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公开(公告)号:CN113073123A
公开(公告)日:2021-07-06
申请号:CN202110330327.5
申请日:2021-03-29
Applicant: 上海交通大学
IPC: C12P19/04 , C12P1/00 , C12N9/02 , C07D221/18
Abstract: 一种双酚介体的漆酶氧化木质素能力方法,通过分子设计技术将双酚化学结构引入介体与漆酶构建的漆酶介体体系(LMS),随后测试其介体性能。本发明提出含有2,2’‑联苯酚结构的天然化合物作为漆酶介体,成功在天然产物代谢产物库中挖掘到一种目标天然双酚介体,并证明了其介体性质,且应用于木质素模型物和磺酸木质素的催化氧化。
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公开(公告)号:CN105836896B
公开(公告)日:2018-09-21
申请号:CN201510021636.9
申请日:2015-01-16
Applicant: 上海交通大学
IPC: C02F3/34 , C02F101/30
Abstract: 一种生物环境治理领域的用于处理水中有机污染物的固定化漆酶的制备方法,通过向海藻酸钠溶液中加入漆酶和作为介体的血红蛋白混合后滴入CuSO4溶液中反应得到沉淀即固定化漆酶。本发明将血红蛋白作为蛋白质介体与漆酶共同固定于海藻酸铜载体上,可以提高漆酶的活性,同时处理水中有机物污染物的水平也得到了提升。本发明针对水样中污染物的处理浓度为0.1mM,可以运用于污染地区水样的处理。
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公开(公告)号:CN102789551B
公开(公告)日:2015-02-18
申请号:CN201110125025.0
申请日:2011-05-16
Applicant: 中国科学院上海生命科学研究院 , 上海生物信息技术研究中心 , 上海交通大学
IPC: G06F19/18
Abstract: 本发明公开了用图形处理单元加速元基因组的物种分析的方法和系统,在保持和现有Phymm系统相似准确性的同时,可以比现有的Phymm系统快至少两个数量级。其技术方案为:方法包括:从训练集中预先构建k阶马尔科夫模型;将构建好的k阶马尔科夫模型载入到图形处理单元中;将待分类的序列转换为寡核苷酸频数向量;将寡核苷酸频数向量载入到图形处理单元中;在图形处理单元中计算序列和每一个已知基因组的相似性分数;将这些相似性分数送回主内存;处理器用这些相似性分数最小的基因组的物种信息注释序列。
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公开(公告)号:CN112694510A
公开(公告)日:2021-04-23
申请号:CN202110068128.1
申请日:2021-01-19
Applicant: 上海交通大学
Abstract: 一种抗衰老和抗氧化的天然核酸化合物,其化学结构式:该结构式包括磷酸骨架上一个非桥接氧替换成硫;将该化合物和食物一起喂养线虫,可明显提高线虫寿命以及抗氧化能力,该化合物可用于治疗或预防衰老、治疗或预防氧化胁迫相关疾病。本发明提取纯化过程简单,可短时间内大量获得且比较稳定,抗氧化和抗衰老效果良好,喂食线虫后显著延长寿命和提高活力并增强了线虫对外界的急性氧化胁迫的抵抗作用,可作为氧化损伤相关疾病治疗和预防的药物,也可应用于保健品中,具有良好的应用前景。
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公开(公告)号:CN105836896A
公开(公告)日:2016-08-10
申请号:CN201510021636.9
申请日:2015-01-16
Applicant: 上海交通大学
IPC: C02F3/34 , C02F101/30
Abstract: 一种生物环境治理领域的用于处理水中有机污染物的固定化漆酶的制备方法,通过向海藻酸钠溶液中加入漆酶和作为介体的血红蛋白混合后滴入CuSO4溶液中反应得到沉淀即固定化漆酶。本发明将血红蛋白作为蛋白质介体与漆酶共同固定于海藻酸铜载体上,可以提高漆酶的活性,同时处理水中有机物污染物的水平也得到了提升。本发明针对水样中污染物的处理浓度为0.1mM,可以运用于污染地区水样的处理。
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公开(公告)号:CN112694510B
公开(公告)日:2022-10-14
申请号:CN202110068128.1
申请日:2021-01-19
