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公开(公告)号:CN113736906A
公开(公告)日:2021-12-03
申请号:CN202111164297.1
申请日:2021-09-30
Applicant: 中国农业科学院深圳农业基因组研究所 , 中国农业科学院农业基因组研究所
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/6858 , C12N15/11
Abstract: 本发明涉及植物生物技术领域,具体涉及一种用于检测番茄黄萎病抗性的SNP位点组合及其应用。基于此,本发明开发了一种能够快速、直观且有效鉴定目标SNP位点基因型状态的引物组合、试剂盒以及检测方法。应用本发明可实现对番茄黄萎病抗性基因Ve1和Ve2区段单倍型的快速、精准和高通量检测,具有操作简单、成本低廉、可自动化、通量效率高、标记稳定、安全无毒无害等优点,可以在番茄苗期快速、准确和高通量的进行番茄黄萎病抗性鉴定,降低人工接种鉴定和田间移栽工作量,提高育种效率、降低育种成本、加速育种进程,非常适合现代商业化育种应用及大规模遗传改良研究。
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公开(公告)号:CN110938120A
公开(公告)日:2020-03-31
申请号:CN201911230001.4
申请日:2019-12-04
Applicant: 中国农业科学院农业基因组研究所 , 中国农业科学院深圳农业基因组研究所
IPC: C07K14/415 , C12N15/29 , C12N15/113 , C12N15/11 , C12N15/82 , A01H5/00 , A01H1/02 , A01H6/82
Abstract: 本发明提供了一种改变二倍体马铃薯材料自交不亲和性的StSCI蛋白,所述StSCI蛋白的氨基酸序列包含或由如下序列组成:1)SEQ ID NO.1所示的氨基酸序列;或,2)与SEQ ID NO.1所示的氨基酸序列具有至少95%序列同一性的功能性同源序列;或3)在SEQ ID NO.1所示的氨基酸序列中添加、缺失、替换一个或多个(例如1-10个)氨基酸且具有抑制自交不亲和活性的蛋白质。本发明的优点在于,StSCI蛋白可以抑制多种类型S-RNase的细胞毒性作用,具有遗传性,从根本上克服了二倍体马铃薯自交不亲和的缺陷,有利于实现二倍体马铃薯高代纯合自交系的培育。
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公开(公告)号:CN116814673A
公开(公告)日:2023-09-29
申请号:CN202310437293.9
申请日:2023-04-20
Applicant: 中国农业科学院农业基因组研究所 , 中国农业科学院深圳农业基因组研究所
IPC: C12N15/82 , A01H5/00 , A01H6/82 , C12N5/10 , C12Q1/6895 , C12N15/11 , A23K10/30 , A23K10/37 , A23L19/00 , A23L21/20 , A23L25/00 , A23L29/00 , A61K36/81
Abstract: 本发明涉及植物分子育种技术领域,特别涉及调控番茄果实可溶性固形物含量的基因组结构变异及相关产品和应用。该基因组结构变异为如下序列中的至少一种:SEQ ID NO:1和/或SEQ ID NO:2所示的核苷酸序列;上述序列的互补序列、简并序列或同源序列;在严紧条件下与上述序列杂交的核苷酸序列或其互补序列;gDNA序列。上述基因组结构变异丰富和完善了现有控制番茄果实SSC相关的关键遗传变异信息,为SSC遗传分子调控机制等基础理论研究提供了新的证据或方向,同时为SSC等番茄果实品质、产量育种改良等应用研究提供了新的支撑。
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公开(公告)号:CN113699273B
公开(公告)日:2022-11-15
申请号:CN202111160757.3
申请日:2021-09-30
Applicant: 中国农业科学院深圳农业基因组研究所 , 中国农业科学院农业基因组研究所
IPC: C12Q1/6895 , C12N15/11
Abstract: 本发明涉及植物生物技术领域,具体涉及一种用于检测番茄根结线虫抗性的SNP位点组合及其应用。基于此,本发明开发了一种能够快速、直观且有效鉴定目标SNP位点基因型状态的引物组合、试剂盒以及检测方法。应用本发明可实现对番茄根结线虫抗性基因Mi‑1区段单倍型的快速、精准和高通量检测,具有操作简单、成本低廉、可自动化、通量效率高、标记稳定、安全无毒无害等优点,可以在番茄苗期快速、准确和高通量的进行番茄根结线虫抗性鉴定,降低人工接种鉴定和田间移栽工作量,提高育种效率、降低育种成本、加速育种进程,非常适合现代商业化育种应用及大规模遗传改良研究。
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公开(公告)号:CN109750061B
公开(公告)日:2022-06-03
申请号:CN201910108556.5
申请日:2019-01-18
Applicant: 中国农业科学院农业基因组研究所 , 中国农业科学院深圳农业基因组研究所
IPC: C12N15/82 , C12N9/22 , A01H5/00 , A01H6/82 , C12Q1/6895
Abstract: 本发明公开的一种克服二倍体马铃薯自交不亲和的方法,包括(1)选取靶标片段;(2)构建基因打靶的重组载体;(3)实现细胞内S‑RNase基因的功能缺失突变;(4)再生若干个马铃薯植株;(5)特异性扩增再生植株中S‑RNase基因包含靶标片段的DNA区段;(6)选择S‑RNase基因被编辑的再生植株;(7)对所选基因编辑植株进一步筛选出二倍体的基因编辑株系;(8)扩繁并定植所选基因编辑株系,于开花期进行自交亲和性表型鉴定;(9)对收获自交亲和性植株后代扩增产物测序,检测被编辑靶标基因在后代的遗传和分离。本发明的优点在于,找到一种简便、精准、高效的方法克服二倍体马铃薯自交不亲和。
