公开(公告)号：CN115165829A

公开(公告)日：2022-10-11

申请号：CN202210758376.3

申请日：2022-06-29

Applicant: 上海交通大学

Inventor： 丁显廷 ,  童蕾 ,  陈晓翔 ,  沈易鞍 ,  杨天奇

IPC: G01N21/64 ,  G01N21/01 ,  G01N33/569 ,  G01N33/532

Abstract: 本发明公开了一种定量分析系统性红斑狼疮免疫细胞与功能蛋白丰度的方法，包括荧光流式实验、用于CyTOF检测的样本收集和预处理、用于CyTOF分析的抗体标记和细胞染色、样本用于CyTOF检测和数据处理和统计学分析。本发明首次对处于不同疾病活动性的aSLE和rSLE进行系统的PBMC中的免疫细胞亚群的表型和功能进行描述，发现了一个可以潜在的作为细胞预后相关的多参数的综合的生物标志物Tem样的CD8+CD27+CXCR3‑T细胞、CD27蛋白和疾病预后功能相关。

公开(公告)号：CN115029409A

公开(公告)日：2022-09-09

申请号：CN202210758375.9

申请日：2022-06-29

Applicant: 上海交通大学

Inventor： 丁显廷 ,  童蕾 ,  陈晓翔 ,  杨天奇 ,  沈易鞍

IPC: C12Q1/02 ,  C12N5/078 ,  G01N27/62 ,  G01N15/14 ,  G16B40/00

Abstract: 本发明公开了一种针对系统性红斑狼疮的细胞表型检测方法，包括收集全血样本，提取PBMCs，细胞计数后，加入培养板中，进行IL‑2体外刺激实验，对刺激后的PBMCs样本采用双重编码，进行质谱流式检测，统计学分析。本发明的有益技术效果在于：从不同角度阐释了IL‑2作为治疗药物对SLE免疫系统的影响，并且发现Tem样的CD8+CD27+CXCR3‑T对IL‑2治疗会发生响应，尤其是自噬相关的Atg7,Atg5的表达被抑制，该细胞亚群的自噬活性可能为潜在的临床给药方案提供一定的建议。

公开(公告)号：CN114999587A

公开(公告)日：2022-09-02

申请号：CN202210691742.8

申请日：2022-06-17

Applicant: 上海交通大学

Inventor： 丁显廷 ,  杰西卡 ,  贝哈法里德 ,  沈易鞍 ,  杨天奇

IPC: G16C20/50 ,  G16C20/30 ,  G16C20/40 ,  G16C20/70 ,  G06N3/12

Abstract: 本发明公开了一种基于随机搜索算法和对接评估的蛋白质多肽设计集成装置，涉及蛋白质多肽设计领域，包括集成结构预测模块和集成对接模块，其中集成结构预测模块用于生成多肽序列的预测三维结构，集成对接模块用于生成多肽序列，并将多肽序列的预测三维结构与目标蛋白的三维结构对接，计算三维结构中多肽与目标蛋白的相互作用的参数，基于定义的评分评价通过随机搜索算法选取优化的多肽序列。本发明的装置将差异进化与对接评估相结合，可以实现基于结构互补性的次肽突破优化过程，能够快速有效、多样性、高通量、低成本、简单方便地进行蛋白质多肽设计。