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公开(公告)号:CN108795960B
公开(公告)日:2021-10-19
申请号:CN201810647877.8
申请日:2018-06-22
Applicant: 中国医学科学院药用植物研究所
Abstract: 本发明公开了一条主要参与合成丹参次生代谢产物姜烯等多种倍半萜合成的萜类合酶基因序列(SmTPS3);本发明所提供的SmTPS3基因具有SEQ ID No.1所示的核苷酸序列,所述基因编码的蛋白质具有SEQ ID No.2所示的氨基酸序列。本发明基于丹参的基因组和转录组数据获得SmTPS3基因序列,通过构建pET28a‑SmTPS3原核表达载体,在大肠杆菌体内检测SmTPS3的催化产物,验证SmTPS3的基因功能。研究结果表明,SmTPS3具有催化合成多种倍半萜类化合物的功能。本发明提供的SmTPS3具有催化产生姜烯、α‑佛手柑油烯、β‑倍半水芹烯等多种倍半萜类化合物的功能。姜烯具有抗病毒、抗生育、抗溃疡等多种活性,还可作为食品调味剂和化妆品的原料;佛手柑精油在缓解焦虑、抑郁等情绪中具有良好疗效。本发明为基于丹参萜类合酶基因合成倍半萜类化合物的研究奠定基础,促进基于SmTPS3催化合成的产物——姜烯、α‑佛手柑油烯等倍半萜类化合物的药物研发和产业开发。
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公开(公告)号:CN108795914A
公开(公告)日:2018-11-13
申请号:CN201810647878.2
申请日:2018-06-22
Applicant: 中国医学科学院药用植物研究所
CPC classification number: C12N9/88 , C12N15/70 , C12P5/007 , C12Y402/03
Abstract: 本发明公开了一条参与合成丹参次生代谢产物α‑金合欢烯的萜类合酶基因序列(SmTPS12);本发明所提供的SmTPS12基因具有SEQ ID No.1所示的核苷酸序列,所述基因编码的蛋白质具有SEQ ID No.2所示的氨基酸序列。本发明基于丹参基因组信息获得SmTPS12基因序列,通过构建pGEX‑4T‑1‑SmTPS12原核表达载体并转化大肠杆菌,在大肠杆菌体内检测其催化产物,研究SmTPS12的生物学功能。结果表明SmTPS12具有催化合成α‑金合欢烯等化合物的功能。α‑金合欢烯可以作为柴油和化学品生产的前体化合物;广泛用于皂用、洗涤剂香精中和日化香精中。本发明为丹参功能性代谢化合物关联基因基因奠定研究基础,有利于开发商业开发和生物防治。
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公开(公告)号:CN113106164B
公开(公告)日:2022-08-09
申请号:CN202010030602.7
申请日:2020-01-13
Applicant: 中国医学科学院药用植物研究所
IPC: C12Q1/6895 , C12N15/11
Abstract: 本发明提供一种预测丹参花色的SNP分子标记及其应用。基于丹参基因组F3′5′H基因的全长cDNA序列,所述SNP分子标记位点在该基因序列的1230bp位点;本发明还提供一种用于检测所述分子标记的引物和使用所述分子标记预测丹参花色的方法及其应用。使用基于该基因设计的全长扩增引物对,从逆转录获得的cDNA模板中扩增基因全长,经测序证明该引物能特异性的扩增F3′5′H的正确序列。经过序列对比,筛选而得到与丹参花色性状相关的SNP位点。本发明所述的分子标记与丹参花色具有显著关联性,基于所述分子标记的本发明技术能方便快捷检测丹参花色,用于判断丹参花色,紫花丹参F3′5′H基因参考序列的1230bp处的碱基为C,与此相比,白花丹参中的该基因对应位置的变异碱基为T,浅紫花丹参在该为点可为C或T。通过该SNP分子标记,可以快捷地对丹参花色性状进行鉴定,适用于以丹参花色为育种目标的丹参的种植与选育。
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公开(公告)号:CN108795914B
公开(公告)日:2021-11-05
申请号:CN201810647878.2
