-
公开(公告)号：CN119361019A
公开(公告)日：2025-01-24
申请号：CN202411908549.0
申请日：2024-12-24
Applicant: 之江实验室 , 上海人工智能创新中心
Abstract: 本申请涉及新型抗菌肽序列的智能生成方法、系统及计算机设备，包括：将包含多序列比对的第一抗菌肽序列数据集输入至预训练好的生成器中，根据预设条件输出新型的第一候选抗菌肽序列集；将第一候选抗菌肽序列集输入至预训练好的判别器中，以判别出属于抗菌肽序列的第二候选抗菌肽序列集；将第二候选抗菌肽序列集输入至预训练好的预测器中，以预测第二候选抗菌肽序列集中各第二候选抗菌肽序列的抗菌活性；基于各第二候选抗菌肽序列的抗菌活性，在各第二候选抗菌肽序列集中选择出至少一条最优的目标抗菌肽序列。本申请利用生成器能够捕捉序列多样性，生成更广谱的抗菌肽序列，通过判别器和预测器的级联优化，生成的抗菌肽序列具备更高的抗菌活性。
-
公开(公告)号：CN116179513B
公开(公告)日：2023-12-22
申请号：CN202310258665.1
申请日：2023-03-10
Applicant: 之江实验室
IPC: C12N9/22 , C12N15/55 , C12N15/113
Abstract: 本发明公开了一种Cpf1蛋白及其在基因编辑中的应用，涉及生物技术领域。本发明提供了一种新型Cas12a核酸酶，命名为Cas12a‑68蛋白酶，它的PAM识别范围比传统的核酸酶更大，可以识别多种基因的靶点。利用本发明所述的新核酸酶在编辑核酸片段时，可以克服传统的Cas12a的不足，提高PAM的识别范围。这些优势使得本发明更加适用于范围更广的核酸片段编辑，在基因编辑应用中奠定了基础。
-
公开(公告)号：CN116179511B
公开(公告)日：2023-12-22
申请号：CN202310247428.5
申请日：2023-03-10
Applicant: 之江实验室
IPC: C12N9/22 , C12Q1/6818
Abstract: 本发明公开了Cpf1蛋白在制备用于核酸检测的试剂盒中的应用，涉及生物技术领域。利用本发明所述的新核酸酶在检测核酸片段时，可以克服传统的Cas12a的不足，提高PAM的识别范围，加快反应的速度，显著提高检测时的信号强度从而减少检测时间、提高检测效率，且灵敏度高、特异性高、准确性高、检测可视化(可在荧光灯下肉眼直接可视检测)、成本低、无需复杂大型实验设备、操作简便。这些优势使得本发明的检测方法更加适用于基层实验和临床一线的快速检测和鉴定诊断。
-
公开(公告)号：CN116083536A
公开(公告)日：2023-05-09
申请号：CN202310173577.1
申请日：2023-02-17
Applicant: 之江实验室
IPC: C12Q1/6837
Abstract: 本发明公开了一种前间区序列邻近基序的鉴定方法，涉及生物技术领域。本发明利用CRISP‑Cas蛋白的核酸切割活性，在体外利用带有256种PAM序列的DNA阵列检测CRISP‑Cas蛋白对不同PAM序列的特异性，能够清晰展示CRISP‑Cas蛋白对每种PAM序列的识别偏好性。同时，本发明步骤简单、操作简便、无需测序、检测时间短，可以作为CRISP‑Cas蛋白的通用检测方法。
-
公开(公告)号：CN117316284A
公开(公告)日：2023-12-29
申请号：CN202311281162.2
申请日：2023-10-07
Applicant: 之江实验室
Abstract: 本发明属于生物信息学技术领域，公开了一种基于隐马尔可夫模型的嗅觉受体基因注释方法和系统，旨在注释脊索动物基因组中的嗅觉受体基因，包括功能性嗅觉受体基因和嗅觉受体假基因。嗅觉受体是一类数量庞大的超基因家族，具有数量众多且差异大，假基因比率高等特点，这导致高质量地注释嗅觉受体基因比较困难。本发明采用嗅觉受体基因序列构建隐马尔可夫模型来定位基因组中嗅觉受体基因的坐标，并利用嗅觉受体特征和模式匹配来鉴定嗅觉受体基因，具有敏感度高、鲁棒性优和占用计算资源少等优势。本发明提供的嗅觉受体基因组注释方法和系统在提高嗅觉受体数据质量和挖掘致病相关的嗅觉受体基因等方面具有良好的推广价值。
-
Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN116179511A
公开(公告)日：2023-05-30
申请号：CN202310247428.5
申请日：2023-03-10
Applicant: 之江实验室
IPC: C12N9/22 , C12Q1/6818
Abstract: 本发明公开了Cpf1蛋白在制备用于核酸检测的试剂盒中的应用，涉及生物技术领域。利用本发明所述的新核酸酶在检测核酸片段时，可以克服传统的Cas12a的不足，提高PAM的识别范围，加快反应的速度，显著提高检测时的信号强度从而减少检测时间、提高检测效率，且灵敏度高、特异性高、准确性高、检测可视化(可在荧光灯下肉眼直接可视检测)、成本低、无需复杂大型实验设备、操作简便。这些优势使得本发明的检测方法更加适用于基层实验和临床一线的快速检测和鉴定诊断。
-
公开(公告)号：CN119361020A
公开(公告)日：2025-01-24
申请号：CN202411908673.7
申请日：2024-12-24
Applicant: 之江实验室 , 上海人工智能创新中心
Abstract: 本申请涉及一种基于生成式模型的抗菌肽生成方法、装置及计算机设备，涉及人工智能、生物信息学技术领域，通过获取现有的抗菌肽序列的集合；利用预训练的生成式模型，在现有的抗菌肽序列的基础上预测新型抗菌肽，得到预测序列；将所述预测序列输入预训练的抗菌肽分类器，判断所述预测序列是否具有抗菌活性；所述抗菌肽分类器基于抗菌肽标签集和非抗菌肽序标签集训练得到；将具有抗菌活性的所述预测序列作为最终的目标抗菌肽序列进行输出，解决了抗菌肽设计生成效率低的问题，能够借助生成式模型和分类器，实现对抗菌肽的从头生成和判定，提高了生成效率和准确性。
-
公开(公告)号：CN118006584A
公开(公告)日：2024-05-10
申请号：CN202410030064.X
申请日：2024-01-08
Applicant: 之江实验室
IPC: C12N9/22 , C12N15/55 , C12N15/113 , C12N15/85 , C12Q1/6816
Abstract: 本发明公开了CRISPR基因座完全缺失Cas1、Cas2和Cas4的可编程核酸酶及其应用，涉及生物技术领域。本发明提供了一类新型Cas12a核酸酶，它们的PAM识别范围比传统的核酸酶更大，可以识别多种基因的靶点。利用本发明所述的新核酸酶在编辑核酸片段时，可以克服传统的Cas12a的不足，提高细胞的基因编辑效率。且在Mn2+离子条件下，新型核酸酶的旁切活性得到快速激活，在核酸检测中可显著提高检测时的信号强度从而减少检测时间、提高检测效率。这些优势使得本发明更加适用于范围更广的核酸片段编辑与检测，为其在基因编辑和检测应用中奠定了基础。
-
公开(公告)号：CN116179513A
公开(公告)日：2023-05-30
申请号：CN202310258665.1
申请日：2023-03-10
Applicant: 之江实验室
IPC: C12N9/22 , C12N15/55 , C12N15/113
Abstract: 本发明公开了一种Cpf1蛋白及其在基因编辑中的应用，涉及生物技术领域。本发明提供了一种新型Cas12a核酸酶，命名为Cas12a‑68蛋白酶，它的PAM识别范围比传统的核酸酶更大，可以识别多种基因的靶点。利用本发明所述的新核酸酶在编辑核酸片段时，可以克服传统的Cas12a的不足，提高PAM的识别范围。这些优势使得本发明更加适用于范围更广的核酸片段编辑，在基因编辑应用中奠定了基础。
-
公开(公告)号：CN117965496A
公开(公告)日：2024-05-03
申请号：CN202410056902.0
申请日：2024-01-15
Applicant: 之江实验室
Abstract: 本发明公开了涉及缺失部分整合酶的可编程核酸酶及其应用，涉及生物技术领域。利用本发明所述的新核酸酶进行细胞内源位点编辑时，可以克服传统的Cas12a内源位点编辑效率低的不足，提高Cas12a系统应用范围。这些优势使得本发明的新Cas12a核酸酶应用范围更广。
-
-
-
-
-
-
-
-
-
Search Results
10
records
(took 0.031 seconds)
