气管插管通过，咬嘴的外围设置有护牙槽，护牙槽供患者的牙齿陷入咬合。护板设置在咬嘴的一侧，且护板上设置有供气管插管穿入的避让孔。通过咬嘴以及护牙槽的设置，能够对患者的牙齿进行辅助固定，对牙齿部分进行保护，后续在医护人员的插管操作中，护牙槽能够将牙齿包围保护起来，即便患者的牙齿松动脱落，护牙槽还能对松动牙齿的移动进行限位，在患者咬合的状态下，能够避免牙齿脱落而误入气道的情况发生。
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