公开(公告)号：CN104611425B

公开(公告)日：2017-08-08

申请号：CN201510021533.2

申请日：2015-01-15

Applicant: 中国农业大学

Inventor： 俞英 ,  冯文 ,  董易春 ,  王晓

IPC: C12Q1/68 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明涉及一种与中国荷斯坦奶牛金葡菌乳房炎抗性相关的SNP分子标记及其应用。所述分子标记来自奶牛TRAPPC9基因，其核苷酸序列如SEQ ID No.1所示，第165bp位点处的碱基为T或C。此处碱基为C的中国荷斯坦奶牛的金葡菌乳房炎抗性显著高于此处碱基为T的中国荷斯坦奶牛，而体细胞数前者显著低于后者。本发明还提供了用于检测所述SNP标记的引物及含有该引物的试剂盒。本发明还提供了所述SNP标记在鉴定金葡菌乳房炎抗性高的中国荷斯坦奶牛优势品系中的应用。本发明还提供了所述SNP标记在中国荷斯坦奶牛分子标记辅助育种中的应用。本发明的SNP标记为中国荷斯坦奶牛金葡菌乳房炎抗性的标记辅助选择提供了科学依据。

公开(公告)号：CN104611425A

公开(公告)日：2015-05-13

申请号：CN201510021533.2

申请日：2015-01-15

Applicant: 中国农业大学

Inventor： 俞英 ,  冯文 ,  董易春 ,  王晓

IPC: C12Q1/68 ,  C12N15/11

CPC classification number: C12Q1/6888 ,  C12Q2600/124 ,  C12Q2600/156

Abstract: 本发明涉及一种与中国荷斯坦奶牛金葡菌乳房炎抗性相关的SNP分子标记及其应用。所述分子标记来自奶牛TRAPPC9基因，其核苷酸序列如SEQ ID No.1所示，第165bp位点处的碱基为T或C。此处碱基为C的中国荷斯坦奶牛的金葡菌乳房炎抗性显著高于此处碱基为T的中国荷斯坦奶牛，而体细胞数前者显著低于后者。本发明还提供了用于检测所述SNP标记的引物及含有该引物的试剂盒。本发明还提供了所述SNP标记在鉴定金葡菌乳房炎抗性高的中国荷斯坦奶牛优势品系中的应用。本发明还提供了所述SNP标记在中国荷斯坦奶牛分子标记辅助育种中的应用。本发明的SNP标记为中国荷斯坦奶牛金葡菌乳房炎抗性的标记辅助选择提供了科学依据。

公开(公告)号：CN117500943B

公开(公告)日：2025-04-25

申请号：CN202280003541.2

申请日：2022-08-26

Applicant: 中国农业大学

Inventor： 刘剑锋 ,  刘振 ,  周磊 ,  黄千千 ,  冯文

IPC: C12Q1/6888 ,  C12N15/11

Abstract: 涉及分子生物学、功能基因组学、生物信息学、基因组育种技术领域，具体公开了一种用于北京黑猪基因分型的SNP分子标记组合、芯片及其制备方法与应用。涉及用于北京黑猪基因分型的SNP分子标记组合，由49,963个SNP分子标记组成，所述SNP分子标记的核苷酸序列分别如SEQ ID NO：1‑49,963所示。应用该分子标记组合可制备北京黑猪分子育种芯片，并可进一步应用于特异性鉴定北京黑猪与其他猪种(欧洲商业猪种、中国地方猪种)、目标性状QTL、关联位点及候选基因鉴定、亲缘关系鉴定和家系划分等方面。

公开(公告)号：CN110191965B

公开(公告)日：2022-05-27

申请号：CN201780002981.5

申请日：2017-12-13

Applicant: 中国农业大学

Inventor： 刘剑锋 ,  冯文 ,  杜恒 ,  赵鹏举

IPC: C12Q1/6888 ,  G16B20/20 ,  C40B40/06

Abstract: 本发明提供一种猪全基因组50K SNP芯片及应用，所述SNP分子标记主要来自于以下3类：第一类，根据已有文献报道的现有重要经济功能基因的显著位点筛选得来SNP位点；第二类，从国内外多个品种测序数据筛选出的多态性良好的SNP位点；第三类，来源于SNP数据库，3类探针共计包含50000个SNP位点。本发明提供的猪全基因组50K SNP芯片，可用于特异性鉴定欧洲猪与亚洲猪，进行全基因组选择育种，目标性状QTL、关联位点及候选基因鉴定，亲缘关系鉴定等方面。

公开(公告)号：CN117500943A

公开(公告)日：2024-02-02

申请号：CN202280003541.2

申请日：2022-08-26

Applicant: 中国农业大学

Inventor： 刘剑锋 ,  刘振 ,  周磊 ,  黄千千 ,  冯文

IPC: C12Q1/6888

Abstract: 涉及分子生物学、功能基因组学、生物信息学、基因组育种技术领域，具体公开了一种用于北京黑猪基因分型的SNP分子标记组合、芯片及其制备方法与应用。涉及用于北京黑猪基因分型的SNP分子标记组合，由49,963个SNP分子标记组成，所述SNP分子标记的核苷酸序列分别如SEQ ID NO：1‑49,963所示。应用该分子标记组合可制备北京黑猪分子育种芯片，并可进一步应用于特异性鉴定北京黑猪与其他猪种(欧洲商业猪种、中国地方猪种)、目标性状QTL、关联位点及候选基因鉴定、亲缘关系鉴定和家系划分等方面。

公开(公告)号：CN110191965A

公开(公告)日：2019-08-30

申请号：CN201780002981.5

申请日：2017-12-13

Applicant: 中国农业大学

Inventor： 刘剑锋 ,  冯文 ,  杜恒 ,  赵鹏举

IPC: C12Q1/6888 ,  G16B20/20 ,  C40B40/06

Abstract: 本发明提供一种猪全基因组50K SNP芯片及应用，所述SNP分子标记主要来自于以下3类：第一类，根据已有文献报道的现有重要经济功能基因的显著位点筛选得来SNP位点；第二类，从国内外多个品种测序数据筛选出的多态性良好的SNP位点；第三类，来源于SNP数据库，3类探针共计包含50000个SNP位点。本发明提供的猪全基因组50K SNP芯片，可用于特异性鉴定欧洲猪与亚洲猪，进行全基因组选择育种，目标性状QTL、关联位点及候选基因鉴定，亲缘关系鉴定等方面。