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公开(公告)号：CN114317777A
公开(公告)日：2022-04-12
申请号：CN202210043136.5
申请日：2022-01-14
Applicant: 中国科学院南海海洋研究所 , 华南农业大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/686 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种玉足海参的SSR标记及其扩增引物、检测方法和应用，属于分子标记技术领域。本发明利用二代基因组测序获得的玉足海参序列，开发获得26个具有高度多态性的玉足海参SSR标记，并提供针对上述SSR标记的扩增引物、检测方法。本发明的玉足海参SSR标记及其扩增引物可用于玉足海参遗传多样性分析、亲子鉴定和放流海参溯源，为玉足海参遗传多样性研究、增养殖和增殖放流奠定基础。
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公开(公告)号：CN114317777B
公开(公告)日：2023-09-29
申请号：CN202210043136.5
申请日：2022-01-14
Applicant: 中国科学院南海海洋研究所 , 华南农业大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/686 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种玉足海参的SSR标记及其扩增引物、检测方法和应用，属于分子标记技术领域。本发明利用二代基因组测序获得的玉足海参序列，开发获得26个具有高度多态性的玉足海参SSR标记，并提供针对上述SSR标记的扩增引物、检测方法。本发明的玉足海参SSR标记及其扩增引物可用于玉足海参遗传多样性分析、亲子鉴定和放流海参溯源，为玉足海参遗传多样性研究、增养殖和增殖放流奠定基础。
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公开(公告)号：CN114959093B
公开(公告)日：2025-05-16
申请号：CN202210387875.6
申请日：2022-04-13
Applicant: 中国科学院南海海洋研究所
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/6858 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种半叶马尾藻SSR标记及其扩增引物、检测方法和应用。本发明利用基因组survey测序获得的半叶马尾藻序列，获得14个具有高度多态性SSR标记，编号分别为S12、S16、S24、S31、S33、S39、S41、S53、S58、S72、S74、S85、S108和S143。本发明所述的SSR标记，具有多态性强，杂合度高的特点，在对遗传多样性较低的半叶马尾藻群体进行多样性评估时有极强的优势。本发明的SSR标记扩增引物和检测方法可用于半叶马尾藻种群遗传多样性分析，并在半叶马尾藻种群鉴定方面具有应用前景。
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公开(公告)号：CN119040477A
公开(公告)日：2024-11-29
申请号：CN202411327089.2
申请日：2024-09-23
Applicant: 中国科学院南海海洋研究所 , 广东金阳生物技术有限公司 , 广东粤海饲料集团股份有限公司
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6858 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种南美白对虾亚硝酸盐胁迫相关基因的SNP标记、检测引物及其应用。所述的SNP分子标记位于如SEQ ID NO.2所示序列的283bp位点处，突变类型为C/C纯合和T/C杂合。所述的SNP分子标记为T/C杂合基因型的南美白对虾抗亚硝酸盐能力显著高于C/C杂合基因型。本发明通过发掘与南美白对虾亚硝酸盐抗逆性状相关的SNP标记，并通过应用该标记建立一种用于南美白对虾分子标记辅助亚硝酸盐抗逆育种的方法，加快南美白对虾抗亚硝酸盐优良品种的选育进程。
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公开(公告)号：CN118600035A
公开(公告)日：2024-09-06
申请号：CN202410811563.2
申请日：2024-06-21
Applicant: 中国科学院南海海洋研究所
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6869 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种凡纳滨对虾亚硝酸盐抗逆性状相关基因SNP标记、检测引物及其应用。所述的SNP分子标记位于如SEQ ID NO.2所示CDS序列的402bp位点处，突变类型为C/C纯合、A/A纯合和A/C杂合。所述的SNP分子标记为C/C纯合基因型的凡纳滨对虾抗亚硝酸盐能力显著高于A/A纯合和A/C杂合基因型。本发明通过发掘与凡纳滨对虾抗亚硝酸盐性状相关的SNP标记，并通过应用该标记建立一种用于凡纳滨对虾分子标记辅助抗亚硝酸盐育种的方法，加快凡纳滨对虾抗亚硝酸盐优良品种的选育进程。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN116240308A
公开(公告)日：2023-06-09
申请号：CN202310235532.2
申请日：2023-03-13