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公开(公告)号:CN113736907A
公开(公告)日:2021-12-03
申请号:CN202111164308.6
申请日:2021-09-30
Applicant: 中国农业科学院深圳农业基因组研究所 , 中国农业科学院农业基因组研究所
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/6858 , C12N15/11
Abstract: 本发明涉及植物生物技术领域,具体涉及一种用于检测番茄灰叶斑病抗性的SNP位点组合及其应用。基于此,本发明开发了一种能够快速、直观且有效鉴定目标SNP位点基因型状态的引物组合、试剂盒以及检测方法。应用本发明可实现对番茄灰叶斑病抗性基因Sm区段单倍型的快速、精准和高通量检测,具有操作简单、成本低廉、可自动化、通量效率高、标记稳定、安全无毒无害等优点,可以在番茄苗期快速、准确和高通量的进行番茄灰叶斑病抗性鉴定,降低人工接种鉴定和田间移栽工作量,提高育种效率、降低育种成本、加速育种进程,非常适合现代商业化育种应用及大规模遗传改良研究。
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公开(公告)号:CN113736866A
公开(公告)日:2021-12-03
申请号:CN202111164271.7
申请日:2021-09-30
Applicant: 中国农业科学院农业基因组研究所 , 中国农业科学院深圳农业基因组研究所
IPC: C12Q1/6858 , C12Q1/6895 , C12N15/11
Abstract: 本发明涉及植物生物技术领域,具体涉及一种用于检测番茄黄化曲叶病毒病抗性的SNP位点组合及其应用。基于此,本发明开发了一种能够快速、直观且有效鉴定目标SNP位点基因型状态的引物组合、试剂盒以及检测方法。应用本发明可实现对番茄黄化曲叶病毒病抗性基因Ty‑1/Ty‑3和Ty‑2区段单倍型的快速、精准和高通量检测,具有操作简单、成本低廉、可自动化、通量效率高、标记稳定、安全无毒无害等优点,可以在番茄苗期快速、准确和高通量的进行番茄黄化曲叶病毒病抗性鉴定,降低人工接种鉴定和田间移栽工作量,提高育种效率、降低育种成本、加速育种进程,非常适合现代商业化育种应用及大规模遗传改良研究。
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公开(公告)号:CN113462803A
公开(公告)日:2021-10-01
申请号:CN202110880403.X
申请日:2021-08-02
Applicant: 青岛农业大学 , 中国农业科学院农业基因组研究所
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/6858 , C12N15/11 , C40B50/06
Abstract: 本发明公开了一套基于多重PCR测序的黄瓜全基因组背景选择SNP标记系统及其应用,涉及遗传育种技术领域。本发明利用生物信息学方法从大量黄瓜种质资源基因组数据中挑选出518个多态性高、通用性好且分布均匀的单拷贝SNP标记,该套SNP标记系统能够用于黄瓜DNA指纹数据库构建、种质资源鉴定、亲缘关系分析、种子纯度检测及遗传初定位当中。本发明所述SNP标记的参考基因组版本号为Cucumber(Chinese Long)v2,利用多重PCR测序技术对该套SNP标记系统进行分型,检测的准确度和分辨率均很高,实现了高通量、低成本、自动化安全检测,将来可用于分子遗传育种工作当中。
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公开(公告)号:CN110195068A
公开(公告)日:2019-09-03
申请号:CN201910542612.6
申请日:2019-06-21
Applicant: 中国农业科学院农业基因组研究所 , 中国农业科学院深圳农业基因组研究所
IPC: C12N15/29 , C07K14/415 , C12Q1/6895 , C12N15/11
Abstract: 本发明提供用于鉴定银杏雌雄株的多核苷酸,其包含或由如下序列组成:1)SEQ ID NO:5所示的核苷酸序列;或2)SEQ ID NO:5所示序列的互补序列、简并序列或同源序列;或3)在严紧条件下与SEQ ID NO:5所示的核苷酸序列杂交的多核苷酸或其互补序列;4)所述序列1)-3)中任一序列的编码序列;或5)与序列1)-4)中任一序列中的连续10bp以上核苷酸相同的核苷酸序列。本发明所提供的多核苷酸在雄性银杏植株中特有,利用其鉴定银杏的雌雄株,具有结果稳定准确、重复性好、检测快速的优点,为利用分子标记鉴别银杏雌雄提供依据。
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公开(公告)号:CN120005895A
公开(公告)日:2025-05-16
申请号:CN202311525475.8
申请日:2023-11-15
Applicant: 中国农业科学院深圳农业基因组研究所(岭南现代农业科学与技术广东省实验室深圳分中心) , 中国农业科学院农业基因组研究所
IPC: C12N15/29 , C07K14/415 , C12N15/113 , C12N15/84 , A01H5/10 , A01H5/00 , A01H6/82 , C12Q1/6895
Abstract: 本申请涉及基因分离和植物改良技术领域,具体涉及晚疫病抗性基因、生物材料及应用。本发明提供的Rpi‑HMA13核酸分子包含:SEQ ID NO:1所示的核苷酸序列;SEQ ID NO:2所示的核苷酸序列;编码SEQ ID NO:3所示的氨基酸序列的核苷酸序列。本发明为马铃薯抗晚疫病育种提供了重要的基因资源,克服马铃薯品种抗病性丧失问题,为马铃薯持久抗病提供新的保障。
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