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公开(公告)号:CN116218943A
公开(公告)日:2023-06-06
申请号:CN202111477820.6
申请日:2021-12-06
Applicant: 中国科学院大连化学物理研究所
Abstract: 本发明涉及一种用于筛选儿茶酚类药物靶标的新方法。该方法利用儿茶酚氧化活化后产生的高活性亲电性的邻醌与亲核性氨基酸侧链发生共价反应从而固定药物与靶蛋白的相互作用,再利用苯硼酸特异性结合1,2‑二醇的原理对药靶复合物实现分离富集,富集后的样品通过液质联用系统进行定量分析,以实现儿茶酚类药物的细胞原位靶标筛选与鉴定。本方法无需对药物进行改造,可以实现细胞原位的靶标鉴定,靶标鉴定准确度高、实际应用性强,为天然产物中广泛存在的儿茶酚类小分子的相互作用蛋白的鉴定提供了一种有效的工具。
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公开(公告)号:CN112924562A
公开(公告)日:2021-06-08
申请号:CN201911232113.3
申请日:2019-12-05
Applicant: 中国科学院大连化学物理研究所
Abstract: 本发明涉及一种蛋白质变体的定性定量方法。该方法首先利用离子液体对生物样品进行预处理以实现蛋白质的高效提取,并通过使用多种酶切位点的蛋白酶对提取到的蛋白质进行酶切以提高蛋白质定性定量的序列覆盖度。进一步利用液质联用系统对酶切后的肽段进行深度覆盖的数据采集,利用蛋白质组定量方法进行定量分析,提取不同蛋白质变体的特征性肽段,进而实现蛋白质变体的定性定量分析。本发明能够高灵敏度、高序列覆盖率的实现蛋白质组样品的深度覆盖分析,进而区分不同蛋白质变体并获取定量信息,方法对于分析样品、质谱仪器均具有普适性。
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公开(公告)号:CN112898172A
公开(公告)日:2021-06-04
申请号:CN201911229427.8
申请日:2019-12-04
Applicant: 中国科学院大连化学物理研究所
IPC: C07C231/02 , C07C233/47 , C07D495/04 , C12P13/00
Abstract: 本发明涉及可被羧肽酶酶解的双亲和功能团化合物的合成方法。利用两端带有琥珀酰亚胺基团的化合物与两种带有不同亲和功能团(A,B)的氨基酸衍生物的氨基进行反应,然后对反应产物使用液相色谱进行分离纯化,得到带有两种不同亲和功能团的化合物。该化合物由于其两端都具有羧基和酰胺键,因此可以被羧肽酶酶切。
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公开(公告)号:CN108088945B
公开(公告)日:2020-11-17
申请号:CN201611044507.2
申请日:2016-11-21
Applicant: 中国科学院大连化学物理研究所
IPC: G01N30/88
Abstract: 本发明涉及一种多样品多靶标的高通量精确蛋白质组绝对定量方法。它是利用二甲基化反应标记肽段的N末端和赖氨酸氨基,通过二甲基化标记试剂各种同位素形式有机组合实现待测蛋白和/或肽段样品及已知量目标内标物中的蛋白和/或肽段的多重标记。标记后的样品使用液质联用系统进行分析,提取样品和内标物的二级谱中特征碎片离子峰面积进行定量,得到待测样品目标蛋白的绝对量。该方法分析通量高、大大节约分析时间、标记试剂廉价,实际应用性强、定量准确度高,精密度好,动态范围宽,满足基于内标物的多样品分析或基于标准曲线的多靶标分析的需求。
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公开(公告)号:CN107305172B
公开(公告)日:2019-10-11
申请号:CN201610261894.9
申请日:2016-04-25
Applicant: 中国科学院大连化学物理研究所
Abstract: 本发明涉及一种基于疏水基团修饰的蛋白质N‑端富集方法,包括:蛋白质水平封闭自由氨基、强疏水基团标记、反相材料亲和捕集。蛋白质样品首先在蛋白质水平上采用化学修饰封闭N末端以及侧链的自由氨基,然后对蛋白质进行酶解,并通过新产生的自由氨基于非N端肽段上引入强疏水基团,最后采用反相材料亲和去除带有强疏水基团的非N端肽段,从而得到蛋白质的N端肽段。本发明的优点是标记效率高、去除效率高、选择性高、处理步骤简单、且减少了样品的损失和非特异性吸附。