申请日:2018-06-22
Applicant: 中国医学科学院药用植物研究所
Abstract: 本发明公开了一条参与合成丹参次生代谢产物α‑金合欢烯的萜类合酶基因序列(SmTPS12);本发明所提供的SmTPS12基因具有SEQ ID No.1所示的核苷酸序列,所述基因编码的蛋白质具有SEQ ID No.2所示的氨基酸序列。本发明基于丹参基因组信息获得SmTPS12基因序列,通过构建pGEX‑4T‑1‑SmTPS12原核表达载体并转化大肠杆菌,在大肠杆菌体内检测其催化产物,研究SmTPS12的生物学功能。结果表明SmTPS12具有催化合成α‑金合欢烯等化合物的功能。α‑金合欢烯可以作为柴油和化学品生产的前体化合物;广泛用于皂用、洗涤剂香精中和日化香精中。本发明为丹参功能性代谢化合物关联基因基因奠定研究基础,有利于开发商业开发和生物防治。
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公开(公告)号:CN113106164A
公开(公告)日:2021-07-13
申请号:CN202010030602.7
申请日:2020-01-13
Applicant: 中国医学科学院药用植物研究所
IPC: C12Q1/6895 , C12N15/11
Abstract: 本发明提供一种预测丹参花色的SNP分子标记及其应用。基于丹参基因组F3′5′H基因的全长cDNA序列,所述SNP分子标记位点在该基因序列的1230bp位点;本发明还提供一种用于检测所述分子标记的引物和使用所述分子标记预测丹参花色的方法及其应用。使用基于该基因设计的全长扩增引物对,从逆转录获得的cDNA模板中扩增基因全长,经测序证明该引物能特异性的扩增F3′5′H的正确序列。经过序列对比,筛选而得到与丹参花色性状相关的SNP位点。本发明所述的分子标记与丹参花色具有显著关联性,基于所述分子标记的本发明技术能方便快捷检测丹参花色,用于判断丹参花色,紫花丹参F3′5′H基因参考序列的1230bp处的碱基为C,与此相比,白花丹参中的该基因对应位置的变异碱基为T,浅紫花丹参在该为点可为C或T。通过该SNP分子标记,可以快捷地对丹参花色性状进行鉴定,适用于以丹参花色为育种目标的丹参的种植与选育。
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公开(公告)号:CN108893482A
公开(公告)日:2018-11-27
申请号:CN201810647879.7
申请日:2018-06-22
Applicant: 中国医学科学院药用植物研究所
Abstract: 本发明公开了一条主要催化合成丹参中倍半萜类化合物反式橙花叔醇和单萜类化合物桧烯、β-月桂烯等的萜类合酶基因序列(SmTPS8);本发明所提供的SmTPS8基因具有SEQ ID No.1所示的核苷酸序列,所述基因编码蛋白质具有SEQ ID No.2所示的氨基酸序列。本发明利用获得的SmTPS8基因序列,通过检测该基因的催化产物,验证基因功能。结果表明SmTPS8在丹参转基因植株中主要具有单萜合酶活性,而在大肠杆菌中主要具有倍半萜合酶活性。反式橙花叔醇([E]-nerolidol)具有较强的香气和生物活性,是医药、食品、香料和化妆品工业的重要原料。本发明为基于SmTPS8基因功能的丹参萜类次生代谢途径研究奠定基础,有利于开发SmTPS8催化合成的倍半萜化合物、单萜类化合物在医药、香料以及生物防治方面的商业用途。
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公开(公告)号:CN108795915A
公开(公告)日:2018-11-13
申请号:CN201810647880.X
申请日:2018-06-22
Applicant: 中国医学科学院药用植物研究所
CPC classification number: C12N9/88 , C12N15/70 , C12P5/002 , C12Y402/03
