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公开(公告)号：CN113808669A
公开(公告)日：2021-12-17
申请号：CN202111145721.8
申请日：2021-09-28
Applicant: 上海大学
IPC: G16B30/20
Abstract: 本发明公开了一种宏基因组序列组装方法。在获取测序后待组装的微生物宏基因组序列片段后，区别于传统直接进行组装的方式，先对序列片段进行聚类，将来自同一基因组的所述序列片段归为一类，得到分类簇；再对聚类得到分类簇进行组装，可有效地降低宏基因组数据总体组装的复杂度。此外，为了克服新一代测序技术产生的海量序列数据导致组装方法效率低的问题，所述聚类算法基于并分布式平台并行进行，有效缓解了单台计算机内存和计算资源的不足，在海量复杂宏基因组序列数据下仍然可以实现快速和准确的基因组装。
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