公开(公告)号：CN109762809A

公开(公告)日：2019-05-17

申请号：CN201910220644.4

申请日：2019-03-22

Applicant: 北京医院

Inventor： 王征 ,  刘东戈 ,  张琳 ,  施红 ,  孙明君 ,  崔娣 ,  李琳 ,  徐燕 ,  王孟昭 ,  邸婧 ,  阮力 ,  宋庆涛

IPC: C12N15/10 ,  C12Q1/6806

Abstract: 本发明涉及DNA的提取方法领域，提供一种痰液标本中cfDNA的提取方法，其包括制备痰液中的cfDNA的提取样本和将提取样本使用提取cfDNA的试剂盒进行cfDNA的提取，所述痰液中cfDNA的提取样本的制备方法包括如下步骤：1)痰液收集；2)痰液标本质控；3)将痰液标本与化痰液混合，震摇至化痰完全，得到化痰混合液；4)将化痰混合液进行离心处理，分离上清液和底部沉淀，所述上清液即为无细胞上清液；5)将无细胞上清液进离心处理，收集上清液，得到提取样本。本发明的痰液标本中cfDNA的提取方法，提供了一种规范化的痰液标本中cfDNA的提取流程，能够从痰液标本中获取足量的cfDNA为后续基因改变检测提供基础。

公开(公告)号：CN109762809B

公开(公告)日：2021-06-29

申请号：CN201910220644.4

申请日：2019-03-22

Applicant: 北京医院

Inventor： 王征 ,  刘东戈 ,  张琳 ,  施红 ,  孙明君 ,  崔娣 ,  李琳 ,  徐燕 ,  王孟昭 ,  邸婧 ,  阮力 ,  宋庆涛

IPC: C12N15/10 ,  C12Q1/6806

Abstract: 本发明涉及DNA的提取方法领域，提供一种痰液标本中cfDNA的提取方法，其包括制备痰液中的cfDNA的提取样本和将提取样本使用提取cfDNA的试剂盒进行cfDNA的提取，所述痰液中cfDNA的提取样本的制备方法包括如下步骤：1)痰液收集；2)痰液标本质控；3)将痰液标本与化痰液混合，震摇至化痰完全，得到化痰混合液；4)将化痰混合液进行离心处理，分离上清液和底部沉淀，所述上清液即为无细胞上清液；5)将无细胞上清液进离心处理，收集上清液，得到提取样本。本发明的痰液标本中cfDNA的提取方法，提供了一种规范化的痰液标本中cfDNA的提取流程，能够从痰液标本中获取足量的cfDNA为后续基因改变检测提供基础。

公开(公告)号：CN115011668A

公开(公告)日：2022-09-06

申请号：CN202210678914.8

申请日：2022-06-16

Applicant: 北京医院

Inventor： 王征 ,  刘东戈 ,  王逸菲 ,  李琳 ,  李晓光 ,  崔娣 ,  杨丽 ,  邸婧 ,  何磊 ,  孙铭君

IPC: C12Q1/6806 ,  C40B50/06 ,  C12Q1/6869 ,  C12Q1/6886

Abstract: 本发明公开了一种痰液标本无细胞上清游离DNA二代测序建库、检测方法。所述痰液标本cfDNA二代测序建库方法包括以下步骤：1)提取、质控：对痰液标本进行化痰处理，离心，从上清液中提取痰液标本的cfDNA，对所述cfDNA进行浓度检测；2)构建文库：使用基因二代测序检测试剂盒进行痰液标本的cfDNA文库的构建，得痰液标本的cfDNA的基因测序文库。本发明通过收集83例痰液标本，同时收集配对肿瘤标本，进行NGS检测及下机数据分析，建立了痰液标本无细胞上清cfDNA进行NGS的文库，并给出了检测前、检测中及检测后数据分析过程中优化方案。