公开(公告)号：CN117925854A

公开(公告)日：2024-04-26

申请号：CN202410067303.9

申请日：2024-01-17

Applicant: 中国科学院南海海洋研究所

Inventor： 陈廷 ,  夏军红 ,  艾春晖 ,  陈小丽 ,  胡超群 ,  任春华 ,  孙彩云 ,  刁德华 ,  李文笙

IPC: C12Q1/6888 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明公开了一种鉴定广东万山群岛斜带石斑鱼原生种的SSR分子标记及其引物组和应用。所述的分子标记ECWS‑01、ECWS‑02、ECWS‑03、ECWS‑04、ECWS‑05、ECWS‑06的核苷酸序列分别如SEQ ID NO.1、SEQ ID NO.2、SEQ ID NO.3、SEQ ID NO.4、SEQ ID NO.5、SEQ ID NO.6所示。该SSR分子标记具有多态性高，但在广东万山群岛原生群体中多态性低且高度保守的特点；可以有效区分广东万山群岛海域斜带石斑鱼原生群体与其他群体。还筛选得到能用于扩增上述SSR分子标记的引物组，该引物扩增稳定、重复性好；同时建立了能鉴定广东万山群岛斜带石斑鱼原生种的方法，通过特有等位基因和聚类树判断待鉴定斜带石斑鱼是否为原生种，解决现有斜带石斑鱼地理种群鉴别不清晰，在增殖放流种苗的原生种亲本难于判别的问题。

公开(公告)号：CN114921563A

公开(公告)日：2022-08-19

申请号：CN202210487782.0

申请日：2022-05-06

Applicant: 中国科学院南海海洋研究所

Inventor： 陈廷 ,  夏军红 ,  胡超群 ,  任春华 ,  孙彩云 ,  艾春晖 ,  刁德华 ,  李文笙

IPC: C12Q1/6888 ,  C12Q1/6858 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明公开了一种斜带石斑鱼增养殖SSR标记及其检测引物和应用。SSR标记包括ECDSSR‑01、ECDSSR‑02、ECDSSR‑03、ECDSSR‑04、ECDSSR‑05、ECDSSR‑06、ECDSSR‑07和ECDSSR‑08。本发明基于基因组数据开发的SSR标记及引物，该开发的SSR标记比现有技术开发的标记多态性更高，对9个个体进行遗传多样性分析即获得12个以上的等位基因，远高于现有技术对20个个体4～12个等位基因的水平，在对遗传多样性较低的群体(如增殖放流群体)进行评估时具有优势。本发明开发的SSR分子标记可用于斜带石斑鱼遗传多样性分析等领域，为今后斜带石斑鱼种质资源调查、放流效果评估提供理论基础。