-
公开(公告)号：CN111681708A
公开(公告)日：2020-09-18
申请号：CN202010484597.7
申请日：2020-06-01
Applicant: 上海派森诺生物科技股份有限公司
Abstract: 本发明公开了一种基于perl语言快速自动化分析多个SNP位点的方法，包括如下步骤：步骤一：将多个测序结果进行汇总后对所述测序结果的测序质量进行过滤：根据QUAL文件里碱基质量值，保留Q值大于30的；步骤二：构建clustalw文件，利用clustalw软件把测序序列和参考基因序列聚类；步骤三：计算有效测序数及位点突变个数；根据clustalw文件，找出与参考序列相比有差异的碱基，Q值大于30的输出，Q值小于30判定无效；步骤四：进行分类，汇总数据：按照参考序列FASTA文件的名称，使用perl语言变量函数，分类汇总步骤三中输出的结果。本发明能够为市面上主流的基因检测、慢病和肿瘤等项目提供多个SNP位点筛查，提供了大大的帮助。
-
公开(公告)号：CN109517818A
公开(公告)日：2019-03-26
申请号：CN201811362549.X
申请日：2018-11-15
Applicant: 上海派森诺生物科技股份有限公司
IPC: C12N15/10 , C12Q1/6806
Abstract: 本发明公开了一种唾液、口腔拭子基因组DNA保护液，其特征在于，其特征在于，按1升的浓度计，包括如下组分：SDS(十二烷基硫酸钠)0.10～0.2％；NaCL 0.90％；Tris(三羟甲基氨基甲烷)5～15mM；EDTA 20～25mM；蛋白酶K 150-160mg。该唾液、口腔拭子保存液以SDS、Tris-HCl、EDTA、NaCl和蛋白酶K为主要成分，可用于唾液保存。NaCl可以维持细胞渗透压，SDS表面活性剂在蛋白酶K作用下可以破坏蛋白成分抑制细菌的滋生，容易引起DNA的降解；Tris-HCl、EDTA可以保护游离DNA。本发明的DNA保存液是一种针对口腔拭子保存的保存液，其可以较好的保存口腔细胞；其更加卫生，不易滋生细菌；且保存时间长比信封长3-5倍；制备方法简单，具有较好的社会价值。
-
公开(公告)号：CN111019940A
公开(公告)日：2020-04-17
申请号：CN201911356963.4
申请日：2019-12-25
Applicant: 上海派森诺生物科技股份有限公司
IPC: C12N15/10
Abstract: 本发明公开了一种直接提取全血基因组DNA的提取液，其特征在于，包括裂解液、第一漂洗液、第二漂洗液，Proteinase K。本发明还公开了使用所述提取液的提取方法。本发明的有益效果在于：本方法主要可以直接从人、哺乳动物及禽类全血中快速提取基因组DNA，本方法样本无需预处理无需先去除红细胞，孵化好的样本缓冲液无需混合胍盐、酒精，可直接过硅胶吸附柱、磁珠吸附等，整个过程无须苯酚和氯仿抽提，无须异丙醇或乙醇沉淀，抽提出的DNA可直接用于PCR、酶切、杂交等分子生物学下游相关实验。本发明的方法针对性强，操作方便快速，且通量高，可以使用单个硅胶吸附柱、96孔硅胶吸附柱和磁珠，且硅胶柱回收基因组纯更高可直接用于二代测序。
-
Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN109722485A
公开(公告)日：2019-05-07
申请号：CN201811386212.2
申请日：2018-11-20
Applicant: 上海派森诺生物科技股份有限公司
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/6869
Abstract: 本发明公开了一种基于sanger测序快速鉴定人体真菌的方法，其特征在于，包括DNA提取和质检步骤、引物设计和合成步骤、PCR扩增步骤、PCR产物纯化步骤、PCR产物纯化步骤、测序步骤、数据处理步骤。本发明的有益效果在于：可以通过特异的引物把具体的物种的基因序列扩增出来，并通过测序验证比对，一一对应，准确率几乎接近百分之百。而且只需要提取一定的菌落提取DNA后保存，避免了在培养过程中产生交叉污染，导致误判。本方法相比其他方法，方便、快捷、准确性高。
-
公开(公告)号：CN109439651A
公开(公告)日：2019-03-08
申请号：CN201811362548.5
申请日：2018-11-15
Applicant: 上海派森诺生物科技股份有限公司
IPC: C12N15/10
Abstract: 本发明公开了一种批量板式硅胶吸附柱提取血液基因组DNA的方法，其特征在于，包括血液预处理步骤和基因组DNA提取步骤。本发明的有益效果在于：本方法主要用于从人或哺乳动物血液中提取基因组DNA，抽提出的DNA可直接用于PCR、酶切等分子生物学相关实验。本发明的方法针对性强，操作方便简洁，通量高，且硅胶柱回收基因组DNA效率高、纯度高。
-
公开(公告)号：CN109439651B
公开(公告)日：2022-07-12
申请号：CN201811362548.5
申请日：2018-11-15
Applicant: 上海派森诺生物科技股份有限公司
IPC: C12N15/10
Abstract: 本发明公开了一种批量板式硅胶吸附柱提取血液基因组DNA的方法，其特征在于，包括血液预处理步骤和基因组DNA提取步骤。本发明的有益效果在于：本方法主要用于从人或哺乳动物血液中提取基因组DNA，抽提出的DNA可直接用于PCR、酶切等分子生物学相关实验。本发明的方法针对性强，操作方便简洁，通量高，且硅胶柱回收基因组DNA效率高、纯度高。
-
公开(公告)号：CN111816254A
公开(公告)日：2020-10-23
申请号：CN202010485310.2
申请日：2020-06-01
Applicant: 上海派森诺生物科技股份有限公司
IPC: G16B20/30
Abstract: 本发明公开了一种基于perl语言快速批量去除载体序列的方法，包括如下步骤：步骤一：使用测序结果文本格式的文件或将测序峰图文件使用Chromas软件进行格式转换；步骤二：通过定位匹配载体插入位点两端序列，对所述载体序列进行特异性去除；通过脚本里设置好的载体插入位点两端序列和测序结果里的序列进行比对匹配；步骤三：过滤不合格的测序结果；通过脚本里设置好的载体插入位点两端序列和测序结果里的序列进行比对匹配，无完全匹配或匹配小于7个以上碱基，默认不合格序列，不输出；步骤四：输出无载体序列结果，根据所述载体插入位点两端序列的方向性调整输出结果。本发明的方法可以一次性去除多个序列，不限制单次处理数据量的个数。
-
公开(公告)号：CN111139235A
公开(公告)日：2020-05-12
申请号：CN201911356984.6
申请日：2019-12-25
Applicant: 上海派森诺生物科技股份有限公司
IPC: C12N15/10
Abstract: 本发明公开了一种唾液、口腔拭子基因组DNA保护液，其特征在于，按每升的浓度计，包括如下组分：SDS(十二烷基硫酸钠)5％～6％；NaCL 4M～5M；Tris(三羟甲基氨基甲烷)0.15M～0.2M；EDTA 0.5M～0.6M；Proteinase K1020mg/mL～20mg/mL。本发明还公开了利用所述保护液的提取方法。本方法样本无需预处理可直接操作，孵化好的样本缓冲液无需混合胍盐，可直接过硅胶吸附柱、磁珠吸附等，整个过程无须苯酚和氯仿抽提，无须异丙醇或乙醇沉淀，抽提出的DNA可直接用于PCR、酶切、杂交等分子生物学下游相关实验。
-
-
-
-
-
-
-
Search Results
8
records
(took 0.034 seconds)
