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公开(公告)号:CN106319079B
公开(公告)日:2019-12-10
申请号:CN201610945868.8
申请日:2016-10-26
Applicant: 上海交通大学医学院附属上海儿童医学中心
IPC: C12Q1/6858 , C12N15/11
Abstract: 本发明涉及一种利用限量dNTP竞争性PCR结合HRM技术检测22q11.2拷贝数缺失的方法,其包括检测CLTCL1、SNAP29、KLHL22、PI4KA和CFTR基因的步骤。本发明还提供该方法涉及的引物组合、试剂盒。其优点表现在:操作简便快捷,仅包括PCR反应及后续HRM分析过程,减短了检测周期;实现了闭管操作,由于在PCR反应中已加入荧光染料,检测片段扩增完成后不再需要其他处理,即可进行HRM曲线分析,有效避免污染;反应中仅需要常规PCR反应试剂及少量荧光染料,不需要特殊的检测及分析仪器;对99例患者及正常人对照样本进行检测,灵敏性与特异性均达到100%,体系的稳定性和准确性得到证实。
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公开(公告)号:CN106636337A
公开(公告)日:2017-05-10
申请号:CN201610890220.5
申请日:2016-10-12
Applicant: 上海交通大学医学院附属上海儿童医学中心
Abstract: 本发明涉及一种基于多重HRM分析的氯吡格雷耐药基因检测方法,所述的方法的引物如SEQ ID NO:1~10所示。本发明还提供HRM分析涉及的引物组合、试剂盒。其优点表现在:本发明建立了一种针对多个SNP位点的HRM分型的方法,可以在同一个反应体系中检测rs4244285、rs4986893、rs12248560三个位点,和/或rs1045642、rs662两个位点,减少了试剂用量,缩短了检测时间。使用本发明的方法对经皮冠状动脉介入造影手术的病人的样本进行检测,并用Sanger测序方法进行验证,准确率高。
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公开(公告)号:CN106319079A
公开(公告)日:2017-01-11
申请号:CN201610945868.8
申请日:2016-10-26
Applicant: 上海交通大学医学院附属上海儿童医学中心
Abstract: 本发明涉及一种利用限量dNTP竞争性PCR结合HRM技术检测22q11.2拷贝数缺失的方法,其包括检测CLTCL1、SNAP29、KLHL22、PI4KA和CFTR基因的步骤。本发明还提供该方法涉及的引物组合、试剂盒。其优点表现在:操作简便快捷,仅包括PCR反应及后续HRM分析过程,减短了检测周期;实现了闭管操作,由于在PCR反应中已加入荧光染料,检测片段扩增完成后不再需要其他处理,即可进行HRM曲线分析,有效避免污染;反应中仅需要常规PCR反应试剂及少量荧光染料,不需要特殊的检测及分析仪器;对99例患者及正常人对照样本进行检测,灵敏性与特异性均达到100%,体系的稳定性和准确性得到证实。
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公开(公告)号:CN106967837A
公开(公告)日:2017-07-21
申请号:CN201710374691.5
申请日:2017-05-24
Applicant: 上海交通大学医学院附属上海儿童医学中心
CPC classification number: C12Q1/6883 , C12Q1/686 , C12Q2600/156 , C12Q2527/107 , C12Q2537/143 , C12Q2563/107
Abstract: 本发明涉及一种基于限量dNTP竞争性PCR和HRM检测7q11.23缺失的方法,所述的方法以CFTR基因为参考基因,检测BAZ1B、CLIP2、ELN和LIMK1基因拷贝数。本发明还提供该方法涉及的引物组合、试剂盒等。其优点表现在:可在同一个反应条件下进行,可在一个PCR仪上同时检测,从PCR扩增到HRM检测仅需79min,缩短了检测周期。PCR扩增后不需要进行开管操作,减少了操作步骤和可能出现的污染。本发明选择了合适的基因,设计了恰当的引物序列,PCR反应体系和程序设置合理。本发明的方法具有很高的准确率,在7q11.23微缺失检测及大规模人群筛查中具有极大优势。
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公开(公告)号:CN106636337B
公开(公告)日:2020-05-01
申请号:CN201610890220.5
申请日:2016-10-12
Applicant: 上海交通大学医学院附属上海儿童医学中心
IPC: C12Q1/6883 , C12N15/11
Abstract: 本发明涉及一种基于多重HRM分析的氯吡格雷耐药基因检测方法,所述的方法的引物如SEQ ID NO:1~10所示。本发明还提供HRM分析涉及的引物组合、试剂盒。其优点表现在:本发明建立了一种针对多个SNP位点的HRM分型的方法,可以在同一个反应体系中检测rs4244285、rs4986893、rs12248560三个位点,和/或rs1045642、rs662两个位点,减少了试剂用量,缩短了检测时间。使用本发明的方法对经皮冠状动脉介入造影手术的病人的样本进行检测,并用Sanger测序方法进行验证,准确率高。
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