一种基于重叠混合测序的肿瘤突变负荷计算方法

    公开(公告)号:CN118711655A

    公开(公告)日:2024-09-27

    申请号:CN202410834053.7

    申请日:2024-06-26

    Applicant: 东南大学

    Inventor: 涂景 崔悦 乔祎

    Abstract: 本发明公开了一种基于重叠混合测序的肿瘤突变负荷计算方法;属于生物信息技术领域,可应用于大规模样本肿瘤突变负荷检测中,包括如下步骤:提取样本全基因组DNA;基于混合方案分别取样本DNA混合;对混合后的DNA进行文库构建并上机测序;对混合测序数据进行生物信息学分析,检测每个混合池的体细胞非同义突变;根据混合池变异检测结果和混合方案,重建每个样本的体细胞非同义突变情况;根据重构结果计算每个样本的肿瘤突变负荷数值;本发明解决了大规模并行建库带来的实验操作复杂、成本高昂、实施难度大的问题。

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