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公开(公告)号:CN109513431A
公开(公告)日:2019-03-26
申请号:CN201710847377.4
申请日:2017-09-19
Applicant: 中国科学院大连化学物理研究所
Abstract: 本发明涉及一种用于衍生化氨基酸分离的键合β-环糊精的核壳硅胶手性拆分材料及其制备和应用。以亚二微米硅胶微球的核壳硅胶作为基质材料,然后对硅胶微球表面进行β-环糊精的键合,最后将其应用于衍生化氨基酸的手性分离。本发明以亚二微米硅胶微球的核壳硅胶作为基质材料,与传统的基于多孔硅胶微球的材料相比,具有传质速度快、倍压低、分离速度快的优点,对其表面进行β-环糊精的键合后,能有效地对衍生化氨基酸进行手性分离。
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公开(公告)号:CN106645437A
公开(公告)日:2017-05-10
申请号:CN201510726791.0
申请日:2015-10-30
Applicant: 中国科学院大连化学物理研究所
IPC: G01N30/02
Abstract: 本发明涉及一种基于化学修饰改性和同位素标记的多肽氨基酸序列从头测序方法。利用N端和C端标记后的多肽分子质量以及保留时间的相关性,将不同标记的相同多肽的二级质谱图进行关联。利用不同标记样品中多肽在质谱碎裂过程中形成的N端和C端碎片离子对,对多肽氨基酸序列进行从头测序。本发明通过对多肽使用带有正电荷的试剂进行修饰改性,有利于多肽在质谱中碎裂时形成丰富的碎片离子;同时,通过使用含有不同轻重同位素的试剂进行标记,多肽在质谱中碎裂时形成成对存在的碎片离子,易于分辨,从而降低干扰信号的影响,提高碎片离子选择特异性以及从头测序的速度;利用N端和C端碎片离子的互补性,提高多肽测序准确度和效率。
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公开(公告)号:CN104076098B
公开(公告)日:2015-08-19
申请号:CN201310106708.0
申请日:2013-03-29
Applicant: 中国科学院大连化学物理研究所
Abstract: 本发明涉及了一种新的蛋白质定量方法-等重二甲基化标记定量法,该方法利用甲醛和氰基硼氢化钠及其各自的同位素形式进行有机组合,对肽段进行标记,使得肽段在质谱的一级谱上具有相近质荷比而在二级谱上具有不同质荷比,从而在二级谱上实现蛋白质定量分析。该方法相较于其他定量方法,该方法具有定量准确度高,精密度高和动态范围高等优点。
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公开(公告)号:CN104076098A
公开(公告)日:2014-10-01
申请号:CN201310106708.0
申请日:2013-03-29
Applicant: 中国科学院大连化学物理研究所
Abstract: 本发明涉及了一种新的蛋白质定量方法-等重二甲基化标记定量法,该方法利用甲醛和氰基硼氢化钠及其各自的同位素形式进行有机组合,对肽段进行标记,使得肽段在质谱的一级谱上具有相近质荷比而在二级谱上具有不同质荷比,从而在二级谱上实现蛋白质定量分析。该方法相较于其他定量方法,该方法具有定量准确度高,精密度高和动态范围高等优点。
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公开(公告)号:CN112285265B
公开(公告)日:2022-02-01
申请号:CN201910670329.1
申请日:2019-07-24
Applicant: 中国科学院大连化学物理研究所
Abstract: 本发明涉及一种基于镜像酶正交原理的蛋白质甲基化修饰反向富集新方法及应用,包括胰蛋白酶镜像酶(胰蛋白酶N端羧肽酶)酶切甲基化修饰和无甲基化修饰赖氨酸和精氨酸N端肽键、肽段N末端α氨基的选择性标记、trypsin等酶切无甲基化修饰赖氨酸和精氨酸C端肽键、氨基活性材料辅助去除无甲基化修饰肽段及LC‑MS/MS分析。本发明的优点是一种不依赖抗体的蛋白质甲基化富集方法,实现赖氨酸单甲基化修饰、赖氨酸二甲基化修饰、赖氨酸三甲基化修饰、精氨酸单甲基化修饰以及精氨酸二甲基化修饰同时富集。
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