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公开(公告)号：CN105808976B
公开(公告)日：2018-02-27
申请号：CN201610120986.5
申请日：2016-03-03
Applicant: 中南大学
IPC: G06F19/20
Abstract: 本发明公开了一种基于推荐模型的miRNA靶基因预测方法(miRTRS)，利用已被实验验证过的miRNA靶基因数据构建miRNA与基因的二分图，并在此基础上，使用基于二分图的推荐算法来计算一个基因是miRNA靶基因的可能性，并在此推荐算法中引入了miRNA之间的序列相似性这一生物数据。最后通过推荐值降序排序，取其排名靠前的认为是miRNA靶基因关系。本发明简单易用，与已有的miRNA靶基因预测方法相比较，本发明提出的方法在预测的准确性、敏感度和特异性等方面都有明显提高，能为生物学家进行miRNA靶基因发现的实验和进一步研究提供有价值的参考信息。
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公开(公告)号：CN105808976A
公开(公告)日：2016-07-27
申请号：CN201610120986.5
申请日：2016-03-03
Applicant: 中南大学
IPC: G06F19/20
CPC classification number: G06F19/20
Abstract: 本发明公开了一种基于推荐模型的miRNA靶基因预测方法(miRTRS)，利用已被实验验证过的miRNA靶基因数据构建miRNA与基因的二分图，并在此基础上，使用基于二分图的推荐算法来计算一个基因是miRNA靶基因的可能性，并在此推荐算法中引入了miRNA之间的序列相似性这一生物数据。最后通过推荐值降序排序，取其排名靠前的认为是miRNA靶基因关系。本发明简单易用，与已有的miRNA靶基因预测方法相比较，本发明提出的方法在预测的准确性、敏感度和特异性等方面都有明显提高，能为生物学家进行miRNA靶基因发现的实验和进一步研究提供有价值的参考信息。
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公开(公告)号：CN107506591B
公开(公告)日：2020-06-02
申请号：CN201710748221.0
申请日：2017-08-28
Applicant: 中南大学
IPC: G16H70/40
Abstract: 本发明公开了一种基于多元信息融合和随机游走模型的药物重定位方法。通过集成已有的疾病数据、药物数据、靶标数据、疾病‑药物关联数据、疾病‑基因关联数据和药物‑靶标关联数据，构建疾病‑靶标‑药物异构网络。扩展基本的随机游走模型到所构建的异构网络上，通过有效的利用全局网络信息，为疾病推荐候选治疗药物。本发明简单有效，通过与其他方法比较，及在标准数据集上测试表明，该发明在药物重定位方面具有较好的预测性能。
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公开(公告)号：CN107506591A
公开(公告)日：2017-12-22
申请号：CN201710748221.0
申请日：2017-08-28
Applicant: 中南大学
IPC: G06F19/00
Abstract: 本发明公开了一种基于多元信息融合和随机游走模型的药物重定位方法。通过集成已有的疾病数据、药物数据、靶标数据、疾病-药物关联数据、疾病-基因关联数据和药物-靶标关联数据，构建疾病-靶标-药物异构网络。扩展基本的随机游走模型到所构建的异构网络上，通过有效的利用全局网络信息，为疾病推荐候选治疗药物。本发明简单有效，通过与其他方法比较，及在标准数据集上测试表明，该发明在药物重定位方面具有较好的预测性能。
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