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公开(公告)号:CN117726597A
公开(公告)日:2024-03-19
申请号:CN202311753000.4
申请日:2023-12-19
Applicant: 中信湘雅生殖与遗传专科医院有限公司
Abstract: 本申请涉及一种子宫内膜细胞定量模型的构建方法和子宫内膜细胞定量方法,构建方法包括:获取子宫内膜细胞集的单细胞表达数据,子宫内膜细胞集包括来自子宫内膜组织的基质细胞、上皮细胞、内皮细胞、T细胞、NK细胞、B细胞和髓性细胞;根据子宫内膜细胞集的单细胞表达数据确定目标细胞特征基因集以及目标细胞特征基因集中每个特征基因在目标细胞集中每种细胞的平均表达量;根据目标细胞特征集中每个特征基因在目标细胞集中每种细胞的平均表达量构建目标细胞定量模型。本申请利用不同类型子宫内膜细胞在单细胞水平的基因表达谱,筛选出子宫内膜细胞的特征基因组合,开发了一种利用转录组数据检测子宫内膜组织中不同类型子宫内膜细胞比例的方法。
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公开(公告)号:CN116333983A
公开(公告)日:2023-06-27
申请号:CN202310420848.9
申请日:2023-04-19
Applicant: 中信湘雅生殖与遗传专科医院有限公司
IPC: C12N5/078 , C12Q1/6883 , C12Q1/6869
Abstract: 本申请提供了一种外周血样本的培养方法及其应用,所外周血样本的培养方法包括如下步骤:获取待测样本的外周血;将所述外周血接种于培养基中,在所述培养基中添加植物血凝素,进行第一次培养;以及在所述培养基中加入丝裂霉素C,进行第二次培养。本申请的外周血样本的培养方法,将外周血接种于添加有植物血凝素的培养基中,植物血凝素能够刺激外周血中T细胞分裂增殖;再向培养基中添加一定浓度的DNA交联剂,能够诱导外周血中范可尼贫血相关基因的表达,有利于对基因进行RNA测序分析。
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公开(公告)号:CN117789827A
公开(公告)日:2024-03-29
申请号:CN202311856063.2
申请日:2023-12-28
Applicant: 中信湘雅生殖与遗传专科医院有限公司
Abstract: 本申请涉及一种检测转录RNA的方法和装置,方法包括:获取检测样本的RNA测序数据,检测样本包括添加NMD抑制剂的待测样本和若干个来自健康人的对照样本;根据检测样本的RNA测序数据获取检测样本中新剪接事件的支持reads数,并对新剪接事件的支持reads数进行归一化;根据检测样本中新剪接事件的支持reads数及其归一化值确定添加NMD抑制剂的待测样本中的新剪接事件是否为异常剪接事件。本申请利用添加NMD抑制剂后获得的RNA测序数据筛选异常剪接事件,可实现对以NMD途径降解的异常转录本进行检测,为DNA突变位点的致病性提供实验依据。
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