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公开(公告)号：CN114999587A
公开(公告)日：2022-09-02
申请号：CN202210691742.8
申请日：2022-06-17
Applicant: 上海交通大学
Abstract: 本发明公开了一种基于随机搜索算法和对接评估的蛋白质多肽设计集成装置，涉及蛋白质多肽设计领域，包括集成结构预测模块和集成对接模块，其中集成结构预测模块用于生成多肽序列的预测三维结构，集成对接模块用于生成多肽序列，并将多肽序列的预测三维结构与目标蛋白的三维结构对接，计算三维结构中多肽与目标蛋白的相互作用的参数，基于定义的评分评价通过随机搜索算法选取优化的多肽序列。本发明的装置将差异进化与对接评估相结合，可以实现基于结构互补性的次肽突破优化过程，能够快速有效、多样性、高通量、低成本、简单方便地进行蛋白质多肽设计。
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