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公开(公告)号:CN111378765B
公开(公告)日:2022-06-17
申请号:CN202010324033.7
申请日:2020-04-22
Applicant: 中国水产科学研究院珠江水产研究所
IPC: C12Q1/6888 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种速生草鱼个体的分子标记及其检测方法。本发明公开了与草鱼快速生长调控有关的SNP标记。若该SNP标记位点是AA基因型,则为快速生长的草鱼;否则为缓慢生长的草鱼。应用该SNP标记及检测方法,在生产中筛选到AA基因型草鱼个体,用作草鱼亲本进行繁殖,可生产出具有生长优势的草鱼苗种。而且本发明中的方法操作简单、检测快速、检测成本低,便于广泛推广使用。
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公开(公告)号:CN113637765A
公开(公告)日:2021-11-12
申请号:CN202110804834.8
申请日:2021-07-16
Applicant: 中国水产科学研究院珠江水产研究所
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6879 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了鉴定大口黑鲈遗传性别的分子标记及应用,分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示。本发明从大口黑鲈中筛选获得了性别差异的DNA片段,将基因组序列为SEQ ID NO:1的SNP分子标记用于大口黑鲈遗传性别鉴定,并根据差异的片段设计检测引物,从而可以快速、准确的区分大口黑鲈的性别。利用本发明的SNP位点,在生产上可快速对大口黑鲈遗传进行鉴定,在大口黑鲈单性育种方面具有重要的应用价值,同时在定位性别决定基因及性别决定机制研究中也具有重要应用前景。与之前解剖检测或生殖孔观察相比,该技术具有目的性强、准确度高的优点,且操作简单、检测快速,对鱼体伤害少,易于推广。
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公开(公告)号:CN106701931B
公开(公告)日:2020-09-18
申请号:CN201611155670.6
申请日:2016-12-14
Applicant: 中国水产科学研究院珠江水产研究所
IPC: C12Q1/6888 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了与大口黑鲈“优鲈1号”快速生长相关的SNP标记及其应用。所述SNP标记分别如SEQ ID NO.1、SEQ ID NO.2或SEQ ID NO.3所示;所述SEQ ID NO.1自5’端起第658位碱基为C或A,CC个体的生长速度显著高于AA个体;所述SEQ ID NO.2自5’端起第327位碱基为A或G,AA个体的生长速度显著高于GG个体;所述SEQ ID NO.3自5’端起第121位碱基为A或G,AA个体的生长速度显著高于GG个体。本发明所发现的3个SNP标记的应用,可大大降低大口黑鲈“优鲈1号”亲本筛选的盲目性,可以快速获得生长速度快且遗传稳定的大口黑鲈个体。
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公开(公告)号:CN111378765A
公开(公告)日:2020-07-07
申请号:CN202010324033.7
申请日:2020-04-22
Applicant: 中国水产科学研究院珠江水产研究所
IPC: C12Q1/6888 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种速生草鱼个体的分子标记及其检测方法。本发明公开了与草鱼快速生长调控有关的SNP标记。若该SNP标记位点是AA基因型,则为快速生长的草鱼;否则为缓慢生长的草鱼。应用该SNP标记及检测方法,在生产中筛选到AA基因型草鱼个体,用作草鱼亲本进行繁殖,可生产出具有生长优势的草鱼苗种。而且本发明中的方法操作简单、检测快速、检测成本低,便于广泛推广使用。
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公开(公告)号:CN111073983A
公开(公告)日:2020-04-28
申请号:CN202010065650.X
申请日:2020-01-20
Applicant: 中国水产科学研究院珠江水产研究所 , 广东梁氏水产种业有限公司
IPC: C12Q1/6888 , C12N15/12
Abstract: 本发明公开了一种与大口黑鲈北方亚种和佛罗里达亚种鉴定相关的SNP标记及其应用,本发明SNP标记由位于大口黑鲈NCCRP-1基因的基因组序列SEQ ID NO:1的第202位的SNP位点,以及第76位和第132-133位碱基处的插入缺失突变位点组成,这三个位点完全连锁。利用本发明的SNP位点,具有目的性强、准确度高的优点,且操作简单、检测快速,便于广泛推广使用,快速对大口黑鲈北方亚种和佛罗里达亚种进行鉴定,为原种保留、种质提高提供可靠依据。
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公开(公告)号:CN110041422A