Applicant: 上海交通大学
Abstract: 一种抗衰老和抗氧化的天然核酸化合物,其化学结构式:该结构式包括磷酸骨架上一个非桥接氧替换成硫;将该化合物和食物一起喂养线虫,可明显提高线虫寿命以及抗氧化能力,该化合物可用于治疗或预防衰老、治疗或预防氧化胁迫相关疾病。本发明提取纯化过程简单,可短时间内大量获得且比较稳定,抗氧化和抗衰老效果良好,喂食线虫后显著延长寿命和提高活力并增强了线虫对外界的急性氧化胁迫的抵抗作用,可作为氧化损伤相关疾病治疗和预防的药物,也可应用于保健品中,具有良好的应用前景。
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公开(公告)号:CN107686169A
公开(公告)日:2018-02-13
申请号:CN201710768246.7
申请日:2017-08-31
Applicant: 上海交通大学
IPC: C02F3/34 , G01N33/18 , C02F101/34
CPC classification number: C02F3/342 , C02F2101/345 , C02F2305/06 , G01N33/18
Abstract: 一种蛋白质介体-漆酶体系降解双酚A的方法,通过构建漆酶-血红蛋白复合酶体系,在常温下对水体中双酚A进行降解,并通过光学方法检测降解效果。本发明利用血红蛋白(Hemoglobin,Hb)提升漆酶活性,有效降低了漆酶的投入,提高生物降解双酚A的反应速率,克服了传统介体存在潜在毒性的二次污染威胁,具有良好的环境保护效果。
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公开(公告)号:CN113073123B
公开(公告)日:2022-11-11
申请号:CN202110330327.5
申请日:2021-03-29
Applicant: 上海交通大学
IPC: C12P19/04 , C12P1/00 , C12N9/02 , C07D221/18
Abstract: 一种双酚介体的漆酶氧化木质素能力方法,通过分子设计技术将双酚化学结构引入介体与漆酶构建的漆酶介体体系(LMS),随后测试其介体性能。本发明提出含有2,2’‑联苯酚结构的天然化合物作为漆酶介体,成功在天然产物代谢产物库中挖掘到一种目标天然双酚介体,并证明了其介体性质,且应用于木质素模型物和磺酸木质素的催化氧化。
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公开(公告)号:CN104021265B
公开(公告)日:2017-02-22
申请号:CN201310066685.5
申请日:2013-03-01
Applicant: 上海交通大学
IPC: G06F19/00
Abstract: 一种化学与分子结构信息技术领域的复杂体系反应通路计算系统及其实现方法,该系统包括:分子模拟与量子化学计算模块、分子构象搜索模块和精确计算与应用模块。通过构建分子结构简化的模式反应体系与解析特征反应路径;并搜寻目标反应体系的反应相关关键结构,含基态、过渡态。本发明由模式体系中低维度的特征势能面出发,建立反应网络通路,并记录网络中势能面局部极小值点与鞍点的反应坐标,并基于反应坐标信息指导,实现由模式体系(简单)还原为目标体系(复杂)的分子接枝。通过分子构象搜索技术在特征坐标束缚的条件下,搜寻目标体系反应物的构象集合,并对构象集中的分子进行结构优化,并根据特征坐标在反应路径上的反应特性收集有效的反应物基态与过渡态分子结构。
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公开(公告)号:CN104021265A
公开(公告)日:2014-09-03
申请号:CN201310066685.5
申请日:2013-03-01
Applicant: 上海交通大学
IPC: G06F19/00
Abstract: 一种化学与分子结构信息技术领域的复杂体系反应通路计算系统及其实现方法,该系统包括:分子模拟与量子化学计算模块、分子构象搜索模块和精确计算与应用模块。通过构建分子结构简化的模式反应体系与解析特征反应路径;并搜寻目标反应体系的反应相关关键结构,含基态、过渡态。本发明由模式体系中低维度的特征势能面出发,建立反应网络通路,并记录网络中势能面局部极小值点与鞍点的反应坐标,并基于反应坐标信息指导,实现由模式体系(简单)还原为目标体系(复杂)的分子接枝。通过分子构象搜索技术在特征坐标束缚的条件下,搜寻目标体系反应物的构象集合,并对构象集中的分子进行结构优化,并根据特征坐标在反应路径上的反应特性收集有效的反应物基态与过渡态分子结构。
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