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公开(公告)号：CN115762644A
公开(公告)日：2023-03-07
申请号：CN202211486117.6
申请日：2022-11-24
Applicant: 中南大学
Abstract: 本申请公开了一种口腔鳞状细胞癌生物标志物识别模型建立方法。该方法包括对OSCC肿瘤数据库的转录组数据进行处理和分析，分析挖掘OSCC转录组RNA差异表达因子；分析得到OSCC样本细胞丰度和差异表达因子间的免疫浸润关系；评价得到的差异表达因子对肿瘤发生发展机制的实际影响，筛选并保留与生存显著相关RNA因子，鉴定可作为OSCC的生物标志物。本发明提供了一种口腔鳞状细胞癌生物标志物识别模型建立方法，能够提高识别生物标志物的灵敏度和准确性。
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公开(公告)号：CN114400050B
公开(公告)日：2025-05-09
申请号：CN202210245595.1
申请日：2022-03-14
Applicant: 中南大学
Abstract: 本发明公开了一种DMR集合识别结果评估方法，包括对于每个预测的差异甲基化区域以区域内探针CpG位点为中心对CpG位点进行聚类；计算每个探针在实验组和对照组甲基化芯片数据上的平均甲基化水平差值；计算每个探针CpG位点与对应类中其他CpG位点的相关系数；计算每个差异甲基化区域在实验组和对照组甲基化芯片数据上的甲基化水平差异；计算每个待评估方法的评估指标完成DMR集合识别结果的评估。本发明还公开了一种实现所述DMR集合识别结果评估方法的评估系统，以及包括了所述DMR集合识别结果评估方法的选择方法。本发明无需匹配额外生物数据，能够为选择更优异的差异甲基化区域集合提供指导，客观性高、可靠性高且科学合理。
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公开(公告)号：CN114400050A
公开(公告)日：2022-04-26
申请号：CN202210245595.1
申请日：2022-03-14
Applicant: 中南大学
Abstract: 本发明公开了一种DMR集合识别结果评估方法，包括对于每个预测的差异甲基化区域以区域内探针CpG位点为中心对CpG位点进行聚类；计算每个探针在实验组和对照组甲基化芯片数据上的平均甲基化水平差值；计算每个探针CpG位点与对应类中其他CpG位点的相关系数；计算每个差异甲基化区域在实验组和对照组甲基化芯片数据上的甲基化水平差异；计算每个待评估方法的评估指标完成DMR集合识别结果的评估。本发明还公开了一种实现所述DMR集合识别结果评估方法的评估系统，以及包括了所述DMR集合识别结果评估方法的选择方法。本发明无需匹配额外生物数据，能够为选择更优异的差异甲基化区域集合提供指导，客观性高、可靠性高且科学合理。
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