公开(公告)日:2019-07-23
申请号:CN201810037972.6
申请日:2018-01-16
Applicant: 中国水产科学研究院珠江水产研究所
IPC: C07K14/46
Abstract: 本发明公开了大口黑鲈生长相关的SNP位点及其应用,所述生长相关的SNP位点位于HSC70-1基因序列第821、2804位碱基。本发明发现在HSC70-1的C+821G位置存在等位基因C和等位基因G,组成三种基因型CC、GC和GG,在A+2804T位置存在等位基因A和等位基因T,组成三种基因型AA、AT和TT。当第821和2804碱基位置基因型为CC和TT的个体的生长性状明显优于其他基因型的个体。利用该现象将生产中保留CC和TT基因型的大口黑鲈亲本,去除其他基因型的个体,便可快速获得生长速度快且遗传稳定的大口黑鲈品种,即本发明SNP位点可应用于快速生长大口黑鲈亲本的筛选。
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公开(公告)号:CN103993081B
公开(公告)日:2015-11-04
申请号:CN201410209290.0
申请日:2014-05-16
Applicant: 中国水产科学研究院珠江水产研究所 , 佛山市南海百容水产良种有限公司
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明一种鉴别雌核发育草鱼与普通草鱼的方法,提供一种具有多态性高、遗传稳定、检测成功率高、便于广泛使用等优点的分子标记方法,能够快速准确地鉴别雌核发育草鱼与普通草鱼。根据遗传纯合度的差异,从14个SSR标记中筛选出了5个在雌核发育群体与野生群体中扩增稳定、条带清晰、多态性和遗传纯合度差异较大SSR。由于雌核发育群体中遗传纯合度大大提高,SSR在其体内扩增的等位基因数目也会减少。统计分析发现,这5个SSR在普通草鱼体内扩增的实际等位基因数目为8-10个,而在雌核发育草鱼体内扩增的等位基因数目为5-7个,通过比较等位基因数即可鉴别雌核发育草鱼与普通草鱼,其准确率的理论值可达99.92%。
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公开(公告)号:CN102127599A
公开(公告)日:2011-07-20
申请号:CN201010605062.7
申请日:2010-12-26
Applicant: 中国水产科学研究院珠江水产研究所
IPC: C12Q1/68
Abstract: 快速生长的大口黑鲈微卫星标记筛选及其应用,属于鱼类分子生物学DNA标记技术与应用领域,具体涉及快速生长的大口黑鲈微卫星标记筛选,及利用这些标记辅助大口黑鲈快速生长品系的选育工作。筛选到5个与大口黑鲈生长性状紧密相关的等位基因,并建立一种快速、准确、有效地利用分子标记检测大口黑鲈优良个体的方法,以早期鉴定出具有优良性状的个体,为筛选优良亲本提供参考。利用本方法将生产中同时具有这5个优势等位基因的个体选作亲本,有目的的选择优良种质,从而保证后代种质优良,可提高生长速度。该方法与传统的方法相比,具有目的性强,作用效果直接的优点。且操作简单、检测快速、检测成本低,便于广泛推广使用。
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公开(公告)号:CN101838706A
公开(公告)日:2010-09-22
申请号:CN200910214303.2
申请日:2009-12-29
Applicant: 中国水产科学研究院珠江水产研究所
Abstract: 本发明提供一种大口黑鲈溃疡综合症病毒聚合酶链式反应PCR检测法,将大口黑鲈溃疡病毒MCP基因序列与已知的虹彩病毒MCP基因序列比较,设计并合成如下引物:P1:5’-TCTGTTACGGGTTCTGGCATC-3’,P2:5’-CCAGCCAAGAGTTGAGCACAT-3’,预期扩增片段241bp,经模板DNA提取,PCR反应,琼脂糖凝胶电泳检测,在PCR反应进行到30个循环时即可检测到质粒最小浓度是104拷贝数/μL,具有检测快速、精度高、成本低的技术特点,适用于大范围推广应用。
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公开(公告)号:CN118931966A
公开(公告)日:2024-11-12
申请号:CN202411149488.4
申请日:2024-08-21
Applicant: 中国水产科学研究院珠江水产研究所
IPC: C12N15/85 , C12N15/12 , A01K67/0275 , C12Q1/6888
Abstract: 本发明属于水产生物育种技术领域,具体涉及GYK对大口黑鲈糖稳态的调节作用及其InDel标记的应用。本发明以大口黑鲈全基因组数据为基础,先克隆了GYK基因及其转录调节因子FOXQ1的序列,并分析其在糖稳态调节过程中的表达模式;然后利用碱基突变和双荧光素酶报告基因系统验证FOXQ1对GYK的转录调控,并通过基因过表达和敲降技术证明FOXQ1通过转录调控GYK可有效调节大口黑鲈糖稳态。在此基础上筛选并验证了GYK基因中在高碳水化合物日粮饲喂下与大口黑鲈生长相关的InDel标记。本发明为揭示大口黑鲈糖稳态调节机制奠定了基础,为创制或选育适应高碳水化合物饲料的大口黑鲈新种质提供了基因资源和理论依据。
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