公开(公告)号：CN105420375A

公开(公告)日：2016-03-23

申请号：CN201510983092.4

申请日：2015-12-24

Applicant: 北京大学

Inventor： 万成 ,  文平 ,  陆祖宏 ,  康玉麟

IPC: C12Q1/68 ,  G06F19/24

Abstract: 本发明公开了一种基于微量细胞全基因组测序的环境微生物基因组草图的构建方法，通过对多个环境微生物微小宏基因组样本分别进行核酸分离，扩增，构建高通测序文库，然后对测序数据进行过滤、从头组装、开放阅读框预测，使用基于隐马尔科夫模型的算法将序列分类，获得微生物基因组草图。该方法根据环境样本微生物群落的复杂度调整平行试验的次数，以获得最优的分析结果，可应用于土壤、空气、水体、人体等各种环境的微生物群落研究。

公开(公告)号：CN105420375B

公开(公告)日：2020-01-21

申请号：CN201510983092.4

申请日：2015-12-24

Applicant: 北京大学

Inventor： 万成 ,  文平 ,  陆祖宏 ,  康玉麟

IPC: C12Q1/6806 ,  G16B40/00

Abstract: 本发明公开了一种基于微量细胞全基因组测序的环境微生物基因组草图的构建方法，通过对多个环境微生物微小宏基因组样本分别进行核酸分离，扩增，构建高通测序文库，然后对测序数据进行过滤、从头组装、开放阅读框预测，使用基于隐马尔科夫模型的算法将序列分类，获得微生物基因组草图。该方法根据环境样本微生物群落的复杂度调整平行试验的次数，以获得最优的分析结果，可应用于土壤、空气、水体、人体等各种环境的微生物群落研究。