Applicant: 中国科学院南海海洋研究所
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/6858 , C12N15/11 , C12R1/645
Abstract: 本发明公开了一种凡纳滨对虾肝肠胞虫抗性性状的组合分子标记、KASP检测引物及应用。该组合分子标记位于凡纳滨对虾基因组未特征化基因LOC113820209上游P358位点和P339位点，其中P358位点为C/T型SNP标记，P339位点为T/C型SNP标记。该组合分子标记采用KASP技术进行检测，当P358位点和P339位点的基因型组合为T/T、C/C时，凡纳滨对虾对肝肠胞虫抗性较强，当P358位点和P339位点的基因型组合为其它类型时，对肝肠胞虫敏感。该组合分子标记、KASP检测引物可用于检测相应位点的基因型，并用于凡纳滨对虾育种材料的筛选，对于促进抗肝肠胞虫对虾育种具有重要意义。
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公开(公告)号：CN115747210A
公开(公告)日：2023-03-07
申请号：CN202211275912.0
申请日：2022-10-18
Applicant: 中国科学院南海海洋研究所
IPC: C12N15/11 , C12Q1/6888 , C12Q1/6851
Abstract: 本发明公开了一种基于环境DNA技术对糙海参监测的探针引物和方法。所述引物的序列为：Hs‑F：5’‑GGAGTAAACTTAACCTTCTTC‑3’，Hs‑R：5’‑GTCTGGGTAGTCTGAATAC‑3’；所述探针的序列为：Hs‑P：5’‑FAM‑ATC(C)CC(G)CT(A)AG(C)CTA‑BHQ1‑3’。本发明方法通过测定不同海域环境下水体中糙海参的拷贝数，并将其与对应的糙海参DNA拷贝数与Ct值的标准曲线和检测下限LOD比较，提供野外糙海参的存在情况，实现监测糙海参的目的，为糙海参的野外分布调查以及相关政策的制订提供技术支撑。
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公开(公告)号：CN114921563A
公开(公告)日：2022-08-19
申请号：CN202210487782.0
申请日：2022-05-06
Applicant: 中国科学院南海海洋研究所
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6858 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种斜带石斑鱼增养殖SSR标记及其检测引物和应用。SSR标记包括ECDSSR‑01、ECDSSR‑02、ECDSSR‑03、ECDSSR‑04、ECDSSR‑05、ECDSSR‑06、ECDSSR‑07和ECDSSR‑08。本发明基于基因组数据开发的SSR标记及引物，该开发的SSR标记比现有技术开发的标记多态性更高，对9个个体进行遗传多样性分析即获得12个以上的等位基因，远高于现有技术对20个个体4～12个等位基因的水平，在对遗传多样性较低的群体(如增殖放流群体)进行评估时具有优势。本发明开发的SSR分子标记可用于斜带石斑鱼遗传多样性分析等领域，为今后斜带石斑鱼种质资源调查、放流效果评估提供理论基础。
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公开(公告)号：CN114891896A
公开(公告)日：2022-08-12
申请号：CN202210432108.2
申请日：2022-04-22
Applicant: 中国科学院南海海洋研究所
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/686 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种用于鉴定凡纳滨对虾特定抗病品系的EST‑SSR标记Lv‑Vp051及其应用，属于分子生物学技术领域。本发明提供了如SEQ ID NO.1～3所示的EST‑SSR标记及其扩增引物。在凡纳滨对虾特定的抗病品系中可以扩增出144bp和145bp的特异条带，而在凡纳滨对虾普通品系中扩增出的条带为150bp。因此本发明的Lv‑Vp051标记可以用于凡纳滨对特定抗病品系的鉴定、遗传多样性评估，以及抗病育种的亲本选择等方面，为今后凡纳滨对虾抗病育种提供理论基础。
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公开(公告)号：CN114891895A
公开(公告)日：2022-08-12
申请号：CN202210432073.2
申请日：2022-04-22
Applicant: 中国科学院南海海洋研究所
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6858 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种用于鉴定凡纳滨对虾特定抗病品系的EST‑SSR标记及其扩增引物和应用，属于分子生物学技术领域。本发明开发出9个具有高度多态性的凡纳滨对虾EST‑STR标记，编号分别为Lv‑Vp052、Lv‑Vp054、Lv‑Vp055、Lv‑Vp058、Lv‑Vp062、Lv‑Vp066、Lv‑Vp075、Lv‑Vp076和Lv‑Vp077，所述EST‑SSR标记多态性强、杂合度高，在对抗病品系和普通品系的评估上具有优势；引物扩增稳定、重复性好，因此本发明的EST‑SSR标记及其扩增引物应可用于凡纳滨对虾抗病品系等种群鉴定、还可以用于遗传多样性分析，还可以用于优良品种的辅助选育。
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