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公开(公告)号:CN116516029A
公开(公告)日:2023-08-01
申请号:CN202310787007.1
申请日:2023-06-30
Applicant: 中国海洋大学三亚海洋研究院 , 中国海洋大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6837 , C40B40/06
Abstract: 本发明公开了一种金鲳全基因组育种芯片及应用,该芯片的制备方法包括以下步骤:获得金鲳高质量SNP位点;对获得的位点过滤,然后将位点上下游序列与金鲳基因组其他任何区域进行比对,过滤;将金鲳基因组划分为多个独立区域,计算区域内任意两位点的连锁不平衡值;同时根据MAF、SNP与中点的相对位置和突变类型对SNP位点进行过滤;进行全基因组关联分析获得与生长性状显著关联的位点;去除无法设计高质量液相探针的位点,设计探针获得探针池。本发明的芯片位点分布均匀,分型准确性高,重复性强,可为开展金鲳快速生长性状选择等相关遗传育种工作提供可靠的基因分型技术,缩短选育周期,推动选育技术的更新换代,促进水产种业的发展。
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公开(公告)号:CN118313439B
公开(公告)日:2025-02-14
申请号:CN202410463892.2
申请日:2024-04-17
Applicant: 中国海洋大学
IPC: G06N3/096 , G06N3/0464 , G06V20/13 , G06V10/82
Abstract: 本发明公开了一种面向海洋遥感图像分析的并行增量深度学习方法,涉及海洋遥感技术领域。该方法在聚焦图像的相似性的基础上提出了一种易于移植的基于增量裁剪的训练和推理加速框架,可通过共享的相同区域计算达到加速网络计算的效果。此外,由于现有的增量加速技术由共享共同操作所产生的共享收益显然对输入序列的相似性非常敏感,而相似性很大程度上取决于输入顺序,本方案探索了一种新的感知语义差异的排序方法,将其应用到周期性视频序列和图像序列中,并据此展开多种性能优化技术研究。
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公开(公告)号:CN118313439A
公开(公告)日:2024-07-09
申请号:CN202410463892.2
申请日:2024-04-17
Applicant: 中国海洋大学
IPC: G06N3/096 , G06N3/0464 , G06V20/13 , G06V10/82
Abstract: 本发明公开了一种面向海洋遥感图像分析的并行增量深度学习方法,涉及海洋遥感技术领域。该方法在聚焦图像的相似性的基础上提出了一种易于移植的基于增量裁剪的训练和推理加速框架,可通过共享的相同区域计算达到加速网络计算的效果。此外,由于现有的增量加速技术由共享共同操作所产生的共享收益显然对输入序列的相似性非常敏感,而相似性很大程度上取决于输入顺序,本方案探索了一种新的感知语义差异的排序方法,将其应用到周期性视频序列和图像序列中,并据此展开多种性能优化技术研究。
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公开(公告)号:CN113726342B
公开(公告)日:2023-11-07
申请号:CN202111046999.X
申请日:2021-09-08
Applicant: 中国海洋大学
IPC: H03M7/30
Abstract: 本发明公开了一种面向大规模图迭代计算的分段差值压缩与惰性解压方法,涉及高频迭代计算中的大规模图数据压缩技术领域。方法包括基于聚簇分布特性的分段差值压缩过程和基于惰性解压机制的按需解压过程。基于图的出边具有聚簇分布这一特性将邻接表的出边序列按照聚簇进行分段,基于分段差值压缩,设计了按需解压的惰性解压技术,可灵活处理解压问题。对于特定顶点的消息发送只需要找到该分段对应的字典值以及对应的差值就可以完成解压缩过程,无需对边表进行完全解压;而在面对动态变化的图数据时,本方法可以做到直接对变化的顶点数据更新,不需要将整个图数据全部重新排序并压缩。
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公开(公告)号:CN113535528B
公开(公告)日:2023-08-08
申请号:CN202110728761.9
申请日:2021-06-29
Applicant: 中国海洋大学
Abstract: 本发明公开了面向分布式图迭代计算作业的日志管理系统、方法及介质,在分布式图迭代计算作业开始后,在故障发生后进行溯源,利用基于统一时间度量标准的日志增量变化分析溯源方法对故障溯源:持续监控各个节点的日志增量变化情况,以主控节点的时间为基准,判定各个节点日志停止更新的次序,进而给出候选的故障源节点;故障溯源后,程序进行调试中对日志分析进行优化,通过迁移并分布式执行检索命令,收集关键日志信息进行调试;其中,在分布式图迭代计算时,通过增量检索方法实时查看迭代步信息。通过本发明使用户在确定故障源头所在节点之后,能够快速跟踪分析程序运行细节,完成程序调试。
