公开(公告)号：CN119541616A

公开(公告)日：2025-02-28

申请号：CN202411682008.0

申请日：2024-11-21

Applicant: 上海交通大学

Inventor： 戴哲泽 ,  谢晓冬 ,  李茜 ,  樊春海

IPC: G16B15/00 ,  G16C60/00 ,  G06T3/4053 ,  G06T7/13 ,  G06T7/60

Abstract: 本申请涉及生物技术领域，公开了一种对核酸纳米结构进行性质分析的方法及装置，包括获取核酸纳米结构的单分子定位成像数据，进行预处理得到核酸纳米结构的空间信息和时间信息；根据空间信息确定核酸纳米结构的轮廓曲线，轮廓曲线被分成多条链段，通过链段两端的端点的空间坐标计算得到链段长度L，通过距离为L的两个端点的单位向量计算得到角度相关性cosθ(L)；通过链段长度L和当链段长度为L时的角度相关性的平均值 的关系计算得到核酸纳米结构的持续长度P，确定对结构刚性的定量分析；确定对位点可及性的定量分析，以及进行结构刚性与位点可及性的相关性分析。本发明提供了对核酸纳米结构的结构刚性和/或位点可及性的精确的定量评估。

公开(公告)号：CN118549395A

公开(公告)日：2024-08-27

申请号：CN202410633649.0

申请日：2024-05-21

Applicant: 上海交通大学

Inventor： 樊春海 ,  李茜 ,  谢晓冬 ,  葛志磊 ,  徐丽凤 ,  高兆帅 ,  刘致远

IPC: G01N21/64 ,  C12Q1/68

Abstract: 本发明公开一种基于DNA纳米机器的活细胞囊泡酸化过程可视化方法及其应用，所述方法包括以下步骤：S1：构建一种DNA纳米机器：其包括：细胞囊泡靶向模块、pH驱动模块、信号报告模块；S2：体外验证所述DNA纳米机器的合成以及pH可驱动性；S3：使用所述DNA纳米机器孵育细胞，完成对细胞囊泡酸化的原位可视化。该DNA纳米机器能够通过细胞内吞作用靶向细胞内囊泡，并通过纳米结构形变的方式将活细胞囊泡的pH信息特异性转换为FRET信号，从而完成细胞囊泡酸化过程的可视化，实现对细胞囊泡酸化过程精确的特异性原位成像，在细胞成像领域具有良好的应用前景。

公开(公告)号：CN117538300A

公开(公告)日：2024-02-09

申请号：CN202311485164.3

申请日：2023-11-08

Applicant: 上海交通大学

Inventor： 樊春海 ,  沈建磊 ,  李茜 ,  李聪 ,  谢晓冬

IPC: G01N21/64 ,  G01Q60/24

Abstract: 本发明公开了利用静态准分子聚集体自发闪烁的超快超分辨率成像，其中自发闪烁型静态准分子聚集体包括DNA纳米结构和苯并噻唑菁染料，其中DNA纳米结构和苯并噻唑菁染料形成复合结构，所述复合结构是静态准分子聚集体。本发明可以解决现有单分子定位显微镜的图像采集时间长等问题。