公开(公告)号：CN104021265B

公开(公告)日：2017-02-22

申请号：CN201310066685.5

申请日：2013-03-01

Applicant: 上海交通大学

Inventor： 赵一雷 ,  徐真昊 ,  齐艳兵

IPC: G06F19/00

Abstract: 一种化学与分子结构信息技术领域的复杂体系反应通路计算系统及其实现方法，该系统包括：分子模拟与量子化学计算模块、分子构象搜索模块和精确计算与应用模块。通过构建分子结构简化的模式反应体系与解析特征反应路径；并搜寻目标反应体系的反应相关关键结构，含基态、过渡态。本发明由模式体系中低维度的特征势能面出发，建立反应网络通路，并记录网络中势能面局部极小值点与鞍点的反应坐标，并基于反应坐标信息指导，实现由模式体系（简单）还原为目标体系（复杂）的分子接枝。通过分子构象搜索技术在特征坐标束缚的条件下，搜寻目标体系反应物的构象集合，并对构象集中的分子进行结构优化，并根据特征坐标在反应路径上的反应特性收集有效的反应物基态与过渡态分子结构。

公开(公告)号：CN104021265A

公开(公告)日：2014-09-03

申请号：CN201310066685.5

申请日：2013-03-01

Applicant: 上海交通大学

Inventor： 赵一雷 ,  徐真昊 ,  齐艳兵

IPC: G06F19/00

Abstract: 一种化学与分子结构信息技术领域的复杂体系反应通路计算系统及其实现方法，该系统包括：分子模拟与量子化学计算模块、分子构象搜索模块和精确计算与应用模块。通过构建分子结构简化的模式反应体系与解析特征反应路径；并搜寻目标反应体系的反应相关关键结构，含基态、过渡态。本发明由模式体系中低维度的特征势能面出发，建立反应网络通路，并记录网络中势能面局部极小值点与鞍点的反应坐标，并基于反应坐标信息指导，实现由模式体系（简单）还原为目标体系（复杂）的分子接枝。通过分子构象搜索技术在特征坐标束缚的条件下，搜寻目标体系反应物的构象集合，并对构象集中的分子进行结构优化，并根据特征坐标在反应路径上的反应特性收集有效的反应物基态与过渡态分子结构。