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公开(公告)号:CN112150581B
公开(公告)日:2022-09-30
申请号:CN202010837566.5
申请日:2020-08-19
Applicant: 中国海洋大学
IPC: G06T11/60
Abstract: 本发明公开了一种分布式的自适应图顶点着色方法及系统,包括:分别获取无向图中每个顶点vi的所有邻接顶点在上一次迭代过程中的着色信息集合Ct‑1(vi);对每个顶点vi进行着色冲突判断;其中,对于任一个顶点vi,若满足当前的概率发生器的值rs小于等于第一阈值α并且该顶点vi的着色信息ci∈Ct‑1(vi)并且ci∈Bt(vi),则确定该顶点vi与其邻接顶点产生着色冲突;确定每个顶点vi对应的可用颜色集合U(vi),分别从每个顶点vi对应的可用颜色集合U(vi)中根据第二阈值β随机选择一个颜色,确定每个顶点vi的着色信息ci;对于每个顶点vi,沿边向其所有邻接顶点vj发送其着色信息ci;若满足每个顶点vi的着色信息和其所有邻接顶点的颜色均不同,则确定所述无向图中每个顶点的着色信息。
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公开(公告)号:CN108823289B
公开(公告)日:2021-05-07
申请号:CN201810589606.1
申请日:2018-06-08
Applicant: 中国海洋大学
IPC: C12Q1/6841
Abstract: 本发明公开了一种不依赖荧光检测杂交信号的鱼类染色体原位杂交液,由去离子甲酰胺,2xSSC缓冲液,聚氧乙烯失水山梨醇单月桂酸酯,酵母总RNA,封闭试剂,乙二胺四乙酸,硫酸葡聚糖,柠檬酸三钠,磷酸氢二钠,焦碳酸二乙酯处理后的水,变性后的探针与去离子甲酰胺混合液按一定比例配置成的。应用本发明的杂交液可以使染色体原位杂交技术不依赖于荧光检测,使用普通显微镜就可以观察到荧光信号,而且试剂配制和存放便捷,杂交结果观察、拍照方便,杂交材料可以长期存放,实验过程更加简单易于操作,极大的扩大了鱼类染色体原位杂交的应用范围。
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公开(公告)号:CN105504044B
公开(公告)日:2019-01-18
申请号:CN201610063622.8
申请日:2016-01-29
Applicant: 中国海洋大学
Abstract: 本发明的目的是提供一种牙鲆CD59抗菌肽的重组表达及纯化复性的方法,本发明针对现阶段技术中抗菌肽的合成成本高、工序复杂、合成产量低等不足,本发明利用基因克隆技术获得牙鲆CD59基因成熟肽的编码序列,构建表达载体,转化入表达菌株进行原核表达,后经纯化复性获得有活性的牙鲆CD59抗菌肽。此发明具体可作为饲料添加剂、兽药、防腐剂等应用于水产养殖业。或作为抗生素的替代品用于生物的病害防治。
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公开(公告)号:CN108774632A
公开(公告)日:2018-11-09
申请号:CN201810639551.0
申请日:2018-06-20
Applicant: 中国海洋大学
IPC: C12N15/113 , C12N15/85
Abstract: 本发明的目的在于提供一种优化的牙鲆鱼β-肌动蛋白启动子,本发明将在牙鲆中广泛表达的β-肌动蛋白的启动子进行优化进而获得启动效率更强的重组启动子表达载体eGFP-优β-肌动蛋白。并且这一新的载体可使外源基因有效转入牙鲆不同细胞系,为鲆鲽鱼类基因功能的研究提供了一种新的途径和方法,为解决鲆鲽鱼类细胞瞬时转染效率低提供一种有效的可行的载体,为在细胞水平研究分析基因功能提供高效的手段,为鲆鲽鱼类分子水平遗传育种工作提供了新的技术方法。
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公开(公告)号:CN102168145B
公开(公告)日:2013-10-09
申请号:CN201110100676.4
申请日:2011-04-21
Applicant: 中国海洋大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明涉及一种荧光原位杂交技术检测半滑舌鳎的性染色体组成的方法。其特征在于,用于原位杂交的探针为含有半滑舌鳎雌性特异DNA片段的fosmid或BAC克隆,在雌性半滑舌鳎的一个细胞或一个染色体分裂相中有一个荧光信号,而在超雌半滑舌鳎的一个细胞或一个染色体分裂相中有两个荧光信号。本发明对半滑舌鳎的细胞或染色体分裂相进行荧光原位杂交分析,通过观察杂交信号分辨半滑舌鳎的性染色体组成,是一种有效的鉴定半滑舌鳎雌性个体和尤其是超雌个体的技术,为利用染色体操作技术进行半滑舌鳎全雌育种的研究提供技术手段。
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