Abstract: 本发明公开了一条参与合成丹参次生代谢产物——β‑榄香烯的萜类合酶基因序列(SmTPS21);本发明所提供的SmTPS21基因具有SEQ ID No.1所示的核苷酸序列,所述基因编码的蛋白质具有SEQ ID No.2所示的氨基酸序列。本发明基于丹参基因组注释数据获得SmTPS21基因,通过构建pET28a‑SmTPS21原核表达载体,在大肠杆菌(Escherichia coli,E.coli)体内验证SmTPS21的催化功能,结果证明SmTPS21酶具有主要催化合成β‑榄香烯等倍半萜类化合物的功能。本实验提供的SmTPS21具有在E.coli中主要催化产生β‑榄香烯化合物的功能。已有研究表明β‑榄香烯具有直接杀伤肿瘤细胞或干扰肿瘤细胞生长代谢的功能。本发明为开展丹参萜类合酶基因功能鉴定及应用SmTPS21催化生产β‑榄香烯的研究奠定基础,有利于促进医药产品研发。
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公开(公告)号:CN108893482B
公开(公告)日:2021-11-05
申请号:CN201810647879.7
申请日:2018-06-22
Applicant: 中国医学科学院药用植物研究所
Abstract: 本发明公开了一条主要催化合成丹参中倍半萜类化合物反式橙花叔醇和单萜类化合物桧烯、β‑月桂烯等的萜类合酶基因序列(SmTPS8);本发明所提供的SmTPS8基因具有SEQ ID No.1所示的核苷酸序列,所述基因编码蛋白质具有SEQ ID No.2所示的氨基酸序列。本发明利用获得的SmTPS8基因序列,通过检测该基因的催化产物,验证基因功能。结果表明SmTPS8在丹参转基因植株中主要具有单萜合酶活性,而在大肠杆菌中主要具有倍半萜合酶活性。反式橙花叔醇([E]‑nerolidol)具有较强的香气和生物活性,是医药、食品、香料和化妆品工业的重要原料。本发明为基于SmTPS8基因功能的丹参萜类次生代谢途径研究奠定基础,有利于开发SmTPS8催化合成的倍半萜化合物、单萜类化合物在医药、香料以及生物防治方面的商业用途。
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公开(公告)号:CN108893483B
公开(公告)日:2021-09-17
申请号:CN201810648181.7
申请日:2018-06-22
Applicant: 中国医学科学院药用植物研究所
Abstract: 本申请公开了一条主要参与合成丹参挥发性产物石竹烯等多种倍半萜的萜类合酶基因序列(SmTPS11);本申请提供的SmTPS11基因具有SEQ ID No.1所示的核苷酸序列以及SEQ ID No.2所示的氨基酸序列。基于丹参基因组和转录组数据获得SmTPS11基因,通过构建pET28a‑SmTPS11原核表达载体,在大肠杆菌体内检测SmTPS11的催化产物,验证SmTPS11的功能。结果证明SmTPS11具有催化合成石竹烯等多种倍半萜的功能。SmTPS11具有催化产生丹参石竹烯的功能。本申请为明确丹参中挥发性成分石竹烯合成的分子机制奠定基础,有利于利用SmTPS11进行定向且大量合成石竹烯,用于开发该化合物的商业用途及其在生物防治方面的应用。
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公开(公告)号:CN108795915B
公开(公告)日:2021-09-17
申请号:CN201810647880.X
申请日:2018-06-22
Applicant: 中国医学科学院药用植物研究所
Abstract: 本发明公开了一条参与合成丹参次生代谢产物——β‑榄香烯的萜类合酶基因序列(SmTPS21);本发明所提供的SmTPS21基因具有SEQ ID No.1所示的核苷酸序列,所述基因编码的蛋白质具有SEQ ID No.2所示的氨基酸序列。本发明基于丹参基因组注释数据获得SmTPS21基因,通过构建pET28a‑SmTPS21原核表达载体,在大肠杆菌(Escherichia coli,E.coli)体内验证SmTPS21的催化功能,结果证明SmTPS21酶具有主要催化合成β‑榄香烯等倍半萜类化合物的功能。本实验提供的SmTPS21具有在E.coli中主要催化产生β‑榄香烯化合物的功能。已有研究表明β‑榄香烯具有直接杀伤肿瘤细胞或干扰肿瘤细胞生长代谢的功能。本发明为开展丹参萜类合酶基因功能鉴定及应用SmTPS21催化生产β‑榄香烯的研究奠定基础,有利于促进医药产品研发。
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